Pożywka SOC

Pożywka SOC (z ang. super optimal catabolite repression) – kompletna, bogata pożywka do mikrobiologicznej hodowli bakterii, w szczególności do wydajnej hodowli bakterii E. coli poddanych transformacji plazmidowej - do lepszego podtrzymania ich po tym procesie, co wpływa dodatnio na jego efektywność^[1].

Po raz pierwszy użyta i opisana w 1983 w pracy Douglasa Hanahana, podczas jego badań nad transformacją bakterii plazmidami^[2].

Pożywka SOB (z ang. super optimal broth), także używana w celu lepszego podtrzymania kultur bakteryjnych po transformacji, jest pierwotną wersją pożywki SOC. Pożywka SOC jednak, w przeciwieństwie do SOB, zawiera dodatkowo glukozę, która jest katabolicznym represorem plazdmiów z promotorem laktozowym - używanych w transformacjach bakterii.

Pożywki SOC i SOB zawierają rozpuszczone w wodzie bidestylowanej: ekstrakt (lizat) z drożdży, trypton oraz NaCl, KCl i sole magnezu. Pożywki takie zawierają w ten sposób wszystkie niezbędne do wzrostu aminokwasy, czyli źródło azotu (z tryptonu i lizatu), a także witaminy i mikroelementy (z lizatu drożdżowego). Sól (NaCl) zapewnia odpowiednią osmotyczność środowiska i jony sodu niezbędne do transportu błonowego, a jony potasowe i magenzowe pomagają szybko przywrócić równowagę osmotyczną oraz zależne od niej procesy oparte na tych jonach, zwykle mocno wytrącone z równowagi w procesie transformacji. Gotowe pożywki mają żółtawo-słomkową barwę i są przezroczyste.

Skład[2]

SOC

• 2% (w/o) trypton
• 0,5% (w/o) ekstrakt drożdżowy
• 0,05% (w/o) NaCl
• 2,5 mM KCl
• 10 mM MgCl₂
• 10 mM MgSO₄
• 20 mM sterylnej glukozy
• w wodzie bidestylowanej

Pożywkę SOC sterylizuje się przed dodaniem glukozy, żeby uniknąć ich rozkładu podczas ogrzewania z aminokwasami (lub peptydami) na drodze reakcji Maillarda.

SOB

• 2% (w/o) trypton
• 0,5% (w/o) ekstrakt drożdżowy
• 0,05% (w/o) NaCl
• 2,5 mM KCl
• 10 mM MgCl₂
• 10 mM MgSO₄
• w wodzie bidestylowanej

Sole magnezu dodaje się w obu przypadkach po sterylizacji termicznej pożywek. Gotowa pożywka ma pH pomiędzy 6,8-7^[2]. Do regulacji pH można dodać do pożywki SOC i SOB wodorotlenek sodu^[3][4]. Niektóre protokoły opisują pożywki bez soli magnezu^[3][4] lub magnez jest tylko w postaci siarczanu^[5].

Przypisy

1. 1.76-1.81; Appendix 2. W: Joseph Sambrook, E. F. Fritsch, Tom Maniatis: Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory, 1989. ISBN 0-87969-309-6. Brak numerów stron w książce
2. Hanahan D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids.. „Journal of molecular biology”. 4 (166), s. 557–80, czerwiec 1983. PMID: 6345791.
3. SOC medium. Chang Bioscience. [dostęp 2009-03-18]. (ang.).
4. SOB medium. Chang Bioscience. [dostęp 2009-03-18]. (ang.).
5. SOC Medium. Sigma-Aldrich Co. [dostęp 2009-03-18]. (ang.).