В доисламские времена город был одним из местных центров сельского хозяйства и торговли. Служил в качестве промежуточной станции между Багдадом и Хорасаном на средневековом Шелкового Пути. Во время халифата Аббасидов город был известен своими финиками и фруктовыми садами.
В настоящее время известен как центр выращивания апельсинов.
Город был использован в качестве лагеря для ассирийских беженцев, спасающихся от геноцида[2]. Лагерь беженцев был создан за пределами города и вмещал от 40 000 до 50 000 человек[3].
В ходе возглавляемой США оккупации Ирака Баакуба стала местом тяжелых боев с партизанами, наряду с суннитскими анклавами Фаллуджа и Рамади.
8-13 апреля 2004 года: в рамках шиитского восстания Армия Махди попыталась взять город. Американские танки начали патрулировать улицы, а артиллерия и ВВС коалиционных сил провели обстрелы позиций боевиков за чертой города.
17-19 июня 2004 года: отряд из примерно 200 боевиков атаковали американский патруль в пригороде Баакубы Бурхиз. Бои шли в течение трех дней подряд, разгораясь в светлое время суток и угасая ночью.
24 июня2004 года: в последний день восстания шиитские повстанцы ночью атаковали американский механизированный взвод пехоты, патрулировавший окраину города. Под огнём противника взвод отступил на юг, где попал в засаду и продолжил движение на восток, в сторону моста через реку Дияла, расположенной примерно в центре города. При подходе к центру города патрульные получили подкрепление и начали контрнаступление. Город фактически оказался поделен на два сектора с рекой Дияла в качестве разделительной преграды: западная часть контролировалась американцами, восточная — повстанцами. При поддержке танкового взвода и авиации, сбросившей в 8-00 утра две 500-фунтовые бомбы на выявленные вражеские позиции (одну — на стадион, вторую — в непосредственной близости от кампуса университета) американские войска перешли в наступление. Бои достигли своего пика примерно к 10-00 по местному времени, отдельные стычки продолжались до заката. Ответственность за нападение взял на себя лидер организации Джамаат ат-Таухид валь-ДжихадАбу Мусаб аз-Заркави.
15 ноября2004 года: в то время как коалиционные силы сражались с повстанцами в Фаллудже, мелкие группы боевиков воспользовались ситуацией и провели скоординированные атаки на город и его окрестности, в частности на полицейские участки в Бухризе и Муффреке. Рано утром, сразу после восхода солнца, повстанцы попытались уничтожить один из двух основных мостов через реку Дияла. На опорах моста были размещены заряды, но их мощность оказалась недостаточной, и мост устоял. В течение дня инженеры армии США провели экстренный ремонт моста, который позволил танкам проследовать по нему. Сразу же после неудачи диверсии повстанцы отступили, а американские войска начали прочесывание города на случай обустройства повстанцами засад, однако их не обнаружили.
26 июня2006 года: по крайней мере 25 человек погибли в результате взрыва заминированного велосипеда в городе.
26 октября2006 года: повстанцы устроили засаду на полицейский патруль, убив 24 полицейских и одного гражданского. Восемь боевиков были убиты в последующем бою с полицией и войсками США.
29 ноября2006 года: стычки между полицией и боевиками после нападения на штаб-квартиру полиции приводит к «закрытию» города: закрыт университет, школы и большинство магазинов, введен комендантский час. По крайней мере 55 боевиков были убиты в столкновениях.
К концу 2006 года Баакуба и значительная часть провинции Дияла перешла под контроль суннитских повстанцев[5]. 2 декабря2006 года: США и иракские силы безопасности начинают наступление на город в ответ на бои, которые шли в городе в течение недели между суннитскими повстанцами и полицией.
3 января2007 года иракское правительство в Баакубе пало, оставив город в руках повстанцев, боровшихся против американского присутствия в Ираке. В январе 2007 года было сообщено, что суннитские повстанцы смогли похитить мэра города и взорвать его офис, несмотря на уверения американских и иракских военных чиновников, что ситуация в городе «обнадеживает и находится под контролем»[6]. В феврале 2007 года город превратился в «город-призрак»: большинство из 460 000 жителей либо бежали из города из-за угрозы насилия на религиозной почве, либо прятались в подвалах своих домов[7].
19 июня2007 года: американские войска начали новую масштабную операцию (Arrowhead Ripper) против иракских боевиков в Баакубе. В наступлении приняли участие около 10 000 солдат коалиции[8].
22 июня2008 года: террористка-смертница привела в действие мощное взрывное устройство около здания администрации города и суда. 15 человек были убиты.
15 июля2008 года: два террориста-смертника атаковали колонну новобранцев, убив 35 и ранив 50 человек.
8 октября2008 года: террористка-смертница взорвала себя в здании суда, убив 9 (в том числе 5 иракских солдат) и ранив 17 человек.
16 октября2008 года: город был обстрелян из миномета. Три снаряда, выпущенные по форпосту американских войск, убили двух солдат.
3 марта2010 года: теракты трех смертников унесли жизни по меньшей мере 31 человека, десятки получили ранения. Третий взрыв произошел в главной городской больнице, куда поступили жертвы первых двух атак.
14 июня2011 года: группа из шести боевиков и террористов-смертников, одетых в полицейскую форму, напала на здание провинциального совета в центре Баакубы. Штурм начался около 9:20 утра после подрыва заминированного автомобиля у ворот здания. Пока полиция и силы безопасности Ирака проводили штурм, другие боевики напали на контрольно-пропускной пункт. В итоге 4 гражданских лиц и 3 полицейских погибли, 5 из нападавших были убиты, а один взят в плен.
10 августа2015 года: террорист-смертник на автомобиле подорвал себя возле Баакубы, убил 30 и ранив 40 человек. Ответственность за нападение взяла на себя организация Исламское государство.
Austin H. H.The Baqubah Refugee Camp: An Account of Work on Behalf of the Persecuted Assyrian Christians.— url=http://books.google.fr/books?id=BL_suak0lc4C.— Georgias Press, 2006.
Collela, Robert S.Battle for Baqubah: Killing Our Way Out(англ.).— revised.— Bloomington, IN: iUniverse[англ.], 2012.— ISBN 9781469791067. A 2007 OEF campaign account by a first sergeant of B Company 1-12 Cavalry (Bonecrushers), 1st Cavalry Division, out of Fort Hood, Texas.