Chlorobiota

Les Chlorobiota sont un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de son genre type, Chlorobium et cet embranchement comprend des bactéries à Gram négatif anaérobies strictes.

Chlorobiota

Les Chlorobiaceae qui croissent en bas de cette colonne de Winogradsky font partie de l'embranchement des Chlorobiota

Classification LPSN

Domaine	Bacteria

Embranchement

Chlorobiota
Iino et al. 2021^[1]

Synonymes

• Ignavibacteriota Podosokorskaya et al. 2021
• Ignavibacteriota Whitman et al. 2018
• Ignavibacteraeota Oren et al. 2015
• Ignavibacteriae Podosokorskaya et al. 2013
• Chlorobi Iino et al. 2010

Historique

Cet embranchement est proposé dès 2010 par Iino sous le nom de Chlorobi pour contenir deux classes de bactéries à Gram négatifs strictement anaérobies, les classes Chlorobea et Ignavibacteria^[2]. Cette création est proposée à la suite de la description de l'espèce Ignavibacterium album isolée à Yumata (Nagano, Japon)^[2]. Il avait alors été établi que son ordre type était les Chlorobiales^[2]. En 2018, il a été proposé que le nom devienne Chlorobiota avec la classe Chlorobia comme classe type^[3].

En 2021, ce nom du phylum est effectivement publié de manière valide par Oren et Garrity après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne^[1]. Le nom d'auteur de ce phylum (Iino) et qui fait autorité, diffère volontairement du nom des auteurs de l'article de la publication valide (Oren et Garrity)^[4]. Dans le même temps, ces auteurs proposent aussi le nom de Ignavibacteriota comme nom de phylum publié de manière valide pour contenir les Ignavibacterium comme genre type^[1]. Ce dernier phylum est désormais considéré comme un synonyme hétérotypique du phylum Chlorobiota^[4].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de ce phylum Chlorobiota est la suivante : Chlo.ro.bi.o’ta N.L. neut. n. Chlorobium, genre type de ce phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chlorobiota, le phylum des Chlorobium^[2],[4].

Phylogénie

Le phylum Chlorobiota a été défini dès 2010 sur la base du séquençage de l'ARNr 16S^[2].

Liste de classes

Selon la LPSN (10 novembre 2022)^[5] :

• « Chlorobiia » corrig. Garrity & Holt 2001, publié de manière non valide
• Ignavibacteria Iino et al. 2010

Références

1. Oren et Garrity 2021, p. 2-3.
2. Iino et 2010 Iino2010, p. 1381.
3. (en) WB Whitman, A Oren, M Chuvochina, MS da Costa, GM Garrity, FA Rainey, R Rossello-Mora, B Schink, I Sutcliffe, ME Trujillo et Stefano VEntura, « Proposal of the suffix -ota to denote phyla. Addendum to 'Proposal to include the rank of phylum in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 68, n^o 3,‎ 1^er mars 2018, p. 967-969 (DOI 10.1099/ijsem.0.002593)
4. (en) « Phylum Chlorobiota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 10 novembre 2022)
5. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 10 novembre 2022

Bibliographie

• (en) Takao Iino, Koji Mori, Yoshihito Uchino, Tatsunori Nakagawa, Shigeaki Harayama et Ken-ichiro Suzuki, « Ignavibacterium album gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic anaerobic bacterium isolated from microbial mats at a terrestrial hot spring and proposal of Ignavibacteria classis nov., for a novel lineage at the periphery of green sulfur bacteria », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 60,‎ 2010, p. 1376-1382 (DOI 10.1099/ijs.0.012484-0)
• (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, n^o 10,‎ 2021, p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)

Liens externes

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