Francisco Martínez ha iniziato a giocare a calcio a 5 nel Coronel Escurra insieme al fratello gemello Hugo[1]. Nell'estate del 2015 passa al Cerro Porteño con cui vince, nel 2016, la Coppa Libertadores: si tratta della prima volta per una squadra non brasiliana. Oltre che nel campionato paraguaiano, Martínez ha giocato anche in quello campionato argentino, indossando le maglie di Barracas Central e San Lorenzo. Con la Nazionale maschile di calcio a 5 del Paraguay ha disputato tre edizioni della Copa América e due Coppe del Mondo[2][3].
