CTBP1

С-конец связывающий белок 1, известный также как CtBP1  — белок, кодируемый у человека геном CTBP1^[1].

C-концевой связывающий белок 1
PDB представлено на основе 1hku.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1MX3, 4LCE
Идентификаторы
Символ	CTBP1 ; BARS
Внешние ID	OMIM: 602618 MGI: 1201685 HomoloGene: 1015 GeneCards: Ген CTBP1
Генная онтология Функция • RNA polymerase II transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding transcription factor activity • protein binding • protein C-terminus binding • transcription factor binding • oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • protein domain specific binding • protein homodimerization activity • NAD binding • repressing transcription factor binding Компонент клетки • nucleus • transcription factor complex • nucleolus • cytosol • transcriptional repressor complex Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • Golgi organization • negative regulation of cell proliferation • viral genome replication • positive regulation of histone deacetylation • regulation of transcription by chromatin organization • negative regulation of histone acetylation • negative regulation of transcription, DNA-templated • white fat cell differentiation • regulation of cell cycle • oxidation-reduction process • negative regulation of histone H4 acetylation Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	1487	13016
Ensembl	ENSG00000159692	ENSMUSG00000037373
UniProt	Q13363	O88712
RefSeq (мРНК)	NM_001012614	NM_001198859
RefSeq (белок)	NP_001012632	NP_001185788
Локус (UCSC)	Chr 4: 1.21 – 1.24 Mb	Chr 5: 33.25 – 33.28 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Функция

Белок CtBP1 первоначально был идентифицирован как человеческий белок, который связан с PLDLS мотивом на С-конце белков аденовируса E1A.Этот и родственный ему белок CTBP2 являются транскрипционными корепрессорами^[2]. Это регуляторные белки, которые связываются с сайт-специфичными ДНК-связывающими белками и помогают выключить ген. Они осуществляют это путём рекрутирования гистон-модифицирующих ферментов, которые деактивируют гистоны и убирают метки активации. Белки CtBP могут также самоассоциироваться и, предположительно, собирать генные комплексы^[3].

CtBP1 широко экспрессируется на всех стадиях развития: от эмбриона до взрослого организма, а CtBP2 экспрессируется в более узком диапазоне возрастов. Эти белки имеют множество биологических функций, и, по-видимому, важны для регуляции эпителиального-мезенхимного перехода, а также влияния на метаболизм. Влияние на метаболизм они оказывают, связывая NADH, но плохо связывая NAD+. Таким образом эти белки чувствительны к соотношению NAD+/NADH. Связавшись с NADH, они подвергаются конформационным изменениям, что позволяет им образовывать димер и взаимодействовать беками-партнёрами, осуществляя сайленсинг специфических генов.

В процессе развития скелета и Т-лимфоцитов, CtBP1 и CtBP2 ассоциируются с PLDLSL-доменом δEF1 - гомеодоменным цинковым пальцем, и тем самым повышать δEF1-зависимый сайленсинг транскрипции. CtBP также связывает Крюппель-подобные факторы семейства белков цинкового пальца KLF3, KLF8 и KLF12. Кроме того, CtBP и CTIP образуют комплекс весом 125 кДа, который распознает совершенно разные белковые мотивы CtBP. CTIP связывается с BRCT-повтором гена рака молочной железы BRCA1, что позволяет CtBP влиять на активность BRCA1. Оба белка также могут взаимодействовать с комплексом белков группы polycomb, который участвует в регуляции экспрессии генов в процессе развития. Ген подвергается альтернативному сплайсингу и существует в виде нескольких транскриптов^[4].

Взаимодействия

CTBP1, как было выявлено, взаимодействует с:

• ACTL6B,^[5]
• ARF,^[6]
• EVI1^[7][8]
• FOXP2,^[9]
• HDAC1,^[10][11][12]
• IKZF1,^[13]
• IKZF4,^[14]
• KLF3,^[2]
• KLF8,^[15]
• Mdm2,^[16]
• MLL,^[17]
• NRIP1,^[18][19]
• Pinin,^[20]
• RBBP8,^[1][21] и
• TGIF.^[11]

Примечания

1. Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd J.M., Chinnadurai G. Interaction between a cellular protein that binds to the C-terminal region of adenovirus E1A (CtBP) and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — April (vol. 273, no. 15). — P. 8549—8552. — doi:10.1074/jbc.273.15.8549. — PMID 9535825.
2. Turner J., Crossley M. Cloning and characterization of mCtBP2, a co-repressor that associates with basic Krüppel-like factor and other mammalian transcriptional regulators (англ.) // EMBO J. : journal. — 1998. — September (vol. 17, no. 17). — P. 5129—5140. — doi:10.1093/emboj/17.17.5129. — PMID 9724649. — PMC 1170841.
3. Chinnadurai G. CtBP, an unconventional transcriptional corepressor in development and oncogenesis (англ.) // Mol. Cell^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 9, no. 2. — P. 213—224. — doi:10.1016/S1097-2765(02)00443-4. — PMID 11864595.
4. Entrez Gene: CTBP1 C-terminal binding protein 1  (неопр.).
5. Oma Y., Nishimori K., Harata M. The brain-specific actin-related protein ArpN alpha interacts with the transcriptional co-repressor CtBP (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.^[англ.] : journal. — 2003. — February (vol. 301, no. 2). — P. 521—528. — doi:10.1016/S0006-291X(02)03073-5. — PMID 12565893.
6. Paliwal S., Pande S., Kovi R.C., Sharpless N.E., Bardeesy N., Grossman S.R. Targeting of C-Terminal Binding Protein (CtBP) by ARF Results in p53-Independent Apoptosis (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2006. — March (vol. 26, no. 6). — P. 2360—2372. — doi:10.1128/MCB.26.6.2360-2372.2006. — PMID 16508011. — PMC 1430274.
7. Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. Interaction of EVI1 with cAMP-responsive element-binding protein-binding protein (CBP) and p300/CBP-associated factor (P/CAF) results in reversible acetylation of EVI1 and in co-localization in nuclear speckles (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — November (vol. 276, no. 48). — P. 44936—44943. — doi:10.1074/jbc.M106733200. — PMID 11568182.
8. Izutsu K., Kurokawa M., Imai Y., Maki K., Mitani K., Hirai H. The corepressor CtBP interacts with Evi-1 to repress transforming growth factor beta signaling (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2001. — May (vol. 97, no. 9). — P. 2815—2822. — doi:10.1182/blood.V97.9.2815. — PMID 11313276.
9. Li S., Weidenfeld J., Morrisey E.E. Transcriptional and DNA Binding Activity of the Foxp1/2/4 Family Is Modulated by Heterotypic and Homotypic Protein Interactions (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 809—822. — doi:10.1128/MCB.24.2.809-822.2004. — PMID 14701752. — PMC 343786.
10. Zhang C.L., McKinsey T.A., Lu J.R., Olson E.N. Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) contributes to transcriptional repression of the MEF2 transcription factor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — January (vol. 276, no. 1). — P. 35—9. — doi:10.1074/jbc.M007364200. — PMID 11022042.
11. Melhuish T.A., Wotton D. The interaction of the carboxyl terminus-binding protein with the Smad corepressor TGIF is disrupted by a holoprosencephaly mutation in TGIF (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — December (vol. 275, no. 50). — P. 39762—39766. — doi:10.1074/jbc.C000416200. — PMID 10995736.
12. Sundqvist A., Sollerbrant K., Svensson C. The carboxy-terminal region of adenovirus E1A activates transcription through targeting of a C-terminal binding protein-histone deacetylase complex (англ.) // FEBS Lett.^[англ.] : journal. — 1998. — June (vol. 429, no. 2). — P. 183—188. — doi:10.1016/S0014-5793(98)00588-2. — PMID 9650586.
13. Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros interactions with CtBP reveal a repression mechanism that is independent of histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — June (vol. 275, no. 26). — P. 19594—19602. — doi:10.1074/jbc.M000254200. — PMID 10766745.
14. Perdomo J., Crossley M. The Ikaros family protein Eos associates with C-terminal-binding protein corepressors (англ.) // Eur. J. Biochem.^[англ.] : journal. — 2002. — December (vol. 269, no. 23). — P. 5885—5892. — doi:10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x. — PMID 12444977.
15. van Vliet J., Turner J., Crossley M. Human Krüppel-like factor 8: a CACCC-box binding protein that associates with CtBP and represses transcription (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2000. — May (vol. 28, no. 9). — P. 1955—1962. — doi:10.1093/nar/28.9.1955. — PMID 10756197. — PMC 103308.
16. Mirnezami A.H., Campbell S.J., Darley M., Primrose J.N., Johnson P.W., Blaydes J.P. Hdm2 recruits a hypoxia-sensitive corepressor to negatively regulate p53-dependent transcription (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 2003. — July (vol. 13, no. 14). — P. 1234—1239. — doi:10.1016/S0960-9822(03)00454-8. — PMID 12867035.
17. Xia Z.B., Anderson M., Diaz M.O., Zeleznik-Le N.J. MLL repression domain interacts with histone deacetylases, the polycomb group proteins HPC2 and BMI-1, and the corepressor C-terminal-binding protein (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — July (vol. 100, no. 14). — P. 8342—8347. — doi:10.1073/pnas.1436338100. — PMID 12829790. — PMC 166231.
18. Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavaillès V. Multiple domains of the Receptor-Interacting Protein 140 contribute to transcription inhibition (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2004. — Vol. 32, no. 6. — P. 1957—1966. — doi:10.1093/nar/gkh524. — PMID 15060175. — PMC 390375.
19. Perissi V., Scafoglio C., Zhang J., Ohgi K.A., Rose D.W., Glass C.K., Rosenfeld M.G. TBL1 and TBLR1 Phosphorylation on Regulated Gene Promoters Overcomes Dual CtBP and NCoR/SMRT Transcriptional Repression Checkpoints (англ.) // Mol. Cell^[англ.] : journal. — 2008. — March (vol. 29, no. 6). — P. 755—766. — doi:10.1016/j.molcel.2008.01.020. — PMID 18374649. — PMC 2364611.
20. Alpatov R., Munguba G.C., Caton P., Joo J.H., Shi Y., Shi Y., Hunt M.E., Sugrue S.P. Nuclear Speckle-Associated Protein Pnn/DRS Binds to the Transcriptional Corepressor CtBP and Relieves CtBP- Mediated Repression of the E-Cadherin Gene (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2004. — December (vol. 24, no. 23). — P. 10223—10235. — doi:10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004. — PMID 15542832. — PMC 529029.
21. Li S., Chen P.L., Subramanian T., Chinnadurai G., Tomlinson G., Osborne C.K., Sharp Z.D., Lee W.H. Binding of CtIP to the BRCT repeats of BRCA1 involved in the transcription regulation of p21 is disrupted upon DNA damage (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — April (vol. 274, no. 16). — P. 11334—11338. — doi:10.1074/jbc.274.16.11334. — PMID 10196224.

Литература

• Chinnadurai G. CtBP, an unconventional transcriptional corepressor in development and oncogenesis (англ.) // Mol. Cell^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 9, no. 2. — P. 213—224. — doi:10.1016/S1097-2765(02)00443-4. — PMID 11864595.
• Schaeper U; Boyd JM; Verma S; Uhlmann, E; Subramanian, T; Chinnadurai, G. Molecular cloning and characterization of a cellular phosphoprotein that interacts with a conserved C-terminal domain of adenovirus E1A involved in negative modulation of oncogenic transformation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 23. — P. 10467—10471. — doi:10.1073/pnas.92.23.10467. — PMID 7479821. — PMC 40632.
• Boyd JM; Subramanian T; Schaeper U; La Regina, M; Bayley, S; Chinnadurai, G. A region in the C-terminus of adenovirus 2/5 E1a protein is required for association with a cellular phosphoprotein and important for the negative modulation of T24-ras mediated transformation, tumorigenesis and metastasis (англ.) // EMBO J. : journal. — 1993. — Vol. 12, no. 2. — P. 469—478. — PMID 8440238. — PMC 413230.
• Schaeper U; Subramanian T; Lim L; Boyd, JM; Chinnadurai, G. Interaction between a cellular protein that binds to the C-terminal region of adenovirus E1A (CtBP) and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 15. — P. 8549—8552. — doi:10.1074/jbc.273.15.8549. — PMID 9535825.
• Sundqvist A., Sollerbrant K., Svensson C. The carboxy-terminal region of adenovirus E1A activates transcription through targeting of a C-terminal binding protein-histone deacetylase complex (англ.) // FEBS Lett.^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 429, no. 2. — P. 183—188. — doi:10.1016/S0014-5793(98)00588-2. — PMID 9650586.
• Fuks F., Milner J., Kouzarides T. BRCA2 associates with acetyltransferase activity when bound to P/CAF (англ.) // Oncogene : journal. — 1998. — Vol. 17, no. 19. — P. 2531—2534. — doi:10.1038/sj.onc.1202475. — PMID 9824164.
• Sewalt RG; Gunster MJ; van der Vlag J; Satijn, DP; Otte, A.P. C-Terminal Binding Protein Is a Transcriptional Repressor That Interacts with a Specific Class of Vertebrate Polycomb Proteins (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 1. — P. 777—787. — PMID 9858600. — PMC 83934.
• Li S; Chen PL; Subramanian T; Chinnadurai, G; Tomlinson, G; Osborne, CK; Sharp, ZD; Lee, W.H. Binding of CtIP to the BRCT repeats of BRCA1 involved in the transcription regulation of p21 is disrupted upon DNA damage (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 16. — P. 11334—11338. — doi:10.1074/jbc.274.16.11334. — PMID 10196224.
• Postigo A.A., Dean D.C. ZEB represses transcription through interaction with the corepressor CtBP (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 12. — P. 6683—6688. — doi:10.1073/pnas.96.12.6683. — PMID 10359772. — PMC 21975.
• Criqui-Filipe P., Ducret C., Maira S.M., Wasylyk B. Net, a negative Ras-switchable TCF, contains a second inhibition domain, the CID, that mediates repression through interactions with CtBP and de-acetylation (англ.) // EMBO J. : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 12. — P. 3392—3403. — doi:10.1093/emboj/18.12.3392. — PMID 10369679. — PMC 1171419.
• Holmes M; Turner J; Fox A; Chisholm, O; Crossley, M; Chong, B. hFOG-2, a novel zinc finger protein, binds the co-repressor mCtBP2 and modulates GATA-mediated activation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 33. — P. 23491—23498. — doi:10.1074/jbc.274.33.23491. — PMID 10438528.
• Furusawa T., Moribe H., Kondoh H., Higashi Y. Identification of CtBP1 and CtBP2 as Corepressors of Zinc Finger-Homeodomain Factor δEF1 (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 12. — P. 8581—8590. — PMID 10567582. — PMC 84984.
• Yu X., Baer R. Nuclear localization and cell cycle-specific expression of CtIP, a protein that associates with the BRCA1 tumor suppressor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 24. — P. 18541—18549. — doi:10.1074/jbc.M909494199. — PMID 10764811.
• Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros interactions with CtBP reveal a repression mechanism that is independent of histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 26. — P. 19594—19602. — doi:10.1074/jbc.M000254200. — PMID 10766745.
• Melhuish T.A., Wotton D. The interaction of the carboxyl terminus-binding protein with the Smad corepressor TGIF is disrupted by a holoprosencephaly mutation in TGIF (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 275, no. 50. — P. 39762—39766. — doi:10.1074/jbc.C000416200. — PMID 10995736.
• Zhang C.L., McKinsey T.A., Lu J.R., Olson E.N. Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) contributes to transcriptional repression of the MEF2 transcription factor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 1. — P. 35—9. — doi:10.1074/jbc.M007364200. — PMID 11022042.
• Izutsu K; Kurokawa M; Imai Y; Maki, K; Mitani, K; Hirai, H. The corepressor CtBP interacts with Evi-1 to repress transforming growth factor beta signaling (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2001. — Vol. 97, no. 9. — P. 2815—2822. — doi:10.1182/blood.V97.9.2815. — PMID 11313276.
• Palmer S; Brouillet JP; Kilbey A; Fulton, R; Walker, M; Crossley, M; Bartholomew, C. Evi-1 transforming and repressor activities are mediated by CtBP co-repressor proteins (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 28. — P. 25834—25840. — doi:10.1074/jbc.M102343200. — PMID 11328817.
• Schuierer M; Hilger-Eversheim K; Dobner T; Bosserhoff, AK; Moser, M; Turner, J; Crossley, M; Buettner, R. Induction of AP-2alpha expression by adenoviral infection involves inactivation of the AP-2rep transcriptional corepressor CtBP1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 30. — P. 27944—27949. — doi:10.1074/jbc.M100070200. — PMID 11373277.