TCF15

Фактор транскрипции 15 (англ. Transcription factor 15; TCF15) — ядерный белок, фактор транскрипции. Продукт гена человека TCF15^[5].

TCF15
Идентификаторы
Псевдонимы	TCF15, EC2, PARAXIS, bHLHa40, transcription factor 15 (basic helix-loop-helix), transcription factor 15
Внешние ID	OMIM: 601010 MGI: 104664 HomoloGene: 37943 GeneCards: TCF15
Расположение гена (человек) Хр. 20-я хромосома человека[1] Локус 20p13 Начало 604,257 bp[1] Конец 610,309 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 2-я хромосома мыши[2] Локус 2 G3|2 74.83 cM Начало 151,985,481 bp[2] Конец 151,991,017 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в apex of heart Skeletal muscle tissue of biceps brachii dorsal motor nucleus of vagus nerve Skeletal muscle tissue of rectus abdominis body of tongue Наибольшая экспрессия в interventricular septum myocardium of ventricle Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция ДНК-связывающий protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Компонент клетки клеточное ядро RNA polymerase II transcription regulator complex Биологический процесс somitogenesis respiratory system process ДНК-зависимая регуляция транскрипции muscle organ morphogenesis пищевое поведение neuromuscular process controlling posture regulation of transcription by RNA polymerase II skeletal system morphogenesis развитие мышечного органа ear development транскрипция, ДНК-зависимая развитие многоклеточного организма establishment of epithelial cell apical/basal polarity regulation of extracellular matrix organization post-anal tail morphogenesis Регуляция экспрессии генов развитие мезодермы anterior/posterior pattern specification развитие кожи paraxial mesoderm development mesenchymal to epithelial transition transcription by RNA polymerase II положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 6939 21407 Ensembl ENSG00000125878 ENSMUSG00000068079 UniProt Q12870 Q60756 RefSeq (мРНК) NM_004609 NM_009328 RefSeq (белок) NP_004600 NP_033354 Локус (UCSC) Chr 20: 0.6 – 0.61 Mb Chr 2: 151.99 – 151.99 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Функции

Транскрипционный фактор TCF15 — ранний регулятор транскрипции, который в ходе развития участвует в распределении мезодермы в организме. Играет роль в дифференцировке клеток мезодермального происхождения.

Структура

Белок состоит из 199 аминокислот, молекулярная масса — 20,8 кДа. Для эффективного связывания с ДНК требует образование димера с другим белком, обладающим основной структурой спираль-петля-спираль (bHLH).

Роль в сердце

Димер Meox2/Tcf15 может регулировать экспрессию белков, участвующих в метаболизме жирных кислот в сердце, скелетных мышцах и жировой ткани. В частности димер регулирует в этих тканях экспрессию CD36 и липопротеинлипазы^[6].

См. также

• Факторы транскрипции

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125878 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000068079 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Entrez Gene: Transcription factor 15  (неопр.). Дата обращения: 9 ноября 2017. Архивировано 4 июня 2016 года.
6. Coppiello G., Collantes M., Sirerol-Piquer M. S., Vandenwijngaert S., Schoors S., Swinnen M. et al. Meox2/Tcf15 heterodimers program the heart capillary endothelium for cardiac fatty acid uptake (англ.) // Circulation^[англ.] : journal. — Lippincott Williams & Wilkins^[англ.], 2015. — Vol. 131, no. 9. — P. 815—826. — doi:10.1161/CIRCULATIONAHA.114.013721. — PMID 25561514.

Литература

• Guo P., Zhao K. W., Dong X. Y., Sun X., Dong J. T. Acetylation of KLF5 alters the assembly of p15 transcription factors in transforming growth factor-beta-mediated induction in epithelial cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2009. — Vol. 284, no. 27. — P. 18184—18193. — doi:10.1074/jbc.M109.007096. — PMID 19419955. — PMC 2709394.
• Coppiello G., Collantes M., Sirerol-Piquer M. S., Vandenwijngaert S., Schoors S., Swinnen M., Vandersmissen I., Herijgers P., Topal B., van Loon J., Goffin J., Prósper F., Carmeliet P., García-Verdugo J. M., Janssens S., Peñuelas I., Aranguren X. L., Luttun A. Meox2/Tcf15 heterodimers program the heart capillary endothelium for cardiac fatty acid uptake (англ.) // Circulation^[англ.] : journal. — Lippincott Williams & Wilkins^[англ.], 2015. — Vol. 131, no. 9. — P. 815—826. — doi:10.1161/CIRCULATIONAHA.114.013721. — PMID 25561514.