PCAF

Фактор, связанный с P300/СВР (PCAF), также известный как K(лизиновая) ацетилтрансфераза 2B (KAT2B) — ген человека и коактиватор транскрипции, связанный с p53.

K(лизиновая) ацетилтрансфераза 2B
PDB rendering based on 1cm0.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1CM0, 1JM4, 1N72, 1WUG, 1WUM, 1ZS5, 2RNW, 2RNX, 3GG3, 4NSQ
Идентификаторы
Символ	KAT2B ; CAF; P; P/CAF; PCAF
Внешние ID	OMIM: 602303 MGI: 1343094 HomoloGene: 20834 ChEMBL: 5500 GeneCards: Ген KAT2B
номер EC	2.3.1.48
Генная онтология Функция • transcription cofactor activity • transcription coactivator activity • histone acetyltransferase activity • lysine N-acetyltransferase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity • protein binding • transcription factor binding • acetyltransferase activity • protein kinase binding • protein complex binding • histone deacetylase binding Компонент клетки • PCAF complex • kinetochore • nucleus • nucleoplasm • Ada2/Gcn5/Ada3 transcription activator complex • A band • I band • actomyosin Биологический процесс • chromatin organization • chromatin remodeling • transcription from RNA polymerase I promoter • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • protein acetylation • cell cycle arrest • Notch signaling pathway • negative regulation of cell proliferation • gene expression • regulation of protein ADP-ribosylation • viral process • N-terminal peptidyl-lysine acetylation • internal peptidyl-lysine acetylation • peptidyl-lysine acetylation • cellular response to insulin stimulus • histone H3 acetylation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • rhythmic process Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	8850	18519
Ensembl	ENSG00000114166	ENSMUSG00000000708
UniProt	Q92831	Q9JHD1
RefSeq (мРНК)	NM_003884	NM_001190846
RefSeq (белок)	NP_003875	NP_001177775
Локус (UCSC)	Chr 3: 20.08 – 20.2 Mb	Chr 17: 53.57 – 53.67 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Структура

Несколько доменов PCAF могут действовать самостоятельно или в унисон, чтобы включить её функции. PCAF имеет отдельные домены ацетилтрансферазы и E3 убиквитинлигазы, а также бромодомен для взаимодействия с другими белками. PCAF также обладает сайтами для собственного ацетилирования и убиквитинирования.^[1]

Функция

CBP^[англ.] и р300^[англ.] — большие ядерные белки, которые связываются с многими последовательности конкретных факторов, участвующих в росте клеток и/или их дифференциации, в том числе c-jun^[англ.] и аденовирусным онкопротеином Е1А. Белок, кодируемый геном PCAF ассоциируцется с p300/CBP. Он обладает в пробирке (in vitro) и в естественных условиях (in vivo) активностью связывания с СВР и р300, и конкурирует с Е1А за сайты связывания в p300/CBP. Он обеспечивает деятельность гистонацетилтрансферазы с основными гистоновыми и нуклеосомными частицами ядра, что указывает, что этот белок играет непосредственную роль в регуляции транскрипции.^[2]

Регуляция

Деятельность ацетилтрансферазы и клеточное расположение PCAF регулируются путём ацетилирования самой PCAF. PCAF может быть автоацетилированной (ацетилировать саму себя) или с помощью р300^[англ.]. Ацетилирование приводит к миграции в ядро и повышению собственной активности ацетилтрансферазы.^[3] PCAF взаимодействует и деацетилируется с HDAC3 , что приводит к снижению активности ацетилтрансферазы PCAF и цитоплазматической локализации.^[4]

Белковые взаимодействия

PCAF образует комплексы с многочисленными белками, которые направляют свою активность. Например PCAF набирается из ATF^[5], для ацетилирования гистонов и способствованию транскрипции генов-мишеней ATF4.

Мишени

Есть различные белковые мишени в деятельности ацетилтрансферазы PCAF, в том числе транскрипционные факторы, такие как Fli1,^[6] p53^[7] и многочисленные остатки гистонов. HDM2, сама убиквитинлигаза, становится мишенью p53, как было продемонстрировано, в результате деятельности PCAF.^[1]

Взаимодействия

PCAF, как было показано, взаимодействуют с:

• BRCA2,^[8][9]
• CTNNB1,^[10]
• CREBBP,^[11][12]
• EVI1,^[13]
• HNF1A,^[14]
• IRF1,^[15]
• IRF2,^[15][16]
• KLF13,^[17]
• Mdm2^[18]
• Myc,^[19]
• NCOA1,^[20]
• POLR2A,^[12]
• RBPJ,^[21]
• TCF3,^[22]
• TRRAP,^[19][23] and
• TWIST1.^[24]

Примечания

1. Linares L.K., Kiernan R., Triboulet R., Chable-Bessia C., Latreille D., Cuvier O., Lacroix M., Le Cam L., Coux O., Benkirane M. Intrinsic ubiquitination activity of PCAF controls the stability of the oncoprotein Hdm2 (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2007. — March (vol. 9, no. 3). — P. 331—338. — doi:10.1038/ncb1545. — PMID 17293853.
2. Entrez Gene: PCAF p300/CBP-associated factor  (неопр.).
3. Santos-Rosa H., Valls E., Kouzarides T., Martínez-Balbás M. Mechanisms of P/CAF auto-acetylation (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2003. — August (vol. 31, no. 15). — P. 4285—4292. — doi:10.1093/nar/gkg655. — PMID 12888487. — PMC 169960.
4. Grégoire S., Xiao L., Nie J., Zhang X., Xu M., Li J., Wong J., Seto E., Yang X.J. Histone deacetylase 3 interacts with and deacetylates myocyte enhancer factor 2 (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2007. — February (vol. 27, no. 4). — P. 1280—1295. — doi:10.1128/MCB.00882-06. — PMID 17158926. — PMC 1800729.
5. Chérasse Y., Maurin A.C., Chaveroux C., Jousse C., Carraro V., Parry L., Deval C., Chambon C., Fafournoux P., Bruhat A. The p300/CBP-associated factor (PCAF) is a cofactor of ATF4 for amino acid-regulated transcription of CHOP (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2007. — Vol. 35, no. 17. — P. 5954—5965. — doi:10.1093/nar/gkm642. — PMID 17726049. — PMC 2034469.
6. Asano Y., Czuwara J., Trojanowska M. Transforming growth factor-beta regulates DNA binding activity of transcription factor Fli1 by p300/CREB-binding protein-associated factor-dependent acetylation (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2007. — November (vol. 282, no. 48). — P. 34672—34683. — doi:10.1074/jbc.M703907200. — PMID 17884818.
7. Liu L., Scolnick D.M., Trievel R.C., Zhang H.B., Marmorstein R., Halazonetis T.D., Berger S.L. p53 sites acetylated in vitro by PCAF and p300 are acetylated in vivo in response to DNA damage (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1999. — February (vol. 19, no. 2). — P. 1202—1209. — PMID 9891054. — PMC 116049.
8. Lin H.R., Ting N.S., Qin J., Lee W.H. M phase-specific phosphorylation of BRCA2 by Polo-like kinase 1 correlates with the dissociation of the BRCA2-P/CAF complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — September (vol. 278, no. 38). — P. 35979—35987. — doi:10.1074/jbc.M210659200. — PMID 12815053.
9. Fuks F., Milner J., Kouzarides T. BRCA2 associates with acetyltransferase activity when bound to P/CAF (англ.) // Oncogene : journal. — 1998. — November (vol. 17, no. 19). — P. 2531—2534. — doi:10.1038/sj.onc.1202475. — PMID 9824164.
10. Ge X., Jin Q., Zhang F., Yan T., Zhai Q. PCAF acetylates {beta}-catenin and improves its stability (англ.) // Molecular Biology of the Cell : journal. — 2009. — January (vol. 20, no. 1). — P. 419—427. — doi:10.1091/mbc.E08-08-0792. — PMID 18987336. — PMC 2613091.
11. Tini M., Benecke A., Um S.J., Torchia J., Evans R.M., Chambon P. Association of CBP/p300 acetylase and thymine DNA glycosylase links DNA repair and transcription (англ.) // Molecular Cell^[англ.] : journal. — 2002. — February (vol. 9, no. 2). — P. 265—277. — doi:10.1016/S1097-2765(02)00453-7. — PMID 11864601.
12. Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang X.J., Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. A human RNA polymerase II complex containing factors that modify chromatin structure (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1998. — September (vol. 18, no. 9). — P. 5355—5363. — PMID 9710619. — PMC 109120.
13. Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. Interaction of EVI1 with cAMP-responsive element-binding protein-binding protein (CBP) and p300/CBP-associated factor (P/CAF) results in reversible acetylation of EVI1 and in co-localization in nuclear speckles (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — November (vol. 276, no. 48). — P. 44936—44943. — doi:10.1074/jbc.M106733200. — PMID 11568182.
14. Soutoglou E., Papafotiou G., Katrakili N., Talianidis I. Transcriptional activation by hepatocyte nuclear factor-1 requires synergism between multiple coactivator proteins (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — April (vol. 275, no. 17). — P. 12515—12520. — doi:10.1074/jbc.275.17.12515. — PMID 10777539.
15. Masumi A., Wang I.M., Lefebvre B., Yang X.J., Nakatani Y., Ozato K. The histone acetylase PCAF is a phorbol-ester-inducible coactivator of the IRF family that confers enhanced interferon responsiveness (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1999. — March (vol. 19, no. 3). — P. 1810—1820. — PMID 10022868. — PMC 83974.
16. Masumi A., Ozato K. Coactivator p300 acetylates the interferon regulatory factor-2 in U937 cells following phorbol ester treatment (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — June (vol. 276, no. 24). — P. 20973—20980. — doi:10.1074/jbc.M101707200. — PMID 11304541.
17. Song C.Z., Keller K., Murata K., Asano H., Stamatoyannopoulos G. Functional interaction between coactivators CBP/p300, PCAF, and transcription factor FKLF2 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 9). — P. 7029—7036. — doi:10.1074/jbc.M108826200. — PMID 11748222. — PMC 2808425.
18. Jin Y., Zeng S.X., Dai M.S., Yang X.J., Lu H. MDM2 inhibits PCAF (p300/CREB-binding protein-associated factor)-mediated p53 acetylation (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — August (vol. 277, no. 34). — P. 30838—30843. — doi:10.1074/jbc.M204078200. — PMID 12068014.
19. Liu X., Tesfai J., Evrard Y.A., Dent S.Y., Martinez E. c-Myc transformation domain recruits the human STAGA complex and requires TRRAP and GCN5 acetylase activity for transcription activation (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — May (vol. 278, no. 22). — P. 20405—20412. — doi:10.1074/jbc.M211795200. — PMID 12660246. — PMC 4031917.
20. Spencer T.E., Jenster G., Burcin M.M., Allis C.D., Zhou J., Mizzen C.A., McKenna N.J., Onate S.A., Tsai S.Y., Tsai M.J., O'Malley B.W. Steroid receptor coactivator-1 is a histone acetyltransferase (англ.) // Nature : journal. — 1997. — September (vol. 389, no. 6647). — P. 194—198. — doi:10.1038/38304. — PMID 9296499.
21. Kurooka H., Honjo T. Functional interaction between the mouse notch1 intracellular region and histone acetyltransferases PCAF and GCN5 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — June (vol. 275, no. 22). — P. 17211—17220. — doi:10.1074/jbc.M000909200. — PMID 10747963.
22. Bradney C., Hjelmeland M., Komatsu Y., Yoshida M., Yao T.P., Zhuang Y. Regulation of E2A activities by histone acetyltransferases in B lymphocyte development (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — January (vol. 278, no. 4). — P. 2370—2376. — doi:10.1074/jbc.M211464200. — PMID 12435739.
23. Fuchs M., Gerber J., Drapkin R., Sif S., Ikura T., Ogryzko V., Lane W.S., Nakatani Y., Livingston D.M. The p400 complex is an essential E1A transformation target (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2001. — August (vol. 106, no. 3). — P. 297—307. — doi:10.1016/s0092-8674(01)00450-0. — PMID 11509179.
24. Hamamori Y., Sartorelli V., Ogryzko V., Puri P.L., Wu H.Y., Wang J.Y., Nakatani Y., Kedes L. Regulation of histone acetyltransferases p300 and PCAF by the bHLH protein twist and adenoviral oncoprotein E1A (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — February (vol. 96, no. 3). — P. 405—413. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80553-X. — PMID 10025406.

Литература

• Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
• Ott M., Dorr A., Hetzer-Egger C., Kaehlcke K., Schnolzer M., Henklein P., Cole P., Zhou M.M., Verdin E. Tat acetylation: a regulatory switch between early and late phases in HIV transcription elongation. (англ.) // Novartis Found. Symp. : journal. — 2004. — Vol. Novartis Foundation Symposia. — P. 182—193. — ISBN 978-0-470-86263-6. — doi:10.1002/0470862637.ch13. — PMID 15171254.
• Liou L.Y., Herrmann C.H., Rice A.P. HIV-1 infection and regulation of Tat function in macrophages (англ.) // International Journal of Biochemistry & Cell Biology^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 36, no. 9. — P. 1767—1775. — doi:10.1016/j.biocel.2004.02.018. — PMID 15183343.
• Gibellini D., Vitone F., Schiavone P., Re M.C. HIV-1 tat protein and cell proliferation and survival: a brief review (англ.) // New Microbiol. : journal. — 2005. — Vol. 28, no. 2. — P. 95—109. — PMID 16035254.
• Hetzer C., Dormeyer W., Schnölzer M., Ott M. Decoding Tat: the biology of HIV Tat posttranslational modifications (англ.) // Microbes Infect. : journal. — 2006. — Vol. 7, no. 13. — P. 1364—1369. — doi:10.1016/j.micinf.2005.06.003. — PMID 16046164.
• Peruzzi F. The multiple functions of HIV-1 Tat: proliferation versus apoptosis (англ.) // Frontiers in Bioscience^[англ.] : journal. — Frontiers in Bioscience^[англ.], 2006. — Vol. 11. — P. 708—717. — doi:10.2741/1829. — PMID 16146763.
• Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
• Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
• Dawson S.J., White L.A. Treatment of Haemophilus aphrophilus endocarditis with ciprofloxacin (англ.) // Journal of Infection^[англ.] : journal. — 1992. — Vol. 24, no. 3. — P. 317—320. — doi:10.1016/S0163-4453(05)80037-4. — PMID 1602151.
• Yang X.J., Ogryzko V.V., Nishikawa J., Howard B.H., Nakatani Y. A p300/CBP-associated factor that competes with the adenoviral oncoprotein E1A (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 382, no. 6589. — P. 319—324. — doi:10.1038/382319a0. — PMID 8684459.
• Ogryzko V.V., Schiltz R.L., Russanova V., Howard B.H., Nakatani Y. The transcriptional coactivators p300 and CBP are histone acetyltransferases (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 87, no. 5. — P. 953—959. — doi:10.1016/S0092-8674(00)82001-2. — PMID 8945521.
• Jenster G., Spencer T.E., Burcin M.M., Tsai S.Y., Tsai M.J., O'Malley B.W. Steroid receptor induction of gene transcription: a two-step model (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94, no. 15. — P. 7879—7884. — doi:10.1073/pnas.94.15.7879. — PMID 9223281. — PMC 21523.
• Chen H., Lin R.J., Schiltz R.L., Chakravarti D., Nash A., Nagy L., Privalsky M.L., Nakatani Y., Evans R.M. Nuclear receptor coactivator ACTR is a novel histone acetyltransferase and forms a multimeric activation complex with P/CAF and CBP/p300 (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — Vol. 90, no. 3. — P. 569—580. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80516-4. — PMID 9267036.
• Spencer T.E., Jenster G., Burcin M.M., Allis C.D., Zhou J., Mizzen C.A., McKenna N.J., Onate S.A., Tsai S.Y., Tsai M.J., O'Malley B.W. Steroid receptor coactivator-1 is a histone acetyltransferase (англ.) // Nature : journal. — 1997. — Vol. 389, no. 6647. — P. 194—198. — doi:10.1038/38304. — PMID 9296499.
• Takeshita A., Cardona G.R., Koibuchi N., Suen C.S., Chin W.W. TRAM-1, A novel 160-kDa thyroid hormone receptor activator molecule, exhibits distinct properties from steroid receptor coactivator-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 44. — P. 27629—27634. — doi:10.1074/jbc.272.44.27629. — PMID 9346901.
• Korzus E., Torchia J., Rose D.W., Xu L., Kurokawa R., McInerney E.M., Mullen T.M., Glass C.K., Rosenfeld M.G. Transcription factor-specific requirements for coactivators and their acetyltransferase functions (англ.) // Science : journal. — 1998. — Vol. 279, no. 5351. — P. 703—707. — doi:10.1126/science.279.5351.703. — PMID 9445475.
• Puri P.L., Sartorelli V., Yang X.J., Hamamori Y., Ogryzko V.V., Howard B.H., Kedes L., Wang J.Y., Graessmann A., Nakatani Y., Levrero M. Differential roles of p300 and PCAF acetyltransferases in muscle differentiation (англ.) // Molecular Cell^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 1, no. 1. — P. 35—45. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80005-2. — PMID 9659901.
• Ogryzko V.V., Kotani T., Zhang X., Schiltz R.L., Howard T., Yang X.J., Howard B.H., Qin J., Nakatani Y. Histone-like TAFs within the PCAF histone acetylase complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 94, no. 1. — P. 35—44. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81219-2. — PMID 9674425.
• Randhawa G.S., Bell D.W., Testa J.R., Feinberg A.P. Identification and mapping of human histone acetylation modifier gene homologues (англ.) // Genomics : journal. — 1998. — Vol. 51, no. 2. — P. 262—269. — doi:10.1006/geno.1998.5370. — PMID 9722949.
• Benkirane M., Chun R.F., Xiao H., Ogryzko V.V., Howard B.H., Nakatani Y., Jeang K.T. Activation of integrated provirus requires histone acetyltransferase. p300 and P/CAF are coactivators for HIV-1 Tat (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 38. — P. 24898—24905. — doi:10.1074/jbc.273.38.24898. — PMID 9733796.