From Wikipedia, the free encyclopedia
DrugBank е сеопфатна, слободно достапна, интернет база на податоци што содржи информации за лекови и цели на одредени лекови. Исто како биоинформатичките и хеминформатичките ресурси, DrugBank комбинира податоци за детална лекови (односно хемискa, фармаколошкa и фармацевтскa) со сеопфатна цел на лековита (т.е. низа, структура и пат на крвоток) и информации за нејзината улога. DrugBank користела содржина од Википедија. Википедија, исто така, честопати се поврзува со DrugBank.
Содржина | |
---|---|
Опис | база на податоци (лекови/дрога) |
Заведени видови податоци | Хемиски структури, лекови за мали молекули, биотехнолошки лекови, цели на лекови, транспортери на лекови, низа на наркотични лекови, СНП на лекови, метаболити на лекови, описи на лекови, здруженија на болести, дозирни податоци, интеракции со храна и лекови, несакани реакции на лекови, фармакологија, механизми на дејствување , метаболизам на лекови, хемиска синтеза, податоци за патенти и цени, хемиски својства, номенклатура, синоними, хемиска таксономија, спектар на лекови NMR, спектар на лекови GC-MS, спектар на лекови LC-MS |
Контакт | |
Истраж. центар | Универзитетот Алберта |
Лабораторија | Доктор Давид Висхарт |
Пристап | |
Мреж. место | drugbank.ca |
URL за преземање | drugbank.ca/downloads |
Алатки | |
Разно |
Најновото издание на базата на податоци (верзија 5.0) содржи 9591 записи за лекови вклучувајќи 2037 ситно-молекуларни лекови одобрени од ФДА, 241лекови одобрени од ФДА кои се биотехнички (белковини / пептидни), 96 нутриционистички лекови и над 6000 експериментални лекови. Покрај тоа, 4270 секвенци кои не се редундантни белковини (т.е. целни / ензими / транспортерни / носителни) секвенци се поврзани со овие записи на лекови. Секој запис на DrugCard содржи повеќе од 200 полиња со податоци со половина од информациите кои се посветени на податоците за лекови / хемикалии, а другата половина посветена на податоците за целта на лекот или податоци за белковините.
Четири дополнителни бази на податоци, HMDB, T3DB, SMPDB и FooDB се исто така дел од генералниот опфат на метаболички/хеминиформатски бази на податоци. HMDB содржи еквивалентни информации за повеќе од 40 000 човечки метаболити, T3DB содржи информации за 3100 вообичаени токсини и загадувачи на животната средина, SMPDB содржи дијаграми на патеки за скоро 700 човечки метаболички патеки и патеки на болести, додека FooDB содржи еквивалентни информации за 28,000 компоненти за храна и додатоци на храна.
Првата верзија на DrugBank беше објавена во 2006 година. Оваа рана објавена верзија содржеше релативно скромни информации за 841 ситно молекуларни лекови одобрени од ФДА и 113 биотехнолошки лекови. Исто така, вклучуваше 2133 информации за цели на лекови. Втората верзија на DrugBank беше објавена во 2009 година.[1] Оваа значително била проширена и подобрена верзија на базата на податоци која опфаќала 1344 одобрени лекови за ситни молекули и 123 лекови за биотехника, како и 3037 уникатни цели на лековите. Верзијата 2.0 исто така, за првпат вклучуваше повлечени лекови и недозволена лекови, широките интеракции на храна-лекови и лекови-лекови, како и параметрите ADMET (апсорпција, дистрибуција, метаболизам, екскреција и токсичност). Верзијата 3.0 беше објавена во 2011 година.[2] Оваа верзија содржи 1424 одобрени ситно молекуларни лекови и 132 биотехнолошки лекови, како и повеќе од 4000 уникатни цели за лекови. Верзијата 3.0 исто така вклучуваше податоци за транспортер на лекови, податоци за патека на лекови, цени на лековите, патенти и податоци за производство, како и податоци за повеќе од 5000 експериментални лекови. Верзијата 4.0 беше објавена во 2014 година.[3] Оваа верзија вклучуваше 1558 молекуларни лекови одобрени од ФДА, 155 лекови/лекови за биотехника и 4200 уникатни цели на одредени лекови. Верзијата 4.0 исто така опфати широки информации за метаболити на лекови(структури и реакции), таксономија на лекови, спектар на лекови, постојани врски со лекови и информации за синтеза на. Табела 1 дава поцелосно статистичко резиме на историјата и развојот на „DrugBank“.
Category | 1.0 | 2.0 | 3.0 | 4.0 |
---|---|---|---|---|
бр. на податочни полиња од DrugCard | 88 | 108 | 148 | 208 |
бр. на видови пребарувања | 8 | 12 | 16 | 18 |
бр. на илустирани илоги на лекови | 0 | 0 | 168 | 232 |
бр. на лекови со метаболизирачки ензимски податоц | 0 | 0 | 762 | 1.037 |
бр. на метаболити на лекови со структури | 0 | 0 | 0 | 1.239 |
бр. на реакции на метаболизам на лекови | 0 | 0 | 0 | 1.308 |
бр.на илустрирани патеки на метаболизам на лекови | 0 | 0 | 0 | 53 |
бр. на лекови со податоци за транспортер на лекови | 0 | 0 | 516 | 623 |
бр. на лекови со информации за класификација на таксономијата | 0 | 0 | 0 | 6.713 |
бр. на ефекти на лекови поврзани со СНП | 0 | 0 | 113 | 201 |
бр. на лекови со податоци за патенти / цени / производител | 0 | 0 | 1.208 | 1.450 |
бр. на храна-лекови интеракции | 0 | 714 | 1.039 | 1.180 |
бр. на лекови-лекови интеракции | 0 | 13,242 | 13,795 | 14,150 |
бр. на параметрите ADMET (Caco-2, LogS) | 0 | 276 | 890 | 6.667 |
бр. на QSAR параметри од лекови | 5 | 6 | 14 | 23 |
бр. на лекови со постојани податоци за врзување на лекови | 0 | 0 | 0 | 791 |
бр. на лекови со спектар на NMR | 0 | 0 | 0 | 306 |
бр. на лекови со спектар на МС | 0 | 0 | 0 | 384 |
бр. на лекови со информации за хемиска синтеза | 0 | 38 | 38 | 1.285 |
бр. на лекови одобрени од ФДА за ситни молекули | 841 | 1.344 | 1.424 | 1.558 |
бр. на биотехнолошки лекови | 113 | 123 | 132 | 155 |
бр. на нутриционистички лекови | 61 | 69 | 82 | 87 |
бр. на повлечени лекови | 0 | 57 | 68 | 78 |
бр. на забранета лекови | 0 | 188 | 189 | 190 |
бр. на експериментални лекови | 2.894 | 3.116 | 5.210 | 6.009 |
бр. на експериментални и ФДА ситно молекуларни лекови | 3.796 | 4.774 | 6.684 | 7.561 |
бр. на експериментални ФДА лекови (сите видови) | 3.909 | 4.897 | 6.816 | 7.713 |
бр. на цел на лекови(уникатни) | 2.133 | 3.037 | 4.326 | 4.115 |
бр. на ензими / носители на одобрени лекови(уникатни) | 0 | 0 | 164 | 245 |
бр. на сите ензими / носители на лекови (уникатни) | 0 | 0 | 169 | 253 |
бр. на надворешни врски со бази на податоци | 12 | 18 | 31 | 33 |
Сите податоци во DrugBank се не-комерцијални или се добиени од не-комерцијален извор. Таа е слободно достапна и достапна за секого. Покрај тоа, скоро секоја ставка на податоци е целосно следлива и експлицитно се упатува на оригиналниот извор. Податоците за DrugBank се достапни преку јавен веб-интерфејс и преземања.
Корисниците можат да ја побараат DrugBank на неколку начини:
Корисниците можат да преземат избрани компоненти на текст и податоци за низа од DrugBank и да ги следат најновите вести за DrugBank преку редовни извори на вести преку своето мрежно место, како и преку Twitter и Facebook.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.