Candidatus

A prokariótanevezéktanban a Candidatus (röviden Ca., a „római hivatal jelöltje” jelentésű latin szóból) a jól leírt, de még nem tenyésztett prokariótataxonok megnevezésére használt szó.^[1] A modern szekvenálási módszerek, például a 16S-rRNS-szekvenálás vagy a metagenomika az elemzett élőlényekről több információt nyújtanak, és lehetővé teszik egyes fajok azonosítását és leírását. Azonban a legtöbb faj nem tenyészthető, így in vitro tanulmányban nem jellemezhető. Ezek újabb felfedezése a Candidatustörzs-radiációhoz vezetett, mely a bakteriális diverzitás új ismereteivel bővítette az életfát.

Osztódó Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum-sejtek pásztázó elektronmikroszkóp alatt (c). Krioelektron-tomográfia egy sejtről (d). Fehér nyilak jelzik a nagy membránvezikulumokat. A vonal 1 μm (c) és 500 μm (d).

Nevezéktan

Történet

Az eredeti Nemzetközi Prokarióta-nevezéktani Kódex (ICNP) és korai változatai nem vették figyelembe a még tenyészthetetlen prokarióták azonosítását. Ezért a Candidatust a NEmzetközi Prokarióta-rendszertani Tanács (ICSP, korábban Nemzetközi Rendszertani Bakteriológiai Társaság, ICSB) 1994-es konferenciáján javasolták a kódexmódosítás indítványozásához.^[2] A szekvenálási technológiák fejlődése révén növekvő Candidatus-taxon-szám révén az ICSP a Nemzetközi Prokarióta-nevezéktani Kódexbe 1996-ban hozzáadott egy függeléket a Candidatus-taxonokról^[3] (a legújabb kiadásban 11. függelék).^[4] Azonban a Candidatus-taxonok nevezéktanát a kódex továbbra se tartalmazza, ezért viták és tervezetek jelentek meg a kódex megváltoztatására a Candidatus-taxonok elsődlegességének biztosításához.^[5][6]

Példa

A Desulforudis audaxviator baktérium teljes tudományos neve Candidatus Desulforudis audaxviator. A baktériumot egy dél-afrikai aranybányában fedezték fel, 2,8 km mélyen, 60 °C-os hőmérsékleten, anaerob, radioaktív környezetben él, laboratóriumi szaporítása nem megoldott.

Jegyzetek

1. Stackebrandt, E. (2002. május 1.). „Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52 (3), 1043–1047. o. DOI:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223.^{[halott link]}
2. Murray, R. G. E. (1994. január 1.). „Taxonomic Notes: A Proposal for Recording the Properties of Putative Taxa of Procaryotes” (angol nyelven). International Journal of Systematic Bacteriology 44 (1), 174–176. o. DOI:10.1099/00207713-44-1-174. ISSN 0020-7713. PMID 8123559.
3. Tindall, Brian J. (2006. november 1.). „Valid publication of names of prokaryotes according to the rules of nomenclature: past history and current practice” (angol nyelven). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56 (11), 2715–2720. o. DOI:10.1099/ijs.0.64780-0. ISSN 1466-5026. PMID 17082418.
4. (2019. január 1.) „International Code of Nomenclature of Prokaryotes: Prokaryotic Code (2008 Revision)” (angol nyelven). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 69 (1A), S1–S111. o. DOI:10.1099/ijsem.0.000778. ISSN 1466-5026. PMID 26596770.
5. Oren, Aharon (2020). „Lists of names of prokaryotic Candidatus taxa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (7), 3956–4042. o. DOI:10.1099/ijsem.0.003789. ISSN 1466-5026. PMID 32603289.
6. (2019. július 1.) „Proposal for changes in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes: granting priority to Candidatus names” (angol nyelven). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 69 (7), 2174–2175. o. DOI:10.1099/ijsem.0.003419. ISSN 1466-5026. PMID 31066658.