Il était le dernier enfant du comte Charles-Guillaume de Merode-Westerloo et de Marie, princesse de Grimberghe. Il partagea les opinions patriotiques et religieuses de ses trois frères, Henri, Félix et Frédéric, et déplorait comme eux la politique du gouvernement néerlandais. En 1830 le comte Werner de Merode fut envoyé au Congrès national par l’arrondissement de Louvain. Il fit partie de la délégation chargée de recevoir le régent Surlet de Chokier et de l’introduire dans l’assemblée et vota pour l’élection du prince Léopold de Saxe-Cobourg comme roi des Belges. En 1831, les électeurs de Louvain l’envoyèrent siéger à la Chambre des représentants, dont il fit partie jusqu’à sa mort. Dès son entrée à la chambre, il avait renoncé à son indemnité parlementaire. Il mourut subitement, frappé d’apoplexie au moment où il sortait de l’église d’Everberg (près de Louvain), après avoir assisté à la procession. En 1837, Werner de Merode avait été nommé chevalier de l’ordre de Léopold.
Le comte Werner de Merode épousa en 1818 la comtesse Victoire de Spangen Uyternesse (1799-1845) et eut sept enfants de cette union.
Louis Ghislain de Merode (1821-1876), sénateur belge, se maria avec Anne de Rochechouart-Mortemart (1833-1921). Il créa la Fondation de Merode, qui devint plus tard le Centre d'Œuvre de Merode
Werner de Merode (1855-1914), sénateur belge, Grand Maître de la Maison Royale et qui se maria avec Pauline de la Rochefoucauld (1859-1928)
Louis de Merode (1882-1949), devenu Prince en 1929, président de l'Association de la Noblesse de Belgique et qui se maria avec Élisabeth De Moustier (1892-1983)
Werner de Merode (1914-1995)(de), ambassadeur de Belgique, qui épousa Mathilde Rolin (1925-2005).
Louis de Merode qui épousa Barbara Gail
Bertrand de Merode qui épousa Martine Smetryns
Jean de Merode (1864-1933), devenu Prince in 1928, grand maréchal de la cour, épouse la princesse Marie-Louise de Bauffremont Courtenay (1874-1955)