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superfilo de microorganismos unicelulares do domínio Archaea. Da Wikipédia, a enciclopédia livre
DPANN é um superfilo de Archaea, inicialmente proposto em 2012,[2] que agrupa os microorganismos conhecidos por nanoarchaea ou Archaea ultra-pequenos devido ao seu pequeno tamanho (nanométrico) em comparação com outros membros do agrupamento Archaea. Muitos membros apresentam sinais de transferência horizontal de genes a partir de outros domínios biológicos.[2]
Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota, Nanohaloarchaeota DPANN | |||||
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Classificação científica | |||||
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Filos[1] | |||||
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DPANN é um acrónimo formado pelas iniciais dos primeiros cinco grupos descobertos, os agrupamentos taxonómicos presentemente conhecidos por Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota e Nanohaloarchaeota. Mais tarde, a circunscrição taxonómica do grupo fi alargada para incluir os agrupamentos Woesearchaeota e Pacearchaeota, entretanto descobertos e propostos para integração no superfilo DPANN.[3] Em 2017, outro filo, os Altiarchaeota, foi colocado neste superfilo. [4]
Após estas alterações de circunscrição, a monofilia de DPANN ainda não é considerada estabelecida, devido à alta taxa de mutação dos filos incluídos, o que pode levar ao artefato da atração de ramo longo (LBA), onde as linhagens são agrupados basalmente ou artificialmente na base da árvore filogenética sem serem filogeneticamente relacionadas.[5][6] Essas análises sugerem que DPANN pertence ao clado Euryarchaeota ou então é polifilético ocupando várias posições dentro de Euryarchaeota.[5][6][7]
O clado DPANN agrupa diferentes filos com uma grande variedade de distribuição ambiental e de metabolismo, variando de formas simbióticas e termofílicas, como Nanoarchaeota, e acidófilos, como Parvarchaeota, até não-extremófilos, como Aenigmarchaeota e Diapherotrites. A presença de membro do agrupamento DPANN também foi detectado em águas subterrâneas ricas em nitrato, na superfície da água, mas não em profundidade, indicando que esses táxons ainda são difíceis de localizar.[8]
Os membros deste agrupamento são caracterizados por serem pequenos em tamanho em comparação com outros Archaea (tamanho nanométrico) e de apresentarem um genoma muito pequeno. Em consequência, são caracterizados por capacidades catabólicas limitadas, mas suficientes para levar uma vida livre, embora muitos sejam epissimbiontes que dependem de uma associação simbiótica ou parasitária com outros organismos. Muitas de suas características são semelhantes ou análogas às de bactérias ultrapequenas (grupo CPR).[3]
As capacidades metabólicas limitadas são um produto do pequeno genoma e são refletidas no facto de que muitos não possuem vias biossintéticas centrais para nucleotídeos, aminoácidos e lípidos. Em condequência, a maioria das archaea DPANN, como o grupo conhecido por ARMAN, depende de outros micróbios para satisfazer as suas necessidades biológicas. Mas aqueles que têm potencial para viver livremente são fermentativos e aeróbicos heterotróficos.[3]
Apesar das grandes variações que coexistem dentro do grupo, a maioria destes organismos são principalmente anaeróbicos e não podem ser cultivados. Ocorrem em ambientes extremos, como organismos termofílicos, hiperacidofílicos, hiperhalofílicos ou resistentes a metais, embora muitas espécies ocorram também no ambiente temperado de sedimentos marinhos e lacustres. Estes microorganismos são raramente encontrados no solo ou em mar aberto.[3]
A taxonomia correntemente usada para o grupo, baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[9] e do National Center for Biotechnology Information (NCBI), é a seguinte:[10]
Filogenia GTDB dos "DPANN"[11][12][13] | ||
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Uma descrição resumida dos agrupamentos presentemente considerados como significativos é a seguinte:
Essa estrutura conduz à seguinte taxonomia do superfilo DPANN:Rinke et al. 2013
Tom A. Williams et al. 2017,[24] Castelle et al. 2015[3] e Dombrowski et al. 2020.[25] | Jordan et al. 2017[7] Cavalier-Smith2020[6] e Feng et al 2021.[26] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DPANN pode ser o primeiro clado divergente de Archaea de acordo com algumas análises filogenéticas. Análises filogenéticas recentes encontraram a seguinte filogenia entre os filos:[3][24][25]
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Outras análises filogenéticas sugeriram que DPANN poderia pertencer a Euryarchaeota ou que pode até ser polifilético, ocupando diferentes posições dentro de Euryarchaeota. Também é questionado se o filo Altiarchaeota deve ser classificado em DPANN ou integrado em Euryarchaeota.[25][5] Os grupos marcados entre aspas são linhagens atribuídas ao DPANN, mas separadas filogeneticamente das demais. Uma localização alternativa para DPANN na árvore filogenética é a seguinte:[7][6][26]
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