Белок промиелоцитарного лейкоза

Возможный фактор транскрипции PML является супрессором опухоли белка, кодируемый у человека, геном PML .

Белок промиелоцитарного лейкоза
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1BOR, 2MVW, 2MWX, 4WJN, 4WJO
Идентификаторы
Псевдонимы	PML, MYL, PP8675, RNF71, TRIM19, Promyelocytic leukemia protein, promyelocytic leukemia, Probable transcription factor PML nuclear body scaffold
Внешние ID	OMIM: 102578 MGI: 104662 HomoloGene: 13245 GeneCards: PML
Расположение гена (человек) Хр. 15-я хромосома человека[1] Локус 15q24.1 Начало 73,994,673 bp[1] Конец 74,047,827 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 9-я хромосома мыши[2] Локус 9 B|9 31.63 cM Начало 58,125,359 bp[2] Конец 58,157,069 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в body of uterus upper lobe of left lung ectocervix subcutaneous adipose tissue right uterine tube apex of heart right lobe of thyroid gland left lobe of thyroid gland Наибольшая экспрессия в tail of embryo fetal liver hematopoietic progenitor cell tibiofemoral joint Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция SUMO binding cobalt ion binding связывание с ионом металла гомодимеризация белка zinc ion binding связывание с белками плазмы SMAD binding ДНК-связывающий transcription coactivator activity protein heterodimerization activity ubiquitin protein ligase binding SUMO transferase activity Компонент клетки цитоплазма цитозоль эндосома ядерная мембрана мембрана клеточное ядро Ядерный скелет ядрышко эндоплазматический ретикулум early endosome membrane внутренний компонент клетки нуклеоплазма PML body endoplasmic reticulum membrane extrinsic component of endoplasmic reticulum membrane Гетерохроматин Биологический процесс regulation of protein phosphorylation positive regulation of histone deacetylation intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress myeloid cell differentiation DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest negative regulation of telomere maintenance via telomerase ритмический процесс interferon-gamma-mediated signaling pathway negative regulation of telomerase activity positive regulation of telomere maintenance клеточное старение regulation of cell adhesion defense response to virus intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process transforming growth factor beta receptor signaling pathway proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process негативная регуляция пролиферации клеток positive regulation of defense response to virus by host апоптоз response to cytokine cell fate commitment negative regulation of translation in response to oxidative stress ДНК-зависимая регуляция транскрипции common-partner SMAD protein phosphorylation branching involved in mammary gland duct morphogenesis extrinsic apoptotic signaling pathway positive regulation of fibroblast proliferation positive regulation of apoptotic signaling pathway endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis транскрипция, ДНК-зависимая PML body organization negative regulation of cell growth intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator врождённый иммунитет вирусный процесс response to gamma radiation response to UV regulation of calcium ion transport into cytosol positive regulation of protein localization to chromosome, telomeric region fibroblast migration Внутриклеточная сортировка белков immune system process protein stabilization positive regulation of apoptotic process involved in mammary gland involution circadian regulation of gene expression regulation of MHC class I biosynthetic process regulation of circadian rhythm negative regulation of transcription, DNA-templated maintenance of protein location in nucleus cellular response to interleukin-4 intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator response to hypoxia regulation of double-strand break repair intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress retinoic acid receptor signaling pathway negative regulation of angiogenesis negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process entrainment of circadian clock by photoperiod negative regulation of mitotic cell cycle positive regulation of MHC class I biosynthetic process положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор regulation of signal transduction by p53 class mediator cellular response to leukemia inhibitory factor protein import into nucleus protein-containing complex assembly positive regulation of nucleic acid-templated transcription protein sumoylation Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 5371 18854 Ensembl ENSG00000140464 ENSMUSG00000036986 UniProt P29590 Q60953 RefSeq (мРНК) NM_033250 NM_002675 NM_033238 NM_033239 NM_033240 NM_033244 NM_033246 NM_033247 NM_033249 NM_008884 NM_178087 NM_001311088 RefSeq (белок) NP_002666 NP_150241 NP_150242 NP_150243 NP_150247 NP_150249 NP_150250 NP_150252 NP_150253 NP_001298017 NP_032910 NP_835188 Локус (UCSC) Chr 15: 73.99 – 74.05 Mb Chr 9: 58.13 – 58.16 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Функция

Белок, кодируемый этим геном, член семьи трехстороннего мотива (TRIM). Мотив TRIM включает в себя три цинко-связывающих домена, RING, B-бокс типа 1, B-бокс типа 2 и суперспирализованную область. Этот фосфопротеин локализуется в ядерных тельцах, где он функционирует как фактор транскрипции и супрессор опухолевого роста. Его экспрессия приводит к связыванию клеточного цикла и регуляции реакции P53 на онкогенные сигналы. Ген часто бывает вовлечен в транслокацию с рецептором ретиноевой кислоты альфа, геном, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом (APL). Обширный альтернативный сплайсинг этого гена приводит к нескольким вариациям в центральной и С-концевых областях белка; все варианты кодируют одно и то же N-окончание. Были идентифицированы альтернативные варианты транскриптов сплайсинга, кодирующие различные изоформы.^[5]

Взаимодействия

Белок промиелоцитарного лейкоза, как было выявлено, взаимодействует с:

• ANKRD2,^[6]
• CREBBP,^[7][8][9]
• Циклин Т1,^[10]
• DAXX,^{[11][12][13][14]}
• GATA2,^[15]
• HDAC1,^[16][17]
• HDAC3,^[17]
• HHEX,^[18]
• MAPK11,^[19]
• MYB,^[20]
• Mdm2,^{[21][22][23][24]}
• NR4A1,^[25]
• Корепрессор ядерных рецепторов 1,^[16]
• Корепрессор ядерных рецепторов 2,^[16][26]
• P53,^[21][27][28]
• RPL11,^[22]
• Белок ретинобластомы,^[29]
• NR1B1,^[7]
• SIN3A,^[16]
• Белок SKI,^[16]
• STAT3,^[30]
• SRF^[8] и
• SUMO1,^[31][32]
• Sp1,^[33]
• TOPBP1,^[34]
• TDG,^[35] и
• ZBTB16.^[36]

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140464 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000036986 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Entrez Gene: PML promyelocytic leukemia  (неопр.). Архивировано 8 марта 2010 года.
6. Kojic S., Medeot E., Guccione E., Krmac H., Zara I., Martinelli V., Valle G., Faulkner G. The Ankrd2 protein, a link between the sarcomere and the nucleus in skeletal muscle (англ.) // J. Mol. Biol.^[англ.] : journal. — 2004. — May (vol. 339, no. 2). — P. 313—325. — doi:10.1016/j.jmb.2004.03.071. — PMID 15136035.
7. Zhong S., Delva L., Rachez C., Cenciarelli C., Gandini D., Zhang H., Kalantry S., Freedman L.P., Pandolfi P.P. A RA-dependent, tumour-growth suppressive transcription complex is the target of the PML-RARalpha and T18 oncoproteins (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — November (vol. 23, no. 3). — P. 287—295. — doi:10.1038/15463. — PMID 10610177.
8. Matsuzaki K., Minami T., Tojo M., Honda Y., Saitoh N., Nagahiro S., Saya H., Nakao M. PML-nuclear bodies are involved in cellular serum response (англ.) // Genes Cells^[англ.] : journal. — 2003. — March (vol. 8, no. 3). — P. 275—286. — doi:10.1046/j.1365-2443.2003.00632.x. — PMID 12622724.
9. Doucas V., Tini M., Egan D.A., Evans R.M. Modulation of CREB binding protein function by the promyelocytic (PML) oncoprotein suggests a role for nuclear bodies in hormone signaling (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — March (vol. 96, no. 6). — P. 2627—2632. — doi:10.1073/pnas.96.6.2627. — PMID 10077561. — PMC 15819.
10. Marcello A., Ferrari A., Pellegrini V., Pegoraro G., Lusic M., Beltram F., Giacca M. Recruitment of human cyclin T1 to nuclear bodies through direct interaction with the PML protein (англ.) // EMBO J. : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 9). — P. 2156—2166. — doi:10.1093/emboj/cdg205. — PMID 12727882. — PMC 156077.
11. Ishov A.M., Sotnikov A.G., Negorev D., Vladimirova O.V., Neff N., Kamitani T., Yeh E.T., Strauss J.F., Maul G.G. PML is critical for ND10 formation and recruits the PML-interacting protein daxx to this nuclear structure when modified by SUMO-1 (англ.) // J. Cell Biol.^[англ.] : journal. — 1999. — October (vol. 147, no. 2). — P. 221—234. — doi:10.1083/jcb.147.2.221. — PMID 10525530. — PMC 2174231.
12. Li H., Leo C., Zhu J., Wu X., O'Neil J., Park E.J., Chen J.D. Sequestration and inhibition of Daxx-mediated transcriptional repression by PML (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — March (vol. 20, no. 5). — P. 1784—1796. — doi:10.1128/mcb.20.5.1784-1796.2000. — PMID 10669754. — PMC 85360.
13. Lehembre F., Müller S., Pandolfi P.P., Dejean A. Regulation of Pax3 transcriptional activity by SUMO-1-modified PML (англ.) // Oncogene : journal. — 2001. — January (vol. 20, no. 1). — P. 1—9. — doi:10.1038/sj.onc.1204063. — PMID 11244500.
14. Zhong S., Salomoni P., Ronchetti S., Guo A., Ruggero D., Pandolfi P.P. Promyelocytic leukemia protein (PML) and Daxx participate in a novel nuclear pathway for apoptosis (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2000. — February (vol. 191, no. 4). — P. 631—640. — doi:10.1084/jem.191.4.631. — PMID 10684855. — PMC 2195846.
15. Tsuzuki S., Towatari M., Saito H., Enver T. Potentiation of GATA-2 activity through interactions with the promyelocytic leukemia protein (PML) and the t(15;17)-generated PML-retinoic acid receptor alpha oncoprotein (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — September (vol. 20, no. 17). — P. 6276—6286. — doi:10.1128/mcb.20.17.6276-6286.2000. — PMID 10938104. — PMC 86102.
16. Khan M.M., Nomura T., Kim H., Kaul S.C., Wadhwa R., Shinagawa T., Ichikawa-Iwata E., Zhong S., Pandolfi P.P., Ishii S. Role of PML and PML-RARalpha in Mad-mediated transcriptional repression (англ.) // Mol. Cell^[англ.] : journal. — 2001. — June (vol. 7, no. 6). — P. 1233—1243. — doi:10.1016/s1097-2765(01)00257-x. — PMID 11430826.
17. Wu W.S., Vallian S., Seto E., Yang W.M., Edmondson D., Roth S., Chang K.S. The growth suppressor PML represses transcription by functionally and physically interacting with histone deacetylases (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2259—2268. — doi:10.1128/MCB.21.7.2259-2268.2001. — PMID 11259576. — PMC 86860.
18. Topcu Z., Mack D.L., Hromas R.A., Borden K.L. The promyelocytic leukemia protein PML interacts with the proline-rich homeodomain protein PRH: a RING may link hematopoiesis and growth control (англ.) // Oncogene : journal. — 1999. — November (vol. 18, no. 50). — P. 7091—7100. — doi:10.1038/sj.onc.1203201. — PMID 10597310.
19. Shin J., Park B., Cho S., Lee S., Kim Y., Lee S.O., Cho K., Lee S., Jin B.S., Ahn J.H., Choi E.J., Ahn K. Promyelocytic leukemia is a direct inhibitor of SAPK2/p38 mitogen-activated protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — September (vol. 279, no. 39). — P. 40994—41003. — doi:10.1074/jbc.M407369200. — PMID 15273249.
20. Dahle Ø, Bakke O., Gabrielsen O.S. c-Myb associates with PML in nuclear bodies in hematopoietic cells (англ.) // Exp. Cell Res.^[англ.] : journal. — 2004. — July (vol. 297, no. 1). — P. 118—126. — doi:10.1016/j.yexcr.2004.03.014. — PMID 15194430.
21. Kurki S., Latonen L., Laiho M. Cellular stress and DNA damage invoke temporally distinct Mdm2, p53 and PML complexes and damage-specific nuclear relocalization (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 2003. — October (vol. 116, no. Pt 19). — P. 3917—3925. — doi:10.1242/jcs.00714. — PMID 12915590.
22. Bernardi R., Scaglioni P.P., Bergmann S., Horn H.F., Vousden K.H., Pandolfi P.P. PML regulates p53 stability by sequestering Mdm2 to the nucleolus (англ.) // Nat. Cell Biol. : journal. — 2004. — July (vol. 6, no. 7). — P. 665—672. — doi:10.1038/ncb1147. — PMID 15195100.
23. Zhu H., Wu L., Maki C.G. MDM2 and promyelocytic leukemia antagonize each other through their direct interaction with p53 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — December (vol. 278, no. 49). — P. 49286—49292. — doi:10.1074/jbc.M308302200. — PMID 14507915.
24. Wei X., Yu Z.K., Ramalingam A., Grossman S.R., Yu J.H., Bloch D.B., Maki C.G. Physical and functional interactions between PML and MDM2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — August (vol. 278, no. 31). — P. 29288—29297. — doi:10.1074/jbc.M212215200. — PMID 12759344.
25. Wu W.S., Xu Z.X., Ran R., Meng F., Chang K.S. Promyelocytic leukemia protein PML inhibits Nur77-mediated transcription through specific functional interactions (англ.) // Oncogene : journal. — 2002. — May (vol. 21, no. 24). — P. 3925—3933. — doi:10.1038/sj.onc.1205491. — PMID 12032831.
26. Hong S.H., Yang Z., Privalsky M.L. Arsenic trioxide is a potent inhibitor of the interaction of SMRT corepressor with Its transcription factor partners, including the PML-retinoic acid receptor alpha oncoprotein found in human acute promyelocytic leukemia (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2001. — November (vol. 21, no. 21). — P. 7172—7182. — doi:10.1128/MCB.21.21.7172-7182.2001. — PMID 11585900. — PMC 99892.
27. Fogal V., Gostissa M., Sandy P., Zacchi P., Sternsdorf T., Jensen K., Pandolfi P.P., Will H., Schneider C., Del Sal G. Regulation of p53 activity in nuclear bodies by a specific PML isoform (англ.) // EMBO J. : journal. — 2000. — November (vol. 19, no. 22). — P. 6185—6195. — doi:10.1093/emboj/19.22.6185. — PMID 11080164. — PMC 305840.
28. Guo A., Salomoni P., Luo J., Shih A., Zhong S., Gu W., Pandolfi P.P. The function of PML in p53-dependent apoptosis // Nat. Cell Biol.. — 2000. — Октябрь (т. 2, № 10). — С. 730—736. — doi:10.1038/35036365. — PMID 11025664.
29. Alcalay M., Tomassoni L., Colombo E., Stoldt S., Grignani F., Fagioli M., Szekely L., Helin K., Pelicci P.G. The promyelocytic leukemia gene product (PML) forms stable complexes with the retinoblastoma protein (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — February (vol. 18, no. 2). — P. 1084—1093. — PMID 9448006. — PMC 108821.
30. Kawasaki A., Matsumura I., Kataoka Y., Takigawa E., Nakajima K., Kanakura Y. Opposing effects of PML and PML/RAR alpha on STAT3 activity (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2003. — May (vol. 101, no. 9). — P. 3668—3673. — doi:10.1182/blood-2002-08-2474. — PMID 12506013.
31. Lin D.Y., Shih H.M. Essential role of the 58-kDa microspherule protein in the modulation of Daxx-dependent transcriptional repression as revealed by nucleolar sequestration (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25446—25456. — doi:10.1074/jbc.M200633200. — PMID 11948183.
32. Kamitani T., Nguyen H.P., Kito K., Fukuda-Kamitani T., Yeh E.T. Covalent modification of PML by the sentrin family of ubiquitin-like proteins (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — February (vol. 273, no. 6). — P. 3117—3120. — doi:10.1074/jbc.273.6.3117. — PMID 9452416.
33. Vallian S., Chin K.V., Chang K.S. The promyelocytic leukemia protein interacts with Sp1 and inhibits its transactivation of the epidermal growth factor receptor promoter (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — December (vol. 18, no. 12). — P. 7147—7156. — PMID 9819401. — PMC 109296.
34. Xu Z.X., Timanova-Atanasova A., Zhao R.X., Chang K.S. PML colocalizes with and stabilizes the DNA damage response protein TopBP1 (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2003. — June (vol. 23, no. 12). — P. 4247—4256. — doi:10.1128/mcb.23.12.4247-4256.2003. — PMID 12773567. — PMC 156140.
35. Takahashi H., Hatakeyama S., Saitoh H., Nakayama K.I. Noncovalent SUMO-1 binding activity of thymine DNA glycosylase (TDG) is required for its SUMO-1 modification and colocalization with the promyelocytic leukemia protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — February (vol. 280, no. 7). — P. 5611—5621. — doi:10.1074/jbc.M408130200. — PMID 15569683.
36. Koken M.H., Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix M.K., Davies J.M., Kabarowski J.H., Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan C.C., Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemia-associated retinoic acid receptor alpha fusion partners, PML and PLZF, heterodimerize and colocalize to nuclear bodies (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — September (vol. 94, no. 19). — P. 10255—10260. — doi:10.1073/pnas.94.19.10255. — PMID 9294197. — PMC 23349.

Литература

• Zhong S., Salomoni P., Pandolfi P.P. The transcriptional role of PML and the nuclear body (англ.) // Nat. Cell Biol. : journal. — 2000. — Vol. 2, no. 5. — P. E85—90. — doi:10.1038/35010583. — PMID 10806494.
• Jensen K., Shiels C., Freemont P.S. PML protein isoforms and the RBCC/TRIM motif (англ.) // Oncogene. — 2001. — Vol. 20, no. 49. — P. 7223—7233. — doi:10.1038/sj.onc.1204765. — PMID 11704850.
• Pearson M., Pelicci P.G. PML interaction with p53 and its role in apoptosis and replicative senescence (англ.) // Oncogene : journal. — 2001. — Vol. 20, no. 49. — P. 7250—7256. — doi:10.1038/sj.onc.1204856. — PMID 11704853.
• Salomoni P., Pandolfi P.P. The role of PML in tumor suppression (англ.) // Cell. — Cell Press, 2002. — Vol. 108, no. 2. — P. 165—170. — doi:10.1016/S0092-8674(02)00626-8. — PMID 11832207.
• Combes R., Balls M., Bansil L., Barratt M., Bell D., Botham P., Broadhead C., Clothier R., George E., Fentem J., Jackson M., Indans I., Loizu G., Navaratnam V., Pentreath V., Phillips B., Stemplewski H., Stewart J. An assessment of progress in the use of alternatives in toxicity testing since the publication of the report of the second FRAME Toxicity Committee (1991) (англ.) // Alternatives to laboratory animals : ATLA : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 4. — P. 365—406. — PMID 12234245.
• Bernardi R., Pandolfi P.P. Role of PML and the PML-nuclear body in the control of programmed cell death (англ.) // Oncogene : journal. — 2004. — Vol. 22, no. 56. — P. 9048—9057. — doi:10.1038/sj.onc.1207106. — PMID 14663483.
• Beez S., Demmer P., Puccetti E. Targeting the Acute Promyelocytic Leukemia-Associated Fusion Proteins PML/RARα and PLZF/RARα with Interfering Peptides (англ.) // PLOS One : journal. — 2012. — Vol. 7, no. 11. — P. e48636. — doi:10.1371/journal.pone.0048636. — PMID 23152790. — PMC 3494703.