SEMA7A

Семафорин-7A (англ. Semaphorin 7A, GPI membrane anchor; SEMA7A; CD108) — мембранный гликопротеин класса семафоринов, прикреплён к клеточной мембране за счёт гликозилфосфатидилинозитольной группы. Антиген группы крови John-Milton-Hagen (JMH). Продукт гена человека SEMA7A^[5].

SEMA7A
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 3NVQ
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11
Внешние ID	OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Расположение гена (человек) Хр. 15-я хромосома человека[1] Локус 15q24.1 Начало 74,409,289 bp[1] Конец 74,433,958 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 9-я хромосома мыши[2] Локус 9|9 B Начало 57,847,395 bp[2] Конец 57,870,148 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в C1 segment primary visual cortex right hemisphere of cerebellum stromal cell of endometrium цитоархитектоническое поле Бродмана 9 Наибольшая экспрессия в cumulus cell primary visual cortex lumbar subsegment of spinal cord anterior horn of spinal cord dentate gyrus of hippocampal formation granule cell lobe of cerebellum Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с белками плазмы integrin binding neuropilin binding semaphorin receptor binding chemorepellent activity Компонент клетки мембрана клеточная мембрана anchored component of membrane внеклеточное пространство наружная сторона клеточной мембраны часть клеточной мембраны collagen-containing extracellular matrix Биологический процесс дифференцировка клеток positive regulation of protein phosphorylation развитие нервной системы развитие многоклеточного организма osteoblast differentiation иммунный ответ positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade axon extension olfactory lobe development integrin-mediated signaling pathway positive regulation of axon extension воспалительная реакция neuron projection development regulation of inflammatory response negative chemotaxis positive regulation of macrophage cytokine production neural crest cell migration positive regulation of cell migration negative regulation of axon extension involved in axon guidance semaphorin-plexin signaling pathway Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 8482 20361 Ensembl ENSG00000138623 ENSG00000288455 ENSMUSG00000038264 UniProt O75326 Q9QUR8 RefSeq (мРНК) NM_003612 NM_001146029 NM_001146030 NM_011352 RefSeq (белок) NP_001139501 NP_001139502 NP_003603 NP_035482 Локус (UCSC) Chr 15: 74.41 – 74.43 Mb Chr 9: 57.85 – 57.87 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Структура

SEMA7A состоит из 666 аминокислот, молекулярная масса 74,8 кДа. Содержит один Ig-подобный домен типа C2. Гликозилфосфатидилинозитол заякоривает белок на мембране.

Взаимодействует с интегринами ITGA1 и ITGB1 и с рецептором семафоринов PLXNC1.

Функции

SEMA7A играет важную роль в интегрин-опосредованной передаче сигнала. Функционирует в регуляции клеточной миграции и в иммунном ответе. Стимулирует образование комплексов фокальной адгезии, активацию протеинкиназы PTK2/FAK1 и последующее фосфорилирование киназ MAPK1 и MAPK3. Стимулирует продукцию воспалительных цитокинов моноцитами и макрофагами. Играет важную роль в модулировании воспалительной реакции и T-клеточного иммунного ответа. Белок стимулирует рост аксонов в эмбриональной обонятельной луковице. Участвует в прикреплении меланоцитов, их росте и образовании дендритных отростков.

Кроме этого, белок служит рецептором малярийного паразита Plasmodium falciparum.

Группа крови JMH

Система группы крови John Milton Hagen (JMH) — высокочастотный антиген эритроцитарной группы крови человека.^[6] Система состоит из 6 антигенов, расположенных на семафорине-7A^[7], но, как правило, они не вызывают существенного гемолиза или гемолитических расстройств новорожденных.^[8]

Тканевая локализация

Белок экспрессирован на активированных лимфоцитах и эритроцитах. Детектируется на кератиноцитах, эндотелиальных клетках кровеносных сосудов кожи. Экспрессирован на фибробрастах, меланоцитах, в плаценте, яичках, яичниках, селезёнке, мозге, спинном мозге, лёгких, сердце, надпочечниках, лимфатических узлах, вилочковой железе, кишечнике и почках.

Примечания

1. ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group)  (неопр.).
6. Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.
7. Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.
8. JMH  (неопр.). bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.

Литература

• Xu X., Ng S., Wu Z.L., etal. Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 35. — P. 22428—22434. — doi:10.1074/jbc.273.35.22428. — PMID 9712866.
• Lange C., Liehr T., Goen M., etal. New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 3. — P. 340—350. — doi:10.1006/geno.1998.5256. — PMID 9721204.
• Yamada A., Kubo K., Takeshita T., etal. Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108. (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1999. — Vol. 162, no. 7. — P. 4094—4100. — PMID 10201933.
• Angelisová P., Drbal K., Cerný J., etal. Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. (англ.) // Immunobiology : journal. — 1999. — Vol. 200, no. 2. — P. 234—245. — doi:10.1016/s0171-2985(99)80073-4. — PMID 10416131.
• Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., etal. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 99, no. 1. — P. 71—80. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80063-X. — PMID 10520995.
• Mine T., Harada K., Matsumoto T., etal. CDw108 expression during T-cell development. (англ.) // Tissue Antigens^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 55, no. 5. — P. 429—436. — doi:10.1034/j.1399-0039.2000.550505.x. — PMID 10885563.
• Holmes S., Downs A.M., Fosberry A., etal. Sema7A is a potent monocyte stimulator. (неопр.) // Scand. J. Immunol.. — 2002. — Т. 56, № 3. — С. 270—275. — doi:10.1046/j.1365-3083.2002.01129.x. — PMID 12193228.
• Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
• Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
• Maurin J.C., Delorme G., Machuca-Gayet I., etal. Odontoblast expression of semaphorin 7A during innervation of human dentin. (англ.) // Matrix Biol.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 3. — P. 232—238. — doi:10.1016/j.matbio.2005.03.005. — PMID 15907379.
• Hu Y., Malone J.P., Fagan A.M., etal. Comparative proteomic analysis of intra- and interindividual variation in human cerebrospinal fluid. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 12. — P. 2000—2009. — doi:10.1074/mcp.M500207-MCP200. — PMID 16199891.
• Koh J.M., Oh B., Lee J.Y., etal. Association study of semaphorin 7a (sema7a) polymorphisms with bone mineral density and fracture risk in postmenopausal Korean women. (англ.) // J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 51, no. 2. — P. 112—117. — doi:10.1007/s10038-005-0331-z. — PMID 16372136.