De 1925 à sa mort, il dirige en outre l'Institut pontifical d'archéologie chrétienne.
(de) Johann Peter Kirsch, Die christlichen Cultusgebäude im Alterthum, Köln, Bachem, , 96p..
(de) Johann Peter Kirsch, Die päpstlichen Kollektorien in Deutschland während des XIV. Jahrhunderts, Paderborn, Schöningh, , 562p..
(de) Johann Peter Kirsch, Die Finanzverwaltung des Kardinalkollegiums im XIII. und XIV. Jahrhundert, Münster, Schöningh, , 138p. (lire en ligne).
(de) Johann Peter Kirsch, Die Acclamationen und Gebete der altchristlichen Grabschriften, Köln, Bachem, , 78p..
(de) Johann Peter Kirsch, Die christliche Epigraphik und ihre Bedeutung für die kirchengeschichtliche Forschung: Rede beim Antritt des Rektorates der Universität Freiburg, Schweiz, gehalten am 15. November 1898, Fribourg, Buchdruckerei des Werkes vom heiligen Paulus, , 37p..
(de) Johann Peter Kirsch, Die Lehre von der Gemeinschaft der Heiligen im christlichen Alterthum: eine dogmengeschichtliche Studie, Mainz, Kirchheim, , 230p. (lire en ligne).
(de) Johann Peter Kirsch, Die heilige Cäcilia in der römischen Kirche des Altertums, Paderborn, Schöningh, , 77p. (lire en ligne).
(de) Johann Peter Kirsch, Die römischen Titelkirchen im Altertum, Paderborn, Schöningh, , 224p..