14 февраля 1941 г. в целях усиления противовоздушной обороны дальневосточных рубежей, воинские части и соединения, дислоцирующиеся на Дальнем Востоке, объединены в Дальневосточную зону ПВО со штабом в городе Хабаровске[1].
В августе 1942 г. на Дальнем Востоке формируются 9-я, 10-я и 11-я воздушные армии. В феврале-марте 1945 г. создаются три армии ПВО — Забайкальская, Приамурская, Приморская.
1 июня 1957 г. формируется 1-я Особая Дальневосточная воздушная армия (ОДВА), а в марте 1960 г. — 11-я отдельной армии противовоздушной обороны (ОА ПВО).
1 июня 1998 г. 1-я ОДВА и 11-й ОА ПВО объединены и образована 11-я армии ВВС и ПВО. 1 марта 2009 г. 11-я армия ВВС и ПВО переименована в 3-е Командование ВВС и ПВО. С 1 августа 2018 года вновь носит наименование 11-я армия ВВС и ПВО.
За 2009 и 2010 гг. подготовлено 8 лётчиков-снайперов, 34 лётчика 1-го класса, 71 лётчик 2-го класса, 80 лётчиков 3-го класса.
С начала Военной операции России в Сирии в сентябре 2015 года, военнослужащие объединения принимают участие в данной операции в составе Авиационной группы ВКС России. Многие награждены государственными орденами и медалями. В августе 2019 года, на территории штаба армии в Хабаровске открыт бюст Герою России Роману Филипову, погибшему в Сирии[3][4].
В составе армии авиационные и зенитные ракетные соединения и воинские части, дислоцированные на территории Дальнего Востока и Восточной Сибири. В зоне объединения воздушное пространство над 11 субъектами Российской Федерации.
18 сентября 2024 года Указом президента Российской Федерации № 805 армии присвоено почётное наименование «гвардейская» за массовый героизм и отвагу, стойкость и мужество проявленные личным составом армии в боевых действиях по защите Отечества и государственных интересов в условиях вооружённых конфликтов[5].
смешанная авиационная эскадрилья 35-й отсап в/ч 35471-2 (Камчатский край, полуостров Камчатка, Усть-Камчатский р-он, п. Ключи). Ранее 329-й осаэ войска РВСН, передан в ВВС в 2011 г. техника: 2 ед. Ан-12 (04 «Спасатель челюскинцев лётчик Светогоров»,без борт), 5 ед. Ан-26 (02, 06, 08, 10, 12), 4 ед. Ми-8АМТШ-ВА (72, 75, 76, 78)
18-я гвардейская бригада армейской авиации, в/ч 42838 (Хабаровский край, Хабаровский р-он, г. Хабаровск, аэр. Хабаровск-Центральный): 18 ед. Ка-52, 22 ед. Ми-8АМТШ, 6 ед. Ми-26. Сформирована 1 декабря 2016 года на основе 573-й авиационной базы армейской авиации (2 разряда).
отдельный вертолётный отряд 18 Бр АА, в/ч 42838-2 (Сахалинская область, о. Итуруп, п. Буревестник, аэр. Буревестник): 4 ед. Ми-8АМТШ. в начале 2017 г планировалось увеличение летного состава втрое. С 2018 года военная авиация будет использовать оба аэродрома острова — «Буревестник» и «Ясный».
112-й отдельный вертолётный полк (на основе 439-й авиационной базы армейской авиации), в/ч 78081 (Забайкальский край, Читинский р-он, г. Чита, аэр. Черемушки): 20 ед. Ми-24П, 32 ед. Ми-8АМТШ. Планировалось, перевооружение полка Ми-28НМ в 2020—2021 гг. Одновременно с этим, будут созданы 2 эскадрильи транспортно-боевых вертолётов Ми-8АМТШ.
319-й отдельный вертолётный полк, в/ч 13984 (Черниговка, аэр. Черниговка): 22 ед. Ка-52, 20 ед. Ми-8АМТШ. (сформирован на основе 575-й авиационной базы армейской авиации (2 разряда))
генерал-майорТихонов, Владимир Владимирович (09.2023 — н.в.)
Штаб дислоцируется: ул. Ленина, д. 30[10], г. Хабаровск, Хабаровский край, 680030
Пронякин К. А. Первые лётчики на Дальнем Востоке России: влетевшие в историю (справочник. 196 биографий). К 80-летию Хабаровского края, к 95-летию Гражданского Воздушного флота России и к 100-летию Восточного военного округа. Приветствия: Героя России Г. В. Жидко, С. И. Авакянца, С. И. Фургала, А. С. Николаева; предисл. Т. В. Барановой; послесл.: А. М. Будника, В. М. Куканова. — Хабаровск: ООО «МедиаМост»; РГО, 2019. —160 с., ил. (Серия: История развития авиации на Дальнем Востоке)
Коллектив авторов.Великая Отечественная. Командармы. Военный биографический словарь/Под общей ред. М. Г. Вожакина.— М.; Жуковский: Кучково поле, 2005.— С.354.— ISBN 5-86090-113-5.
А.Г.Ленский, М.М.Цыбин.Часть III//Советские Войска ПВО в последние годы Союза ССР. Справочник».— СПб,: ИНФО ОЛ, 2015.— 144 с. (с илл.)с.— (Организация войск).— 500 экз.
Управление пресс-службы и информации Министерства обороны Российской Федерации.11-я армия ВВС и ПВО(неопр.).Управление пресс-службы и информации Министерства обороны Российской Федерации.Дата обращения: 10 апреля 2016.Архивировано 21 апреля 2016 года.