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Trypanites est une trace fossile en forme de cylindre étroit formée par une inclusion dans un substrat solide comme une coquille, une roche ou des sédiments solidifiés.
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Les plus anciennes sont datées du Cambrien mais les plus fréquentes remontent à l'Ordovicien, et il s'en forme encore de nos jours. Elles se rencontrent fréquemment dans le calcaire, probablement en raison de l'acide produit par les organismes qui en sont responsables et qui dissout le carbonate de calcium.
†Trypanites Mägdefrau, 1932 est aussi un genre fossile représenté par l'espèce †Trypanites vadazi Vitális (d), 1961 aujourd'hui synonyme de †Teredolites clavatus Leymerie (d), 1842[1].
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