시트로박터(Citrobacter)는 장내세균과에 속하는 세균의 속이다. 그람 음성균이며 대장균류에 포함된다.
이 속에 포함되는 종인 시트로박터 아말로나티쿠스(C. amalonaticus), 시트로박터 코세리(C. koseri), 시트로박터 프룬디(C. freundii)는 시트르산만 탄소 공급원으로 사용하고도 생존할 수 있다. 시트로박터에 속하는 종들은 트립토판을 인돌로 변환시키는 능력, 락토스 발효 능력, 말론산염 사용 능력에 따라 분류된다. 시트로박터 코세리는 인돌 양성인 유일한 시트로박터 균이며, 동시에 락토스 발효 가능 세균이다.[1]
시트로박터 세균들은 토양, 물, 폐수 등 거의 모든 곳에서 발견할 수 있다. 사람의 창자에서도 찾아볼 수 있다. 질병의 원인이 되는 것은 드물지만, 위장관계와 배설계 질환이나 영아의 수막염과 패혈증의 원인이 될 수 있다.[3][4]
시트로박터 프룬디 균주는 암피실린과 1세대 세팔로스포린 항생제에 대한 내성을 유발하는 유전자인 ampC 유전자를 도입 가능하다. 그 외에도 시트로박터는 플라스미드에 의해 암호화되는 항생제 내성 유전자로 인해 다른 많은 항생제에도 내성을 가질 수 있다.
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