Il est élu à l'Académie des beaux-arts le , au fauteuil de Marius Constant. Sa musique a remporté de nombreux prix du disque, lors de l'enregistrement de ses œuvres, de 1968 à 2003.
Selon Antoine Goléa, Charles Chaynes est, «comme Dutilleux, un de ces excellents élèves du Conservatoire de Paris, Prix de Rome, à qui l'apprentissage académique a servi de fondement à une évolution prudente et avisée vers la réflexion et le langage de la modernité[4]».
Prix du Disque de l’Académie du disque français (1968, 1970, 1975, 1981)
Prix de la tribune internationale des compositeurs de l'UNESCO (1976)
Grand Prix du Disque de l’Académie Charles Cros (1984)
Prix musical de la SACD (1988)
Grand Prix du Disque de l’Académie du Disque français
Orphée d’Or de l’Académie du Disque Lyrique (1996, 2003)
Prix Cino del Duca de l’Institut de France (1998)
Ouvrages généraux
Apollinaire Anakesa Kululuka, Chaynes ...stéréotomie d'une passion musicale, Notre-Dame-de-Bliquetuit, Millénaire III éditions, coll. "Compositeurs-Musique de notre temps", distribution Symétrie, 2007, 257 p. (ISBN978-2-911906-14-5).
Antoine Goléa, La musique, de la nuit des temps aux aurores nouvelles, Paris, Alphonse Leduc et Cie, , 954p. (ISBN2-85689-001-6)