Pararnavirae

Pararnavirae — царство вирусов, созданное Международным Комитетом по таксономии вирусов, которое включает в себя все ретротранскрибируемые вирусы. Он включает в себя группы VI и VII по Балтиморской классификации^[2]. они могут содержать ДНК или РНК, но их репликация происходит с использованием обратной транскриптазы, то есть через промежуточную цепь генетического материала, отличного от того, из которого они состоят. Царство включает в себя два порядка и шесть семейств.

Pararnavirae
Научная классификация
Группа: Вирусы[1] Реалм: Riboviria Царство: Pararnavirae
Международное научное название
Pararnavirae
Систематика в Викивидах Поиск изображений на Викискладе NCBI   2732397

ДНК-вирусы данного царства тесно связаны с РНК-вирусами, поэтому они классифицируются в Рибовирийском реалме вместе с последними. Происхождение этих вирусов, по-видимому, восходит ко времени появления эукариот. Было высказано предположение, что ретротранскрипционные вирусы возникли в результате события, в котором ретротранспозон был интегрирован в капсид другого вируса, заменив геном и ферменты вируса-хозяина, но также было предположено, что это мог быть и РНК-вирус. Более поздние ретротрансфицированные вирусы возникли из ретротранспозонов LTR в результате вирусной инфекции. Они классифицируются в семьях Pseudoviridae, Metaviridae и Belpaoviridae^[3][4].

К числу видов, поражающих людей, относятся вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) и вирус гепатита В^[5].

Классификация

• Порядок Ortervirales
  • Семейство Belpaoviridae
  • Семейство Caulimoviridae
  • Семейство Retroviridae
  • Семейство Metaviridae
  • Семейство Pseudoviridae
• Порядок Blubervirales
  • Семейство Hepadnaviridae

Филогения

Филогенетическое исследование обратной транскриптазы дало следующий результат, также были включены эндогенезированные ретротранспозоны LTR, отнесённые к семействам Pseudoviridae, Metaviridae и Belpaviridae:^[6][7]

Pararnavirae	Hepadnaviridae   Ortervirales     Belpaoviridae     Pseudoviridae         Retroviridae       Caulimoviridae     Metaviridae

Использованная литература

1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
2. Virus Taxonomy: 2019 Release  (неопр.). talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Дата обращения: 25 апреля 2020. Архивировано 20 марта 2020 года.
3. Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25 de septiembre de 2015). "A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution". Science Advances. 1 (8): e1500527. Bibcode:2015SciA....1E0527N. doi:10.1126/sciadv.1500527. PMC 4643759. PMID 26601271. {{cite journal}}: Проверьте значение даты: |date= (справка)
4. Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virus World as an Evolutionary Network of Viruses and Capsidless Selfish Elements Архивная копия от 16 апреля 2022 на Wayback Machine. Microbiology and Molecular Biology Reviews.
5. Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH Proposal: Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria (англ.). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Дата обращения: 21 мая 2020.
6. Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: New Virus Order Unifying Five Families of Reverse-Transcribing Viruses (англ.) // Journal of Virology / Rozanne M. Sandri-Goldin. — 2018-06-15. — Vol. 92, iss. 12. — P. e00515–18. — ISSN 1098-5514 0022-538X, 1098-5514. — doi:10.1128/JVI.00515-18. Архивировано 12 июля 2022 года.
7. Carlos Llorens, Beatriz Soriano, Maria Navarrete-Muñoz, Ahmed Hafez, Vicente Arnau. 3 // Reverse-transcribing viruses of the families Belpaoviridae, Metaviridae and Pseudoviridae (order Ortervirales). — Elsevier, 2020. — ISBN 978-0-12-809633-8. Архивировано 22 сентября 2021 года.

Примечания