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Ouvrages personnels
Lire les «Essais» de Montaigne, Paris, François Maspéro, 1969.
Montaigne. Que sais-je?, Paris, Gallimard, «Découvertes», 1987.
«Les Fleurs Bleues» de Raymond Queneau, Paris, Gallimard, «Foliothèque», 1991.
«Fictions» de Jorge Luis Borges, Paris, Gallimard, «Foliothèque», 1992.
Rabelais: «rire est le propre de l’homme», Paris, Gallimard, «Découvertes», 1993.
Montaigne: l’éveil de la pensée, Paris, Honoré Champion, 1995.
Montaigne, une vérité singulière , Paris, Gallimard, «L’infini», 2012.
L’art et la formule, Paris, Gallimard, «L’Infini», 2016.
Éditions
François Rabelais, La vie très horrificque du grand Gargantua, chronologie et avant-propos de V.-L. Saulnier, introduction et lexique par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Garnier-Flammarion, 1968.
François Rabelais, Pantagruel, roy des Dipsodes restitué à son naturel avec ses faictz et prouesses espoventables, chrononologie et avant-propos de V.-L. Saulnier, introduction et lexique par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Garnier-Flammarion, 1969.
François Rabelais, Le Tiers Livre des faicts et dicts héroïques du bon Pantagruel, chronologie de V.-L. Saulnier, introduction et lexique par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Garnier-Flammarion, 1970.
François Rabelais, Le Quart Livre des faicts et dicts héroïques du bon Pantagruel, chronologie de V.-L. Saulnier, introduction et lexique par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Garnier-Flammarion, 1971.
Traductions
David Leavitt, Quelques pas de danse en famille, nouvelles traduites de l’anglais (U.S.) par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Denoël, 1986.
Frances A. Yates, Astrée, le symbolisme impérial au XVIe siècle, traduit de l’anglais par Jean-Yves Pouilloux et Alain Huraut, Paris, Belin, 1989.
Frances A. Yates, Les dernières pièces de Shakespeare, une approche nouvelle, traduit de l’anglais par Jean-Yves Pouilloux, Paris, Belin, 1993.
Quentin Skinner, Les fondements de la pensée politique moderne, traduit de l’anglais par Jérôme Grossman et Jean-Yves Pouilloux, Paris, Albin Michel, 2001.
Contributions universitaires
Marie-Claire Dumas (dir.), La poésie de Philippe Jaccottet. Actes du colloque des 27-28 janvier 1985, Paris VII, Genève, Paris, Slatkine, Honoré Champion, 1986.
Marcel Bénamou et Jean-Yves Pouilloux (dir.), W ou le souvenir d'enfance: une fiction (séminaire 1986-1987), Paris VII, «Cahiers Georges Pérec», 1988.
Jean-Yves Pouilloux et Benoit Decron (dir.), Les visages de Denis Diderot, Journées Denis Diderot du 2-5 novembre 1994, Langres-Paris VII, 1994.
Olivier Pot (dir.), Poétiques d’Aubigné: actes du colloque de Genève (mai 1996), Genève, Droz, 1999.
Marie-Luce Demonet, Montaigne et la question de l’homme, études issues des conférences du Centre d’histoire de la philosophie moderne du CNRS, 4 mars 1998, Paris, PUF, «débats philosophiques», 1999.
Christine Andreucci, Jean-Yves Pouilloux et Régis Salado, L’œuvre inachevée: actes du colloque de l’Université de Pau, 12,13,14 novembre 1998, PUP, 1999.
Christiane Albert, Nadine Laporte et Jean-Yves Pouilloux, Autour de Nicolas Bouvier: résonances, journées d’études de l’UPPA (novembre 1999), Carouge-Genève, Zoé, 2002.
Jean-Yves Pouilloux et Marie-Françoise Marein (dir.) , Les voix de l’éveil. Écritures et expérience spirituelle, Paris, L’Harmattan, 2009.
Sandrine Bédouret-Larraburu et Jean-Yves Pouilloux (dir.), Jacques Ancet ou la voix traversée, Mont-de-Laval, L'Atelier du Grand Tetras, «Résonance générale - Essais pour la poétique», 2011.
Préfaces
Bernard Palissy, De l’art de terre, de son utilité, des esmaux et du feu, introduction de Jean-Yves Pouilloux, Caen, L’Échoppe, 1989.
Jean Paulhan, L’expérience du proverbe, préface de Jean-Yves Pouilloux, Paris, L’échoppe, 1993.
Raymond Queneau, Je naquis au Havre un 21 février 1903: écrits sur la ville du Havre, avant-propos de Jean-Yves Pouilloux, Paris, Gallimard, 2003.
Pierre Bonasse, L’attitude phénoménologique: notes sur la conversion et la non-dualité du regard, préface de Jean-Yves Pouilloux, Bastia, Éditions éoliennes, 2011.
Alexandre Hollan, Je suis ce que je vois. Notes sur la peinture et le dessin 1975-2015, préface de Jean-Yves Pouilloux, Érès, «Po & psy a parte», 2015.
Essais et articles
Jean-Yves Pouilloux, «Notes sur l'abbaye de Thélème», in Romantisme, n°1-2, L’imposssible unité?, 1971.
Jean-Yves Pouilloux, «Notes sur deux chapitres du Quart Livre», in Littérature, n°5, février 1972.
Jean-Yves Pouilloux et Alexandre Hollan, Le regard et l’objet, Clamecy, Joigny, Atelier Cantoisel - Musée de Clamecy, 1993.
Jean-Yves Pouilloux, «Sans titre», in Traces d’arbres: avec Alexandre Hollan, Brax, Les Cahiers de l’Atelier, 1997.
Roger Van Rogger, Portraits de femme, catalogue-hommage à Catherine Van Rogger, textes de Gérard Lahouati, Nadine Laporte, Jean-Yves Pouilloux, Éditions de Vallongues, Billère, 2001.
Jean-Yves Pouilloux et Françoise Argod-Dutard, Essais, Livre III. Montaigne, Paris, Armand Colin, 2002.
Jean-Yves Pouilloux, Voyage en Touraine sur les pas de Balzac, Rabelais, Ronsard, Léonard de Vinci, reportage de Catherine Taralon, photographies de Marc Broussard, Paris, Garde-Temps, 2002.
Jean-Yves Pouilloux (dir.), Alexandre Hollan: cahier, Bordeaux, William Blake and Co. Édit., 2008.
Noël Peacock et James J. Supple (dir.), Lire les Essais de Montaigne. Actes du Colloque de Glasgow 1997, Paris, Honoré Champion, 2001.
Valérie Fasseur, Olivier Guerrier, Laurent Jenny et André Tournon (dir.), «Éveils»: études en l’honneur de Jean-Yves Pouilloux, Paris, Classiques Garnier, 2010.
Bulletin de la Société internationale des amis de Montaigne, 2019 - 2, n°70, Hommage à Jean-Yves Pouilloux et à André Tournon, Classiques Garnier, 2020.
Sandrine Bédouret, David Diop, Valérie Fasseur, Hans Hartje, Nadine Laporte et Marie-Françoise Marein (dir.), La littérature et l'esprit. Hommage à Jean-Yves Pouilloux, Genève, Librairie Droz, 2021.
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