Het Canisius-Wilhelmina Ziekenhuis ontstond uit een fusie tussen het katholieke Canisiusziekenhuis en het protestantse Wilhelminaziekenhuis. In 1974 was de Stichting Nijmeegs Interconfessioneel Ziekenhuis Canisius-Wilhelmina een feit. Sinds 1992 is het CWZ gehuisvest aan de Weg door Jonkerbos.
Canisiusziekenhuis
Het Canisiusziekenhuis is in 1850 gesticht door het Rooms Katholiek Parochiaal Armbestuur dat zich het lot van de katholieke Nijmeegse zieken en armen aantrok. Het Canisiusziekenhuis was destijds gevestigd in de Nijmeegse binnenstad op de hoek van de Houtmarkt en de Pauwelstraat. Nadat het ziekenhuis op diverse locaties in de Nijmeegse binnenstad gehuisvest geweest was kon men in 1922 een stuk grond kopen aan de Sint Annastraat. Op die plek werd een voor die tijd modern en groot ziekenhuis gebouwd, ontworpen door Eduard Cuypers.
Wilhelminaziekenhuis
Het Wilhelminaziekenhuis werd op 7 mei1895 geopend aan de Dr. Claas Noorduijnstraat. Architect van het gebouw was Derk Semmelink. In dit gebouw was verpleeghuis Margriet gevestigd. Inmiddels is dit afgebroken ten behoeve van onder andere woningbouw.
Poliklinieken
Het CWZ heeft per 12 december 2008 een polikliniek in Oosterhout (Nijmegen), een onderdeel van de Waalsprong, alsmede, per 27 juli 2012, een polikliniek in Druten.[1]
Juli 2017 namen dermatolgie en plastische chirurgie hun intrek in een nieuwe polikliniek Jonkerbosch achter het ziekenhuis.