Jérémie[1] a enfin trouvé le moyen de matérialiser sur Terre son amie virtuelle Aelita. Alors qu'ils pensaient pouvoir éteindre le supercalculateur pour mettre fin à la menace de XANA, les héros se rendent compte qu'Aelita est liée à ce dernier, et qu'éteindre l'un signifie éteindre l'autre. Jérémie se rend compte qu'un virus implanté à Aelita en est la cause, par conséquent il se met à la recherche d'un antivirus. De son côté, XANA a augmenté en puissance, ce qui lui a permis de créer de nouveaux monstres, dont la Méduse. Grâce à celle-ci, XANA a pour nouvel objectif de s'emparer de la mémoire d'Aelita afin de lui dérober les clefs de Lyoko, qui lui permettront de s'échapper du monde virtuel.
Jérémie a fabriqué des véhicules à ses amis sur Lyoko, mais en rétorsion, XANA crée un nouveau monstre: la Tarentule, nommée ainsi par Odd. Celle-ci, bien plus puissante que les autres créatures que les héros ont rencontré jusque-là, les met K.O. en deux temps trois mouvements. Jérémie a aussi profité de son temps libre pour améliorer le Super Scan, avec détection instantanée des menaces, bien plus puissant que l'ancienne version. En résumé, Aelita n'est plus obligée de rester constamment sur Lyoko, et elle peut maintenant vivre sur Terre. Elle est même inscrite au collège avec l'aide d'Odd, qui fait croire au proviseur qu'elle est sa cousine canadienne. Mais voilà que la jeune fille a des visions. Guidée par la peur et l'instinct, elle se retrouve dans une étrange maison abandonnée nommée l'Ermitage. Alertés par Jérémie, Odd, Yumi et Ulrich, guidés par Kiwi finissent par la retrouver, évanouie. Yumi et Ulrich se retrouvent alors coincés dans une pièce qui semble être la chaufferie de l'Ermitage. XANA a lancé une attaque! Odd et Aelita plongent sur Lyoko désactiver la Tour... gardée par non pas une, mais deux Tarentules.
Aelita, délaissée par ses amis et méprisée par Sissi, s'enfuit de Kadic et décide de se virtualiser sur Lyoko. Marchant dans la Forêt, elle se fait enlever par surprise par un transporteur qui l'emmène dans un territoire inexploré. Remarquant son absence aux cours de l'après-midi, Jérémie, Ulrich et Odd foncent à l'usine et retrouvent sa trace sur le territoire de la Forêt, avant qu'elle ne se fasse enlever. Croyant qu'elle est... Jérémie détecte aussitôt un faible signal qui lui fait découvrir le cinquième territoire de Lyoko. Pendant ce temps, Aelita se fait attaquer entre les murs de ce nouveau lieu par une Méduse créée par XANA, qui tente de lui voler sa mémoire. C'est à Yumi, Ulrich et Odd de jouer en se téléportant dans ce nouveau territoire inconnu pour la sauver...
À la suite de la découverte du 5e Territoire dans l'épisode précédent, nos héros souhaitent l'explorer afin de trouver de nouvelles informations pour avancer dans la lutte contre XANA. De son côté, Yumi se retrouve confrontée à la suspicion de ses parents, rentrant de plus en plus tard le soir. Elle finit par perdre leur confiance et est contrainte de rester sous leur surveillance. Le lendemain, pour éviter de lui apporter plus de problèmes, Jérémie décide de l'écarter de la mission d'exploration, ce qui déçoit la jeune fille. Le soir, Odd, Ulrich et Aelita sont virtualisés, parcourent le Territoire Forêt jusqu'à son extrémité, là où passe le transporteur. Une fois sur le 5e Territoire, le temps presse car un compte à rebours s'est soudainement déclenché, et mieux vaut trouver son chemin avant que le temps ne soit écoulé, car le mécanisme reconfigure tous les murs et salles s'ils n'activent pas à temps l'interrupteur. Étant presque arrivés à leur but, Odd et Ulrich se font dévirtualiser et Aelita se retrouve seule contre la Méduse. Autre problème, Odd et Ulrich ne sont pas rentrés sur Terre, les codes spécifiques de dévirtualisation du 5eTerritoire étant nécessaires pour pouvoir les rematérialiser. Jérémie appelle Yumi en catastrophe, qui rapplique dard-dard sur Lyoko. Aelita découvre ensuite que le 5eTerritoire est l'antre de XANA....
Un soir, au milieu de la nuit, Sissi enregistre une conversation dans le couloir entre Jérémie et Aelita où celle-ci lui parle de sa peur que l'on découvre qu'elle est virtuelle. Le lendemain, elle menace de tout dévoiler à son père le proviseur, si Ulrich ne lui raconte pas la vérité. Soudain, XANA passe à l'action en prenant le contrôle du retour vers le passé... Jérémie découvre, lors du troisième retour dans le temps de la journée, que ceux-ci renforcent la puissance de XANA et qu'il peut désormais prendre possession de n'importe quel être humain, Sissi en étant la première victime... Ulrich se charge de l'affronter pendant que les autres désactivent la Tour...
Jean-Rémi François, Sophie Decroisette, Bruno Merle
Résumé détaillé
Aelita n'arrête pas de refaire le même cauchemar chaque nuit. Elle vient en parler à Jérémie qui lui propose de retourner explorer l'Ermitage. Nos héros trouvent une poupée du nom de Monsieur Pück qui est apparemment dans les cauchemars d'Aelita depuis qu'elle est sur Terre. Plus tard, lors d'un chahut dans la classe, ils trouvent une clé cachée tombant de la poupée qui ouvre un casier de consigne de gare et y découvrent des CD-ROM cryptés contenant le journal de Franz Hopper. Mais un peu plus tard, XANA active une tour et tente de xanatifier Odd puis Ulrich, sans succès. Il réessaie avec Jérémie, cette fois avec succès. Celui-ci, sous le contrôle du programme maléfique, détruit tous les CD du journal et enlève Aelita en faisant semblant d'avoir besoin d'aller à l'infirmerie. Yumi remarque la supercherie et prévient immédiatement Odd et Ulrich. Ceux-ci tentent d'arrêter XANA-Jérémie mais se prennent une raclée. Yumi intervient alors, l'assomme, récupère Aelita et se virtualisent sur Lyoko, à l'exception d'Odd qui n'en pas fini avec le xanatifié... Une fois la Tour désactivée, Ulrich s'interroge sur le fait que XANA a échoué à le posséder lui et Odd, mais n'a eu aucun problème avec Jérémie. Yumi émet une théorie sur le fait que tous, sauf Jérémie, sont habitué à se virtualiser sur Lyoko et combattre les forces de XANA. C'est sûrement ce qui leur permet de mieux lui résister...
Aelita reçoit un beau matin de un cadeau anonyme devant sa porte, apporté par un mystérieux inconnu possédé par XANA. Elle en parle à Yumi, qui présume que c'est Jérémie qui le lui a offert pour la Saint Valentin. Elle court donc remercier Jérémie qui, pour ne pas la décevoir, fait semblant d'être bel et bien l'expéditeur. Pendant la récréation, Aelita se sent mal à l'aise et se dirige vers les toilettes. Quand soudain, le collier de XANA s'illumine et prend le contrôle de la conscience d'Aelita. De retour en classe, elle insiste auprès de Jérémie pour aller explorer seule le 5e Territoire en prétextant savoir où pourraient se trouver les codes sources qui permettraient à Jérémie de fabriquer l'antivirus. Jérémie refuse dans un premier temps en lui disant que c'est trop dangereux d'y aller seule. Aelita propose alors à Yumi de l'accompagner, ce qu'elle accepte. Jérémie fait de même et les virtualise sur Lyoko. Aelita fausse alors compagnie à Yumi et fonce avec l'Overboard en direction du territoire Banquise pour se faire voler sa mémoire par la Méduse. Commence alors une infernale course-poursuite pour Yumi, qui va devoir arrêter Aelita avant qu'il ne soit trop tard...
Une soirée DJ est organisée au collège. Mais c'est aussi le jour des examens blancs! Cependant, Odd et Sissi ont prévu d'autres projets que ceux de passer les épreuves... Un peu plus tard, Aelita, aidant William à réparer la table de mixage à platines de disques pour la soirée DJ organisée, découvre ses talents en la matière. On lui propose alors d'être le DJ, ce qu'elle accepte. Plus tard dans la soirée, Jérémie détecte une tour activée sur le Désert mais XANA le prend de vitesse et le bâillonne et le ligote dans sa chambre, par le biais de Jim xanatifié. Celui-ci se rend ensuite au gymnase et électrifie Aelita en envoyant une décharge qui court du disjoncteur à la table de mixage. Il fait mine de transporter la jeune fille inconsciente à l'infirmerie et la kidnappe jusqu'à l'usine. Aelita se retrouve alors sur le Territoire Désert, sous la surveillance d'un Mégatank en attendant l'arrivée de la Méduse. Le temps est compté pour Jérémie, Yumi, Odd et Ulrich de sauver leur amie et désactiver la Tour...
Une mission de routine sur le 5e Territoire attend nos héros. Mais Yumi est, une fois de plus, en retard. Ulrich se pose des questions à ce sujet. Une fois virtualisés, ils tombent nez-à-nez avec des Kankrelats. Pendant le combat, la Méduse surgit et attrape Yumi. Elle la relâche quelques instants plus tard, la jeune fille ressortant groggy. Jérémie décide alors d'annuler la mission et rematérialise ses amis mais, à sa grande surprise, Yumi ne réapparaît pas sur Terre. Et bien sûr, c'est le jour de la photo de classe. Odd et Ulrich devront tout mettre en œuvre pour tenter de la remplacer sous peine qu'elle se fasse exclure. Aelita et Jérémie se demandent pourquoi la Méduse a attaqué Yumi, alors que sa cible est normalement Aelita. Celle-ci a alors une idée, qui n'est pas du goût de Jérémie. Après que son plan soit tombé à l'eau, Aelita présente ses excuses mais Jérémie comprend que XANA a volé les codes séquences ADN de Yumi et les a transféré dans sa propre mémoire, soit dans l'interface de la Voûte Céleste du 5e Territoire. Mais le programme maléfique avait un objectif plus approfondi, à savoir rendre Yumi vulnérable pour atteindre plus facilement Aelita...
Le père de Yumi s'est fait licencier de son travail, ce qui risque de l'obliger, lui et sa famille, à retourner au Japon, leur pays d'origine. Si ce projet venait à se concrétiser, Yumi ne pourrait plus rester à Kadic pour aider ses amis à combattre XANA. Plus tard dans la soirée, étant en train d'écrire une lettre au président tout en écoutant la radio dans sa chambre, Ulrich entend les résultats de la Loterie Nationale, ce qui lui donne une idée: il note les numéros gagnants sur un bout de papier et file en douce à l'usine pour déclencher un retour vers le passé. Le matin de la même journée, Ulrich fait valider un ticket de loterie dans un kiosque à journaux et s'en va sonner à la porte des parents de Yumi pour leur donner ledit ticket gagnant. Pendant ce temps, Jérémie, Yumi, Aelita et Odd s'interrogent sur la façon dont le retour dans le passé a pu se produire alors que XANA n'y est pour rien, et que Jérémie avait créé un logiciel pour l'en empêcher (épisode Un Grand Jour). Jérémie soupçonne alors Ulrich et le bannit de leur bande, car chaque usage du retour dans le passé renforce la puissance de calculs et de connaissances de XANA. Celui-ci lance ensuite une attaque en xanatifiant Nicolas, le meilleur ami d'Hervé. Les héros se retrouvent en difficulté et l'aide d'Ulrich devient requise pour pouvoir désactiver la Tour...
Après un cours de MmeHertz sur la vie sociale des fourmis et après une question de Sissi sur les fourmis tueuses d'humains, Jérémie a alors une idée qu'il tente de partager avec ses amis, mais ces derniers ont d'autres projets pour l'après-midi. Jérémie prend alors l'initiative de développer seul un logiciel à l'usine, sur le modèle des fourmis tueuses. Il nomme sa création la Marabounta. Un peu plus tard, il propose à Aelita et Odd de venir sur Lyoko pour tester et observer sa création. Ces derniers acceptent et se font virtualiser. Mais la Marabounta commence alors à échapper au contrôle de Jérémie et s'en prend à Aelita, croyant qu'il s'agit d'une créature de XANA, à cause du virus que ce dernier lui a implanté. Odd et Aelita se retrouvent pourchassés par la Marabounta qui se met à recouvrir tout le territoire. C'est alors que XANA vient alors étonnamment en aide à nos héros, car lui non plus ne veut pas perdre Aelita. De son côté, Ulrich boude après avoir subi la honte de sa vie à la piscine, sous les yeux de Yumi...
Une journée banale de cours. Mais Aelita est brusquement sujette à des maux de tête et fait un malaise en plein cours de mathématiques. La jeune fille est conduite à l'hôpital. Mais dans le même temps et à l'insu des héros, un homme contrôlé par XANA perd et reprend connaissance systématiquement. Jérémie découvre qu'un gros problème menace le Supercalculateur : sa pile nucléaire à l'uranium est presque vide. Résultat, Aelita fait des arrêts cardiaques tandis que XANA essaie tant bien que mal de voler et ramener une pile nucléaire neuve par l'intermédiaire de Pierre Nanquin, un détenu dangereux en cours de transfert vers le pénitencier. Celui-ci enlève Jérémie à l'hôpital et le rend contraint à changer lui-même la pile. Mais une fois le Supercalculateur relancé, Jérémie doit alors échapper à l'homme xanatifié, redevenu un danger pour lui. Ulrich se charge de l'affronter tandis que les autres plongent sur Lyoko pour désactiver la Tour.
Depuis quelque temps, Jérémie agit de plus en plus bizarrement. En effet, il insiste pour recourir aux retours dans le temps contre l’avis de ses amis qui connaissent le danger que cela représente: XANA augmente sa puissance à chaque retour dans le passé. En menant leur petite enquête, les héros découvrent que, tenté par XANA, Jérémie a utilisé les notes de Franz Hopper pour construire une machine qui utilise les retours dans le temps pour décupler son potentiel intellectuel. Mais le procédé met la santé de Jérémie en péril, qui est emmené à l'hôpital, au moment même où XANA active une nouvelle Tour... Aelita, Ulrich, Odd et Yumi doivent sauver leur ami avant qu'il ne soit trop tard.
Ce jour-là, au collège Kadic, les élèves de 4e et 3e sont en apprentissage du «code de la route». Objectif: familiariser les adolescents avec les règles de la conduite. Ulrich et William, qui veulent briller aux yeux de Yumi, sont à couteaux tirés. Pendant ce temps, XANA a lancé une nouvelle attaque. Pour venir à bout de ses ennemis, il a réussi à matérialiser trois Krabes dans le monde réel. L'un prend d'assaut la maison de Yumi, le deuxième attaque le collège, tandis que le dernier s'occupe de l'usine. La lutte pour contrer XANA va être rude et obligera Ulrich et William à faire équipe, Odd à affronter seul un Krabe, Yumi à protéger sa famille, tandis qu'Aelita doit se virtualiser en solo pour désactiver la Tour, le chemin étant semé d'embûches...
Un matin, un des spectres de XANA s'attaque à Kiwi, le chien de Odd. Celui-ci répand un virus contagieux en mordant les élèves du collège Kadic, qui se transforment alors en zombies. Le soir, de nombreuses personnes se sont déjà fait contaminer et par conséquent encerclent le réfectoire, où se trouvent quatre de nos héros. Le groupe doit rejoindre l'usine sans se faire zombifier à leur tour, mais Odd se fait mordre. Ulrich se retrouve à protéger Sissi, qui a pris peur et s'est enfuie du réfectoire, tandis que Jérémie, Yumi et Aelita se chargent de désactiver la Tour. Mais XANA réserve quelques surprises aux deux jeunes filles sur le Désert...
Jean-Philippe D'Eperles, Sophie Decroisette, Alain Serluppus
Résumé détaillé
Jérémie invente une bombe EMP capable, par impulsion électro-magnétique, de détruire les individus possédés par XANA. Une Tour s'active sur la Banquise mais Jérémie, Aelita et Ulrich sont contraints de se rendre en cours par Jim. Yumi et Odd, qui étaient avec William, se font enlever par le proviseur, possédé par XANA. Le jeune donne l'alerte, qui remonte aux oreilles des trois autres héros. Mais voilà que Jérémie reçoit un SMS de XANA, lui ordonnant de conduire Aelita sur Lyoko afin de la livrer à la Méduse, ou bien ses deux amis seront exécutés. Malheureusement, ils auront bien du mal à se rendre à l'usine...
Après une mission sur Lyoko, nos héros se rematérialisent dans les scanners. Problème: un dysfonctionnement du programme a échangé les esprits de Yumi et Odd. Les deux amis sont obligés de s'adapter tant bien que mal à un corps qui n'est pas le leur, sous l'œil amusé du reste de la bande. Mais l'incident prend des proportions plus graves lorsque nos héros se rendent compte que les structures atomiques de Yumi et Odd sont instables et que tous deux risquent la désintégration définitive. Jérémie doit vite trouver une solution avant que l'irréparable ne se produise...
Au collège, c'est la zizanie amoureuse. Chaque membre de la bande en surprend un autre embrassant une personne proche de leur entourage. Ceci va amener Jérémie à se disputer avec Aelita. Ne comprenant pas ce qui arrive à son ami, elle s'enfuit à l'Ermitage. Jérémie finit par comprendre ce qui se passe et en informe Ulrich, Odd et Yumi. Tous partent à la recherche d'Aelita, qui est soudainement rejointe par Jérémie qui en profite pour se réconcilier avec elle et même l'embrasser. Mais quand les deux tourtereaux sortent de la maison abandonnée, Odd, Ulrich, Yumi et... Jérémie tombent nez-à-nez avec eux. Ce dernier lui explique que l'autre Jérémie est un clone polymorphe. Il est rapidement neutralisé un court instant pour que les héros puissent foncer vers l'usine, tandis qu'Odd se charge de retenir le clone. La lutte tourne rapidement à l'avantage de celui-ci, puis débarque à l'usine au moment même où Yumi se fait dévirtualiser...
Ulrich est sujet au vertige, ce qu'il n'a jamais avoué aux autres. Durant un concours d'escalade, il se fait ridiculiser sous les yeux de Yumi par William. Par conséquent, il s'en va bouder dans la forêt. Par ailleurs, lors de leur précédente mission sur le 5e Territoire, les Lyoko-Guerriers ont récupéré des données qui ont permis à Jérémie de créer l'antivirus pour libérer Aelita de XANA. Mais le programme bugue et rend la jeune fille invisible. Presque aussitôt, XANA attaque en prenant le contrôle des loups de la forêt, Yumi, Ulrich et Odd étant en grand danger. Autre problème, Aelita ne peut plus rentrer dans les tours, sa signature virtuelle ayant été modifiée par le programme bugué. D'autant plus que la Méduse approche...
J.T, un éminent journaliste, arrive au collège où il est admiré par tous les élèves. Il effectue un reportage sur l'avenir qu'offre l'école aux jeunes. Il fait irruption dans le cours de Mme Hertz et commence à interroger des élèves. D'abord subjugué par la moyenne générale de Jérémie, il cherche ensuite ceux qui ont en dessous de 8/20. Odd affirme être dans ce cas et tente également de présenter le court-métrage qu'il a lui-même réalisé, mais J.T manifeste catégoriquement son désintéressement. À la sortie du cours, le Superscan sonne et une Tour s'active dans la Montagne. Alors qu'Aelita s'en approche, elle se désactive d'elle-même. La même chose se reproduit dans la Banquise. Par conséquent, Jérémie inspecte le Supercalculateur avec Aelita. Celui-ci détecte alors la même tour activée, mais XANA lance une vraie attaque en déclenchant une tempête de neige, faisant chuter la température en dessous de −20 °C. Ulrich, Yumi et Odd devront braver la tempête afin de rejoindre l'usine.
Aelita est de nouveau sujette à des visions d'elle et de Franz Hopper. Ses amis ne comprennent pas d'où cela peut-il venir. Après le déjeuner, la classe de 4e se rend à la piscine, où Aelita a de nouvelles visions. Elle tombe dans l'eau et manque de se noyer, sauvée in extremis par Jeremy. Celui-ci lui conseille de rester dans sa chambre et prendre un peu de repos. Une fois que tout le monde ait quitté la pièce pour aller en cours, Aelita se lève et part à l'Ermitage. Ses visions persistent de plus belle. La jeune fille semble se laisser guider par ses pensées. Pendant ce temps XANA active une Tour sur le Désert. À la fin du cours, Jérémie retourne dans sa chambre et se rend compte qu'elle n'y est plus. Les héros sont virtualisés près de la Tour, un comité d'accueil se dressant face à eux. Pendant le combat, Aelita, XANA la manipulant par le biais des visions, s'éclipse vers l'extrémité du territoire et emprunte le Transporteur. Jérémie comprend que tout ceci est un piège et qu'Aelita s'est jetée elle-même dans les tentacules de la Méduse...
C'est la visite médicale au collège. Odd et Sissi expriment chacun leurs complexes physiques, tandis que Jérémie s'inquiète pour Aelita qui n'a pas de carnet de santé. C'est le moment que choisit XANA pour prendre le contrôle de Yolande, l'infirmière. Elle kidnappe la jeune fille aux cheveux roses et l'emmène à l'usine. Ulrich essaie de l'intercepter mais échoue, tandis que Jérémie décide de pixéliser Odd en activant une tour à son profit, générant un spectre qui lui confère les mêmes pouvoirs qu'un spectre de XANA, dans le but de lui permettre d'affronter Yolande. Odd s'en sort bien mais le plan de Jérémie tourne au vinaigre lorsque XANA tente de lui reprendre le contrôle de la tour. Aelita aura alors deux tours à désactiver: la première pour sauver Odd, puis la seconde pour stopper XANA-Yolande.
Après avoir lu dans le journal du collège une rumeur qui affirme que la chaufferie serait hantée par l'esprit d'un défunt ouvrier ayant construit le collège, Sissi, accompagnée de Nicolas et d'Hervé, invite Ulrich à un rituel pour invoquer ledit esprit. Mais XANA passe à l'attaque! Après avoir fait buguer le Superscan, il envoie un spectre précisément en plein milieu du rituel de Sissi. Hervé et Nicolas prennent peur et s'enfuient. Le spectre se dresse face à Sissi et Ulrich, puis réapparaît derrière ce dernier. Les deux collégiens s'enfuient à leur tour et remontent dans les chambres. Sissi se cache dans la chambre d'Odd et Ulrich pendant que ce dernier va réveiller Jérémie. Aucune tour activée détectée, pourtant le spectre est bien présent au collège et commence à attaquer les personnes qui croisent son chemin. Après avoir réveillé Aelita et essuyé une nouvelle offensive du spectre, les quatre héros filent en direction de l'usine, où Yumi les attend. Ulrich reste avec Jérémie pour le protéger du spectre tandis que les autres plongent sur Lyoko afin de trouver la Tour pour Odd, et déboguer le Superscan pour Yumi et Aelita sur le 5e Territoire.
Alors que Yumi dort, Jérémie l'appelle en lui disant que XANA a activé 5 tours en même temps. Mais lorsqu'ils arrivent au labo, une surprise de taille les attend: Franz Hopper assis aux commandes en train de désactiver les tours. Il explique aux Lyoko-Guerriers qu'il a réussi à s'échapper de Lyoko. Mais le lendemain, il décide de désactiver le Supercalculateur. Jérémie lui explique alors que XANA a transmis un virus à Aelita et que si le Supercalculateur est éteint, les deux IA s'éteindront également. Ayant analysé les états de santé des Lyoko-Guerriers, Franz diagnostique à Yumi une dégénérescence cellulaire. Celle-ci est furieuse contre Jérémie. Franz le pointe du doigt en disant qu'il a mis la vie de ses amis en danger pour les virtualiser sur Lyoko et contrer XANA. Par conséquent, il éloigne définitivement Jérémie du groupe. Mais le jeune garçon découvre que "Franz Hopper" n'est qu'un clone créé par XANA. Aelita, Odd, Ulrich et Yumi sont à sa merci et en grand danger...
Jean-Rémi François, Bruno Merle, Sophie Decroisette
Résumé détaillé
Durant l'exposition d'un court-métrage d'Odd, Sissi reçoit un choc électrique et se met tout à coup à agir et parler bizarrement. Par conséquent, Jim la conduit à l'infirmerie. Serait-ce un coup de XANA? La nuit, Sissi débarque dans la chambre de Jérémie et bredouille des paroles incompréhensibles. Ce dernier pense que Sissi essaie de lui transmettre un message... Jim les surprend et ramène Sissi à l'infirmerie. Le lendemain, la bande file à l'usine pour tenter de tirer au clair cette histoire. Ulrich et Aelita plongent sur Lyoko tandis qu'Odd et Yumi rendent visite à Sissi qui a été emmenée à l'hôpital. Sur le Territoire de la Forêt, une tour est bel et bien activée, mais elle possède un halo blanc, qui n'est pas celui que XANA utilise habituellement. Pendant ce temps, celui-ci cherche à se débarrasser de Sissi possédée en xanatifiant une infirmière. Odd et Yumi arrivent juste à temps pour la secourir. Ulrich et Aelita, étant confrontés par des Mégatanks, entreprenant de désactiver la Tour pour stopper l'entité mystérieuse qui possède Sissi. Elle n'aura que le temps de fournir des données cryptées à Jérémie avant que les monstres ne remplissent leur objectif. Aelita fausse compagnie à Ulrich et se rend sur la Banquise pour désactiver la tour infectée par XANA. Odd la rejoint alors que Yumi remonte dans le monte-charge pour repousser l'infirmière xanatifiée. Les héros découvriront par la suite que c'est Franz Hopper qui a tenté de les contacter, et qu'il souhaite leur venir en aide dans leur lutte contre XANA.
Afin de décrypter plus facilement le journal d'Hopper, Jérémie décide d'activer à nouveau une tour. Après avoir récupéré des données sur le 5e Territoire, le jeune génie s'exécute sur la Montagne. C'est le moment que choisit XANA pour agir. Il envoie un faux SMS à Odd et l'enferme dans une fosse fermée par une grille, de l'eau coulant dedans et risquant de noyer le pauvre garçon. Il crée ensuite un clone à son effigie, qui est virtualisé sur Lyoko. Celui-ci dévirtualise Yumi et s'en prend à Ulrich. Jérémie essaie de comprendre, puis découvre que le vrai Odd a été piégé. XANA essaye de prendre le contrôle de la tour que Jérémie a activé afin d'accéder à la partie sécurisée du Supercalculateur, où se trouvent ses données fondamentales. Alors que tout est perdu, Franz Hopper intervient et sauve le projet de la bande...
Jérémie a enfin découvert la vérité. XANA n'a en réalité transmis aucun virus à Aelita, mais lui a volé un fragment d'elle. Il semblerait d'ailleurs que ce fragment se trouve sur le 5eterritoire. Au réfectoire, Odd propose d'aller le récupérer le soir après les cours, puis Ulrich ajoute en disant qu'ils pourraient enfin être tranquilles et éteindre le Supercalculateur. Mais Aelita n'est pas de cet avis et quitte le réfectoire, sous le regard abasourdi de ses amis. Ce soir, c'est aussi le bal du collège! Odd part sans plus attendre à la recherche d'une cavalière tandis qu'Ulrich et Yumi gèrent leurs histoires sentimentales. De son côté, Aelita arrive à l'usine et descend à la salle du Supercalculateur et éteint celui-ci. Cherchant son amie, Jérémie la découvre évanouie devant la machine, Jérémie arrive à temps pour la rallumer et la sauver. Celle-ci lui explique qu'elle a fait ça pour stopper la menace et les sauver, eux et la Terre entière. Un peu plus tard, tous sont virtualisés sur Lyoko, prêts à remplir ce qui pourrait être leur dernière mission. Mais, approchant du but, le fragment s'avère être un leurre. La salle vole brusquement aux éclats: XANA les a piégés. Odd, Yumi et Ulrich se font dévirtualiser chacun leur tour tandis qu'Aelita se retrouve isolée sur une petite plateforme. La Méduse peut donc tranquillement lui voler sa mémoire, permettant à XANA de s'emparer les clés de Lyoko. Par conséquent, le monde virtuel commence à s'éteindre. Seule lueur d'espoir pour les héros: Franz Hopper intervient une fois de plus et sauve sa fille, en même temps qu'il fait revivre Lyoko. Aelita est libre maintenant, mais XANA l'est aussi...