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Bioclipse est un logiciel de visualisation utilisé en chimie et en bio-informatique. Il est développé en langage de programmation Java sur la plateforme client riche Eclipse et est distribué sous licence open source.
Développé par | Le projet Bioclipse |
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Première version | |
Dernière version | 2.6.2 ()[1] |
Écrit en | Java |
Environnement | Multiplate-forme |
Formats lus | Chemical Markup Language, Simplified Molecular Input Line Entry Specification et International Chemical Identifier |
Type | Chemo-informatique/Bio-informatique |
Licence | Eclipse Public License |
Site web | www.bioclipse.net |
Bioclipse utilise une architecture à base de plugins qui hérite des fonctionnalités de base et des interfaces graphiques d'Eclipse, tels que le système d'aide, l'interface de mise à jour du logiciel, la gestion des préférences, le déploiement multiplate-forme, etc. Grâce à ces plugins, Bioclipse fournit de nombreuses fonctions pour la chémo- et la bio-informatique, et propose des possibilités d'extension qui permettent d'ajouter facilement de nouvelles fonctionnalités.
La première version stable de Bioclipse inclut un plugin CDK (back-end de chemo-informatique), un plugin Jmol pour la visualisation 3D et un plugin BioJava pour l'analyse de séquences. Bioclipse est développé par un consortium de laboratoires :
Ces développements ont été enrichies par de nombreuses contributions d'autres laboratoires académiques.
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