Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов
Материал из Википедии — свободной encyclopedia
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (англ. weighted gene coexpression network analysis, WGCNA), также известный как анализ взвешенной сети корреляций (англ. weighted correlation network analysis) — метод глубинного анализа данных, основанный на попарных корреляциях между переменными[2]. Метод может быть использован для анализа широкого спектра многомерных наборов данных, но наиболее широкое распространение он получил в геномике[3]. Метод позволяет определять модули (кластеры коэкспрессирующихся генов), межмодульные хабы и узлы сети относительно принадлежности к модулю, изучать отношения между модулями коэкспрессии и сравнивать топологии различных сетей. WGCNA может быть использован как метод снижения размерности данных (связанный с непрямым факторным анализом), как метод кластеризации, как метод отбора признаков (например, для скрининга генов)[3].