Bacillota

Les Bacillota – anciennement Firmicutes – sont un embranchement du règne des Bacteria. Son nom provient de Bacillus qui est le genre type de cet embranchement^[1].

Bacillota

S. aureus est une célèbre espèce de l'embranchement des Bacillota

Classification

Domaine	Bacteria

Phylum

Bacillota
Gibbons & Murray 2021^[1]

Synonymes

• Endobacteria (Cavalier-Smith 1998) Cavalier-Smith 2020
• Desulfotomaculota Watanabe et al. 2019
• Bacillota Whitman et al. 2018
• Bacillaeota Oren et al. 2015
• Eurybacteria Cavalier-Smith 2006
• Posibacteria Cavalier-Smith 2002
• Eurybacteria Cavalier-Smith 1998
• Firmicutes corrig. Gibbons & Murray 1978
• Firmacutes Gibbons & Murray 1978

Il comporte de nombreux genres impliqués en pathologie humaine tels que Bacillus, Clostridium, Enterococcus, Listeria, Staphylococcus et Streptococcus, ou encore Erysipelothrix et Veillonella. Certains (Bacillus, Lactobacillus, Streptococcus etc.) sont aussi d'une importance biotechnologique et industrielle.

Taxonomie

Cet embranchement est proposé en 1978 par N. Gibbons et R. Murray sous le nom de « Firmacutes »^[1]. Il va connaître ensuite une histoire mouvementée, faite de nombreuses propositions de renommage, comme l'atteste sa longue liste de synonymes. En 2021 une publication de A. Oren et G. Garrity dans l'IJSEM^[2] valide son renommage en Bacillota conformément au code de nomenclature bactérienne (le nom de l'embranchement devant être dérivé de celui de son genre type, en l'occurrence Bacillus, par adjonction du suffixe -ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021^[3]).

Liste de classes

Classes validement publiées

Selon la LPSN (11 novembre 2022)^[4] :

• Bacilli Ludwig et al. 2010
• Clostridia Rainey 2010
• Culicoidibacteria Neupane et al. 2020
• Erysipelotrichia Ludwig et al. 2010
• Limnochordia Watanabe et al. 2015
• Negativicutes Marchandin et al. 2010
• Thermolithobacteria Sokolova et al. 2007

Classes en attente de publication valide

Selon la LPSN (11 novembre 2022)^[4] cet embranchement comprend en 2022 une classe en attente de publication valide, les « Tissierellia » Alauzet et al. 2014.

Notes et références

1. Gibbons NE & Murray RGE « Proposals Concerning the Higher Taxa of Bacteria » Int J Syst Evol Microbiol. 1978;28(1):1-6. Accès libre.
2. Oren A & Garrity GM « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(10):005056. Accès libre.
3. Oren A et al. « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(6):004851. Accès libre.
4. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 11 novembre 2022

Liens externes

• Ressource relative au vivant :
  • List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
• (en) Référence Tree of Life Web Project : Firmicutes
• (en) Référence Catalogue of Life : Firmicutes corrig. Gibbons & Murray, 1978 (consulté le 11 décembre 2020)
• (en) Référence WoRMS : Firmicutes (+ liste espèces)
• (en) Référence NCBI : Firmicutes (taxons inclus)

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