Ses études se sont déroulées entre Erfurt (1446-1448), Leipzig (1448-1452) et Louvain (1453).
De 1453 à 1454: il est à Paris, inscrit comme bachalarius alterius universitatis (bachelier es arts)[2].
1455: il devient maître es arts de l'université et sociétaire du collège de Sorbonne.
1456-1460: Paris, Sorbonne, procureur de la nation allemande de la faculté des arts à quatre reprises (21.10.1456 - 16.12.1456; 26.8.1457 - 13.1.1458; 19.11.1459 - 15.1.1460; juin - ).
1478-1479: Tübingen, curé de ville et (?) professeur de théologie[3].
Durant ces années il prêche dans de nombreuses villes, notamment à Berne.
1484: Bâle, curé de la cathédrale.
1487: Bâle, entre à la chartreuse du Val-Sainte-Marguerite de Bâle à laquelle il fait don de sa collection de 283 livres dont beaucoup sont conservés actuellement à la Bibliothèque universitaire de Bâle.
En 1469, Heylin fait venir à Paris la première presse à imprimer qu'il fait installer dans des locaux dépendants de la Sorbonne, sous autorisation du roi Louis XI et qu'il place sous la conduite de trois compagnons typographes allemands dont Ulrich Gering[4]. Le premier livre publié est un recueil de lettres de Gasparin de Bergame, in-quarto de 118 feuillets, tiré à une centaine d'exemplaires (1470).
Plus tard, à Bâle, il fréquentera l'atelier de Jean Amerbach avec lequel il collabore, notamment comme éditeur, conseiller et correcteur, fort de l'expérience parisienne antérieure.
Premonitio circa sermones de conceptione gloriose virginis Marie, tiré de Meffret, Sermones de tempore et de sanctis, 1488.
Resolutorium dubiorum circa celebrationem missarum occurentium, 1492.
Autres éditions:
Resolutorium dubiorum / per … Johannem de Lapide. - Parisius: Johanne Lamberto, MCCCCCXI, II Mensis Junij - lire en ligne.
Decisiones casuum qui sacerdotibus in missarum celebratione contingere solent… per R. P. Fr. Joannem de Lapide, … nunc demum in usum atque utilitatem sacerdotum commodiore methodo per quaestiones digestae, Constantiae, 1598, 1 vol., in-12.
Libri artis logicae Porphyrii et Aristotelis cum commento magistri Iohannis de Lapide, 1495 - [Commentaire des œuvres d'Aristote, Gilbert de la Porrée, Porphyre].
Astric L. Gabriel et Gray C. Boyce, éd., Auctuarium chartularii universitatis Parisiensis, t. 6: Liber receptorum nationis anglicanae (alemaniae) universitatis parisiensis, Paris, 1964, p.294-295.
"… sanctae theologiae professor, plebanus huius loci Tuwingen…" (Astric L. Gabriel et Gray C. Boyce, éd., 'Auctuarium chartularii universitatis Parisiensis', t. 6: 'Liber receptorum nationis anglicanae (alemaniae) universitatis parisiensis', Paris, 1964, p.294-295).
Max Burckhardt, Über zwei Bücherliebhaber in Basel um die Wende des 15. zum 16. Jahrhundert (Johannes Heynlin de Lapide und Hieronymus Zscheckenbürlin) Bâle, Universitätsbibliothek, 1942.
Friedrich Sander, «Johannes Heynlin von Stein. Ein Lehrer Reuchlins» in Pforzheimer Geschichtsblätter, vol. I, Pforzheim, 1961.
Marlis Zeus, «Johannes Heynlin "a Lapide", Lehrer des Johannes Reuchlin 50 Seiten» in Johannes Reuchlin, Humanist mit Durchblick, zus. 141 Seiten mit 32 Abb., Karlsruhe, Helmesverlag, 2011, (ISBN978-3-940567-13-0).