Denisov a contribué à la renaissance du clavecin, qu'il a utilisé dans plusieurs de ses compositions, comme la pièce Italian Songs (1964), sur texte d'Alexandre Blok, pour soprano, flûte, cor, violon et clavecin, la Musique de chambre pour alto, clavecin et cordes; le Concerto pour flûte, vibraphone, clavecin et cordes (1993) et le Concerto pour deux altos, clavecin et cordes.
Une partie des partitions[4] des œuvres de Edison Denisov est éditée par les éditions Billaudot.
1956-9: Soldier Ivan (russe: Иван-солдат, opéra en trois actes sur des motifs tirés de contes de fées russes
1960: Sonate pour flûte et piano
1964: Le soleil des Incas (Солнце инков — The Sun of Incas), texte de Gabriela Mistral pour soprano, flûte, hautbois, cor, trompette, deux pianos, percussion, violon et violoncelle
1964: Italian Songs, texte de Alexander Blok pour soprano, flûte, cor, violon et clavecin
1966: Les pleurs (Плачи — Lamentations), texte de chansons populaires Russes pour soprano, piano et trois percussionnistes
1968: Ode (en mémoire de Che Guevara) pour clarinette, piano et percussion
1968: Musique Romantique (Романтическая музыка — Romantic Music) pour hautbois, harpe et trio à cordes
1968: Autumn (Осень) d'après Velemir Khlebnikov pour treize voix solistes
1969: Trio à cordes
1969: Quintette de vents
1969: Silhouettes pour flûte, deux pianos et percussion
1969: Chant des Oiseaux (Пение птиц) pour piano préparé (ou clavecin) et bande
1969: DSCH pour clarinette, trombone, violoncelle et piano
1970: Two Songs d'après des poèmes de Ivan Bunin pour soprano et piano
1970: Peinture (Живопись — Painting) pour orchestre
1970: Sonate pour saxophone alto et piano
1971: Trio avec piano
1972: Concerto pour violoncelle, Sonate pour clarinette seule
1973: La vie en rouge (Жизнь в красном цвете — The Life in Red), texte de Boris Vian pour voix solo, flûte, clarinette, violon, violoncelle, piano et percussion
1974: Concerto pour piano
1974: Signes en blanc (Знаки на белом — The Sighs on White) pour piano
1982: Tod ist ein langer Schlaf (Смерть — это долгий сон — La Mort est un long sommeil) — Variations sur un canon de Haydn pour violoncelle et orchestre.
1982: Symphonie de chambre nº 1
1982: Concerto pour basson, violoncelle et orchestre
1983: Five Etudes pour basson solo
1984: Confession (Исповедь), un ballet en trois actes d'après Alfred de Musset
1985: Three Pictures after Paul Klee pour alto, hautbois, cor, piano, vibraphone et contrebasse
1986: Quatre Filles (Четыре девушки — The Four Girls), un opéra en un acte d'après Pablo Picasso
1986: Concerto pour alto
1986: Concerto pour hautbois
1986: Au plus haut des cieux, texte de Georges Bataille pour soprano et orchestre de chambre
Célestin Deliège, Cinquante ans de modernité musicale: de Darmstadt à l'IRCAM: contribution historiographique à une musicologie critique, Éditions Mardaga, Bruxelles, 2003, 1024 pages, p.336-342.
Edison Denisov, compositeur de la lumière, recueil d'articles sous la direction d'Ekaterina Kouprovskaia, CDMC, Paris, 2011, 146 pages.
