L'équipe Scooby-Doo décide d'arrêter son activité de résolution de mystères et de vendre ses souvenirs y compris la Mystery Machine. Durant la vente, une boule de cristal s'illumine et les met en contact avec Vincent Von Spectre qui a besoin de leur aide pour capturer le treizième fantôme que Sammy, Daphné et Scooby-Doo n'ont pas capturé par le passé.
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Titre original: Scooby-Doo! and the Curse of the 13th Ghost
Titre français: Scooby-Doo et la Malédiction du treizième fantôme
Scooby-Doo et la Malédiction du treizième fantôme (DVD-9 Keep Case) sorti le édité par Warner Bros. et distribué par Warner Home Vidéo France. Le ratio écran est en 1.78:1 panoramique 16:9. L'audio est en Français, Anglais, Allemand, Norvégien et Suédois 5.1 Dolby Digital avec sous-titres en français, néerlandais, danois, finlandais, norvégien et suédois. En supplément deux dessins animés vintage de Scooby-Doo: A tous les fantômes que j'ai aimés et Drôle d'horreur-scope. La durée du film est de 79 minutes. Il s'agit d'une édition Zone 2 Pal[2].
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Scrappy-Doo est absent du film, de plus, Fred et Véra semble ne jamais l'avoir rencontré quant Flim Flam parle de lui lors de ses retrouvailles avec Scooby-Doo, Sammy et Daphné alors que le neveu de Scooby était présent avec le Scooby-Gang dans la série Scooby-Doo et Scrappy-Doo.
Frisson et Chair de poule sont absents eux aussi.
L'absence de Fred et Véra dans Les Treize Fantômes de Scooby-Doo est expliquée car ils avaient quitté le Scooby-Gang temporairement lors de l'été où Sammy, Scooby et Daphné sont partis pour Honolulu avec Scrappy. Notons que dans le film, Fred et Véra rencontrent Flim Flam pour la première fois.
Vincent Von Spectre a une personnalité différente par rapport à la série et il n'a plus de blanc dans les yeux comme Daphné et Flim Flam.
Flim Flam a bien grandi et il est devenu un jeune homme.
Lors de ses retrouvailles avec ses amis, Flim Flam voit Sammy avec son traditionnel t-shirt vert pour la première fois et il fait référence à ses t-shirts rouges qu'il portait dans la série.
La plupart des objets que le Scooby-Gang vend dans leur vide-grenier provient de divers mystères qu'ils ont résolus par le passé comme le fait que le costume du Fantôme de l'espace de Scooby-Doo, où es-tu? (saison 1 épisode 15) s'y trouve.
La raison pour laquelle la traque du treizième fantôme n'a pas eu lieu dans la série n'est pas expliquée.
Le rôle habituel des membres du Scooby-Gang est considérablement modifié par rapport à d'habitude. Fred perd toute assurance et joue le rôle de faire-valoir alors que Daphné prend la place de leader au point d'éclipser tous ses partenaires (elle est de loin le personnage qui apparaît le plus à l'écran, a le plus de dialogues et monopolise les scènes clés). Elle se révèle experte de la conduite avec boîte manuelle, du saut en parachute, du surf sur avalanche, etc. et matérialise ce nouveau rôle de premier plan par une nouvelle tenue très «femme d'action» et une nouvelle coiffure. Véra, quant à elle, va jusqu'à se mettre à croire aux fantôme.