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Élève de Maurice Gignoux, Franck Bourdier se consacre principalement au Quaternaire, à la préhistoire, l'histoire de la géologie: Il est chef-adjoint du Service national de Muséologie des Sciences naturelles jusqu'en 1961, et directeur de laboratoire à l'Ecole Pratique des Hautes Etudes, jusqu'à sa retraite en 1980[3].
À propos de la découverte d'un couperet en quartzite dans le Bas-Dauphiné: les problèmes des industries sur galets et du Pré-Abbevillien, Paris, 1962
Coupe demi-théorique simplifiée du quaternaire des environs d'Amiens, en grande partie d'après Commont et Breuil, 1950
Évolution humaine et néoténie, 1960
Excursion dans le bassin de Paris de l'Association internationale pour l'étude du quaternaire du 18 au : étude comparée des dépôts quaternaires des bassins de la Seine et de la Somme
Geoffroy Saint-Hilaire Versus Cuvier: the campaign for paleontological evolution (1825-1838), Massachusetts Institute of Technology, 1969
Guide de l'exposition Images de fleurs, ouvrage collectif, Paris, 1954
La lutte de Geoffroy Saint-Hilaire contre Cuvier en faveur de l'évolution paléontologique (1825-1838). Texte présenté à la New Hampshire inter-disciplinary conférence on the history of geology, 1967
Lamarck et Geoffroy Saint-Hilaire face au problème de l'évolution biologique, Paris, P. U. F., 1972
La naissance de la préhistoire scientifique: Les fouilles de 1685 à Cocherel, en collaboration avec Bernard Edeine, Paris, 1965
L'art préhistorique et ses essais d'interprétation, Les Conférences du Palais de la découverte, Série D, ISSN 0573-4290; 84, Paris, Palais de la Découverte, 1962
Le bassin du Rhône au quaternaire : géologie et préhistoire, Paris, Ed. du CNRS, 1961
Le Bassin du Rhône au Quaternaire, géologie et préhistoire, en collaboration avec l'Université de Paris, 1958)
Le Bassin du Rhône au quaternaire: géologie et préhistoire. Tome 1, Texte, Paris, Centre national de la recherche scientifique, 1961
Le Bassin du Rhône au quaternaire: géologie et préhistoire. Tome 2, Figures, bibliographie, index, Paris, Centre national de la recherche scientifique, 1962
Le Quaternaire continental français: Quelques réflexions sur l'état actuel des recherches, Paris, Laboratoire de géologie quaternaire et de préhistoire, 1963
Le Quaternaire de la basse Somme: Tentative de synthèse, en collaboration avec Roger Agache et Raymond Petit, Paris, 1963
Les Glaciations et la chronologie préhistorique, Le Mans, Ch. Monnoyer, 1943
Notice sur la carrière et les travaux scientifiques de Franck Bourdier, Paris, 1948
Observations et hypothèses sur la signification de l'art paléolithique, Paris, 1960
Préhistoire de France, Nouvelle bibliothèque scientifique, ISSN 0768-1011, Paris, Flammarion, 1974
Préhistoire et linguistique: les origines du basque
Préhistoire et toponymie : le fonds bascoïde en France, 1981
Quatre étapes dans l'évolution des civilisations humaines
Quelques types de visages dans la population rurale de l'arrondissement d'Annecy d'après les fiches d'identité, 1950, 1950
Remarques sur les faunes froides du Quaternaire français antérieures au Wurm, 1954