![cover image](https://wikiwandv2-19431.kxcdn.com/_next/image?url=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c2/Kalzium_2.4_in_Edubuntu_12.04_ru.png/640px-Kalzium_2.4_in_Edubuntu_12.04_ru.png&w=640&q=50)
Молекулярный редактор
Материал из Википедии — свободной encyclopedia
Молекуля́рный реда́ктор — специализированная компьютерная программа, позволяющая вводить, редактировать и выводить на внешние носители информации (на бумагу, на экран) информацию о составе и структуре молекул веществ.
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c2/Kalzium_2.4_in_Edubuntu_12.04_ru.png/640px-Kalzium_2.4_in_Edubuntu_12.04_ru.png)
Для работы с химическими документами в большинстве случаев невозможно использовать только текстовые или графические редакторы общего назначения. Редактирование текстов, содержащих химическую информацию, требует использования специализированных программных инструментов.
Общий подход к созданию интерфейса химических редакторов заключается в том, что химические формулы собираются по принципу конструктора из структурных элементов (ароматические кольца, символы химической связи, стрелки и т.п.). Формула и отдельные её фрагменты могут быть модифицированы (вставка необходимых символов, изменение размера или ориентации на плоскости).
Как правило, химические редакторы снабжаются комплектами заготовок сложных формул и рисунков(шаблонов), наиболее часто употребляемых в работе (аминокислоты, пептиды, углеводы, стереоизомеры, нуклеотиды, лабораторное оборудование). Многие снабжены модулями по именованию соединений в соответствии с номенклатурой.
Химические редакторы позволяют выполнять следующие функции:
- создавать на экране химические структурные формулы, схемы реакций, лабораторные установки;
- конструировать объемные молекулярные модели и выполнять манипуляции с ними (увеличение или уменьшение моделей, вращение и перемещение их и т.д.);
- рассчитывать энергетические и пространственные параметры системы (распределение электронной плотности, энергию и длину связей, валентные углы и т.п.);
- рассчитывать энергию молекулы в стационарном и возбужденных состояниях на основе классической механической модели осциллирующих атомов;
- рассчитывать другие молекулярные характеристики и вероятность пути прохождения химических реакций.
Программа | ОС | Лицензия |
---|---|---|
ChemDraw | Windows, Mac OS | Проприетарная |
ACD/ChemSketch[1] | Windows(64-bit) | Проприетарная |
XDrawChem[2] | Кроссплатформенный | GPL |
BKchem[3] | Кроссплатформенный | GPL |
JChemPaint | Кроссплатформенный | LGPL |
Jmol | Кроссплатформенный | LGPL |
Avogadro | GPL |