TPSAB1

TPSAB1 (англ. Tryptase alpha/beta-1; Шифр КФ 3.4.21.59) — фермент триптаза, продукт гена TPSAB1^[5][6]. Триптаза бета-1 является изоферментом, экспрессированным на тучных клетках, тогда как изофермент триптаза альфа-1 преимущественно находится на базофилах^[7].

TPSAB1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1A0L, 2BM2, 2FPZ, 2FS8, 2FS9, 2FWW, 2FXR, 2GDD, 2ZA5, 3V7T,%%s1LTO, 2F9N, 2F9O, 2F9P, 2ZEB, 2ZEC, 4A6L, 4MPU, 4MPV, 4MPW, 4MPX, 4MQA, 5F03
Идентификаторы
Псевдонимы	TPSAB1, TPS1, TPS2, TPSB1, tryptase alpha/beta 1, TPSB2, Tryptase-2
Внешние ID	OMIM: 191080 MGI: 96942 HomoloGene: 55729 GeneCards: TPSAB1
Расположение гена (человек) Хр. 16-я хромосома человека[1] Локус 16p13.3 Начало 1,240,379 bp[1] Конец 1,242,554 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 17-я хромосома мыши[2] Локус 17 A3.3|17 12.53 cM Начало 25,585,279 bp[2] Конец 25,588,072 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в fundus upper lobe of left lung mucosa of transverse colon skin of leg body of stomach Наибольшая экспрессия в Ileal epithelium lactiferous gland muscle of thigh skin of back Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция peptidase activity serine-type peptidase activity связывание с белками плазмы гидролазная активность serine-type endopeptidase activity связывание похожих белков Компонент клетки внеклеточная область внеклеточный матрикс внеклеточное пространство collagen-containing extracellular matrix Биологический процесс протеолиз defense response extracellular matrix disassembly Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 7177 17229 Ensembl ENSG00000172236 ENSMUSG00000033825 UniProt P20231 Q15661 P21845 RefSeq (мРНК) NM_003294 NM_010781 RefSeq (белок) NP_077078 NP_003285 NP_034911 Локус (UCSC) Chr 16: 1.24 – 1.24 Mb Chr 17: 25.59 – 25.59 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Структура и функции

Триптазы входят в семейство S1 трипсино-подобных сериновых протеаз. Они каталитически активны в тетрамерной форме, стабилизируемой гепарином, и устойчивы к известным эндогенным ингибиторам протеаз. Несколько генов триптаз сгруппированы на хромосоме 16p13.3 и обладают некоторыми общими свойствами. Все эти гены имеют высококонсервативные участки 3' UTR и содержат тандемные повторы на 5'-конце, а их 3' UTR участок играет роль в регуляции стабильности их мРНК. Гены содержат интрон непосредственно после инициирующего Met-кодона, отделяющего Met-кодон от кодирующей белок последовательности. Такая особенность структуры гена характерна в основном только для триптаз. Ген TPSAB1 отличается множественностью аллелей, две основные из которых альфа-1 и бета-1 ранее считались различными белками^[7].

Триптаза бета-1 — основная нейтральная протеаза, присутствующая в тучных клетках. Она секретируется из клетки в ходе процесса активации-дегрануляции. Может играть роль во врождённом иммунитете. Изоформа 2 расщепляет крупные субстраты, такие как фибронектин, с большей эффективностью, чем изоформа 1 и, наоборот, менее эффективна в расщеплении небольших белковых субстратов^[8].

См. также

• Триптаза

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172236 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033825 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Miller J. S., Moxley G., Schwartz L. B. Cloning and characterization of a second complementary DNA for human tryptase (англ.) // J Clin Invest : journal. — 1990. — October (vol. 86, no. 3). — P. 864—870. — doi:10.1172/JCI114786. — PMID 2203827. — PMC 296804.
6. Pallaoro M., Fejzo M. S., Shayesteh L., Blount J. L., Caughey G. H. Characterization of genes encoding known and novel human mast cell tryptases on chromosome 16p13.3 (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1999. — February (vol. 274, no. 6). — P. 3355—3362. — doi:10.1074/jbc.274.6.3355. — PMID 9920877.
7. Entrez Gene: TPSAB1 tryptase alpha/beta 1  (неопр.).
8. Jackson N. E., Wang H. W., Bryant K. J., McNeil H. P., Husain A., Liu K. et al. Alternate mRNA splicing in multiple human tryptase genes is predicted to regulate tetramer formation (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2008. — Vol. 283, no. 49. — P. 34178—34187. — doi:10.1074/jbc.M807553200. — PMID 18854315. — PMC 2662235.

Литература

• Sommerhoff C. P., Bode W., Matschiner G., etal. The human mast cell tryptase tetramer: a fascinating riddle solved by structure (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 1477, no. 1—2. — P. 75—89. — doi:10.1016/s0167-4838(99)00265-4. — PMID 10708850.
• Kam C. M., Hudig D., Powers J. C. Granzymes (lymphocyte serine proteases): characterization with natural and synthetic substrates and inhibitors (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 1477, no. 1—2. — P. 307—323. — doi:10.1016/s0167-4838(99)00282-4. — PMID 10708866.
• Caughey G. H. New developments in the genetics and activation of mast cell proteases (англ.) // Mol. Immunol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 38, no. 16—18. — P. 1353—1357. — doi:10.1016/S0161-5890(02)00087-1. — PMID 12217407.
• Vanderslice P., Ballinger S. M., Tam E. K., etal. Human mast cell tryptase: multiple cDNAs and genes reveal a multigene serine protease family (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — Vol. 87, no. 10. — P. 3811—3815. — doi:10.1073/pnas.87.10.3811. — PMID 2187193. — PMC 53993.
• Miller J. S., Westin E. H., Schwartz L. B. Cloning and characterization of complementary DNA for human tryptase (англ.) // J. Clin. Invest. : journal. — 1989. — Vol. 84, no. 4. — P. 1188—1195. — doi:10.1172/JCI114284. — PMID 2677049. — PMC 329777.
• Schwartz L. B., Bradford T. R., Littman B. H., Wintroub B. U. The fibrinogenolytic activity of purified tryptase from human lung mast cells (англ.) // J. Immunol.^?! : journal. — 1985. — Vol. 135, no. 4. — P. 2762—2767. — PMID 3161948.
• Schwartz L. B., Lewis R. A., Seldin D., Austen K. F. Acid hydrolases and tryptase from secretory granules of dispersed human lung mast cells (англ.) // J. Immunol.^?! : journal. — 1981. — Vol. 126, no. 4. — P. 1290—1294. — PMID 7009736.
• Xia H. Z., Kepley C. L., Sakai K., etal. Quantitation of tryptase, chymase, Fc epsilon RI alpha, and Fc epsilon RI gamma mRNAs in human mast cells and basophils by competitive reverse transcription-polymerase chain reaction (англ.) // J. Immunol.^?! : journal. — 1995. — Vol. 154, no. 10. — P. 5472—5480. — PMID 7730649.
• Blom T., Hellman L. Characterization of a tryptase mRNA expressed in the human basophil cell line KU812 (англ.) // Scand. J. Immunol. : journal. — 1993. — Vol. 37, no. 2. — P. 203—208. — doi:10.1111/j.1365-3083.1993.tb01757.x. — PMID 8434231.
• Cairns J. A., Walls A. F. Mast cell tryptase is a mitogen for epithelial cells. Stimulation of IL-8 production and intercellular adhesion molecule-1 expression (англ.) // J. Immunol.^?! : journal. — 1996. — Vol. 156, no. 1. — P. 275—283. — PMID 8598474.
• Schwartz L. B., Sakai K., Bradford T. R., etal. The alpha form of human tryptase is the predominant type present in blood at baseline in normal subjects and is elevated in those with systemic mastocytosis (англ.) // J. Clin. Invest. : journal. — 1996. — Vol. 96, no. 6. — P. 2702—2710. — doi:10.1172/JCI118337. — PMID 8675637. — PMC 185977.
• Cairns J. A., Walls A. F. Mast cell tryptase stimulates the synthesis of type I collagen in human lung fibroblasts (англ.) // J. Clin. Invest. : journal. — 1997. — Vol. 99, no. 6. — P. 1313—1321. — doi:10.1172/JCI119290. — PMID 9077541. — PMC 507947.
• Xia H. Z., Du Z., Craig S., etal. Effect of recombinant human IL-4 on tryptase, chymase, and Fc epsilon receptor type I expression in recombinant human stem cell factor-dependent fetal liver-derived human mast cells (англ.) // J. Immunol.^?! : journal. — 1997. — Vol. 159, no. 6. — P. 2911—2921. — PMID 9300715.
• Thomas V. A., Wheeless C. J., Stack M. S., Johnson D. A. Human mast cell tryptase fibrinogenolysis: kinetics, anticoagulation mechanism, and cell adhesion disruption (англ.) // Biochemistry : journal. — 1998. — Vol. 37, no. 8. — P. 2291—2298. — doi:10.1021/bi972119z. — PMID 9485375.
• Pereira P. J., Bergner A., Macedo-Ribeiro S., etal. Human beta-tryptase is a ring-like tetramer with active sites facing a central pore (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 392, no. 6673. — P. 306—311. — doi:10.1038/32703. — PMID 9521329.
• Huang C., Li L., Krilis S. A., etal. Human tryptases alpha and beta/II are functionally distinct due, in part, to a single amino acid difference in one of the surface loops that forms the substrate-binding cleft (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 28. — P. 19670—19676. — doi:10.1074/jbc.274.28.19670. — PMID 10391906.
• Sommerhoff C. P., Bode W., Pereira P. J., etal. The structure of the human betaII-tryptase tetramer: fo(u)r better or worse (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 20. — P. 10984—10991. — doi:10.1073/pnas.96.20.10984. — PMID 10500112. — PMC 34230.
• Romagnani P., De Paulis A., Beltrame C., etal. Tryptase-chymase double-positive human mast cells express the eotaxin receptor CCR3 and are attracted by CCR3-binding chemokines (англ.) // Am. J. Pathol.^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 155, no. 4. — P. 1195—1204. — doi:10.1016/S0002-9440(10)65222-4. — PMID 10514402. — PMC 1867029.