リボヌクレアーゼ4

リボヌクレアーゼ4(Ribonuclease 4)は、ヒトではRNASE4遺伝子がコードする酵素である^[5][6]。

RNASE4
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 1RNF, 2RNF
識別子
記号	RNASE4, RAB1, RNS4, Ribonuclease 4, ribonuclease A family member 4
外部ID	OMIM: 601030 MGI: 1926217 HomoloGene: 10576 GeneCards: RNASE4
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 14番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 20,684,560 bp[1] 終点 20,701,216 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 14番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 51,328,534 bp[2] 終点 51,343,608 bp[2]
遺伝子オントロジー 分子機能 • ヌクレアーゼ活性 • エンドヌクレアーゼ活性 • ribonuclease activity • 加水分解酵素活性 • ribonuclease A activity • 核酸結合 細胞の構成要素 • 細胞外領域 生物学的プロセス • mRNA cleavage • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	6038	58809
Ensembl	ENSG00000258818	ENSMUSG00000021876
UniProt	P34096	Q9JJH1,Q8C7E4
RefSeq (mRNA)	NM_194431 NM_001282192 NM_001282193 NM_002937 NM_194430	NM_021472 NM_201239
RefSeq (タンパク質)	NP_001269121 NP_001269122 NP_002928 NP_919412	NP_067447 NP_957691
場所 (UCSC)	Chr 14: 20.68 – 20.7 Mb	Chr 14: 51.33 – 51.34 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
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この遺伝子によってコードされるタンパク質は、膵リボヌクレアーゼファミリーに属する。伝令RNAの切断において重要な役割を果たし、ウリジンの3'側に高い特異性を持つ。異なったスプライシングにより、同じタンパク質をコードする2つの転写変異体が存在する。この遺伝子とアンギオゲニンをコードする遺伝子は、プロモーターと5'エクソンを共有している。それぞれの遺伝子は、完全なコーディング領域を含む固有の下流エクソンにスプライシングする。

出典

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000258818 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021876 - Ensembl, May 2017
3. Human PubMed Reference:
4. Mouse PubMed Reference:
5. Rosenberg HF, Dyer KD (Jan 1996). “Human ribonuclease 4 (RNase 4): coding sequence, chromosomal localization and identification of two distinct transcripts in human somatic tissues”. Nucleic Acids Res 23 (21): 4290-5. doi:10.1093/nar/23.21.4290. PMC 307382. PMID 7501448. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC307382/.
6. “Entrez Gene: RNASE4 ribonuclease, RNase A family, 4”. 2016年5月26日閲覧。

関連文献

• Shapiro R, Fett JW, Strydom DJ, Vallee BL (1987). “Isolation and characterization of a human colon carcinoma-secreted enzyme with pancreatic ribonuclease-like activity.”. Biochemistry 25 (23): 7255-64. doi:10.1021/bi00371a002. PMID 3467790.
• Seno M, Futami J, Tsushima Y, et al. (1995). “Molecular cloning and expression of human ribonuclease 4 cDNA.”. Biochim. Biophys. Acta 1261 (3): 424-6. doi:10.1016/0167-4781(95)00040-n. PMID 7742370.
• Zhou HM, Strydom DJ (1993). “The amino acid sequence of human ribonuclease 4, a highly conserved ribonuclease that cleaves specifically on the 3' side of uridine.”. Eur. J. Biochem. 217 (1): 401-10. doi:10.1111/j.1432-1033.1993.tb18259.x. PMID 8223579.
• Egesten A, Dyer KD, Batten D, et al. (1997). “Ribonucleases and host defense: identification, localization and gene expression in adherent monocytes in vitro.”. Biochim. Biophys. Acta 1358 (3): 255-60. doi:10.1016/S0167-4889(97)00081-5. PMID 9366257.
• Terzyan SS, Peracaula R, de Llorens R, et al. (1999). “The three-dimensional structure of human RNase 4, unliganded and complexed with d(Up), reveals the basis for its uridine selectivity.”. J. Mol. Biol. 285 (1): 205-14. doi:10.1006/jmbi.1998.2288. PMID 9878400.
• Xu XR, Huang J, Xu ZG, et al. (2002). “Insight into hepatocellular carcinogenesis at transcriptome level by comparing gene expression profiles of hepatocellular carcinoma with those of corresponding noncancerous liver.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (26): 15089-94. doi:10.1073/pnas.241522398. PMC 64988. PMID 11752456. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC64988/.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899-903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC139241/.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.”. Nat. Genet. 36 (1): 40-5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). “The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).”. Genome Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC528928/.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). “Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network.”. Nature 437 (7062): 1173-8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514.