En 1828, il s'installe comme pharmacien à Nevers, où il vient d'acheter une officine.
Encouragé par le comte Hippolyte François Jaubert (1798–1874), qui lui apporte notamment son soutien financier, il publie en 1835, le Programme de la Flore du Centre de la France. Celui-ci fait le bilan des herborisations consacrées jusque-là par Boreau et Jaubert à la Nièvre et à la partie orientale du département du Cher et sollicite la contribution des botanistes locaux à la création d'une flore régionale. Les plantes récoltées à l'occasion de la publication du Programme constituent un Herbarium Nivernense aujourd'hui conservé à la bibliothèque municipale de Nevers.
Boreau est nommé directeur du jardin botanique d’Angers en 1838.
En 1840 il fait paraître la Flore du Centre de la France. Une deuxième édition, en 1849, mentionne davantage de stations et couvre une aire géographique plus étendue. La troisième édition (1857) marque, avec l’adhésion de Boreau à l’École jordanienne, une vraie rupture: les taxons y sont multipliés en dehors de toute mesure, ce qui attire de vives critiques à son auteur. Cette prise de position vaut à Boreau d’être rayé de la liste des candidats à l’Institut de France[3]. Néanmoins il demeure un formateur botaniste et aura comme élèves, les botanistes angevinsGaston Allard, Georges Bouvet ou Ernest Préaubert.
L'important herbier de Boreau, acquis par la ville d'Angers à sa mort, est conservé au muséum d'histoire naturelle de la ville. Il forme le matériel de base de l'étude de la flore du centre de la France et fait apparaitre au travers de 100 000 collectes, les échanges de Boreau avec plus de 300 correspondants. Une partie de sa collection est accessible en ligne[4].
Ses archives, achetées avec son herbier en 1875, contiennent quelques documents pédagogiques et administratifs ainsi que sa correspondance scientifique. Celle-ci regroupe 3500 lettres de 420 botanistes, elle est accessible en ligne depuis 2024[5].
1824 ‒ Promenade botanique sur les bords de la Loire. Nantes.
1827 ‒ Observations sur les enveloppes florales des végétaux monocotylédons in Mém. Soc. Linn. Paris 6:??
1827 ‒ Épître aux Linnéens in Mém. Soc. Linn. Paris 6:??
1832 ‒ Voyages aux montagnes du Morvan, suivi d'observations sur les végétaux de cette contrée. Nevers.
1833 ‒ Notes sur quelques plantes rares ou nouvelles pour la Flore française recueillies dans le département de la Nièvre in Arch. bot. (Paris) 2: 398–403 Version numérique sur Google Books
1835 ‒ Programme de la Flore du Centre de la France, suivi du Catalogue des plantes observées dans le rayon de cette flore et d'observations relatives à quelques plantes critiques. Nevers.
1836 ‒ Description de l'Euphrasia Jaubertiana, nouvelle espèce du sous-genre Odontites. in Ann. Sci. Nat. Paris, Sér. 2 6: 254–256. Version numérique sur Google Books.
1843 ‒ Note sur les tiges fasciées in Congr. Scient. Angers 2:??. Publié également en 1849 dans la Revue horticole?: 208.
1843–1853 - Notes sur les mémoires de la Société de physique et d'histoire naturelle de Genève (XIV,1843; XIX, 1849; XXIV, 1853) in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1844 - Sur l'iconographie botanique de M. Plée in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1844–1847 Notes sur quelques espèces de plantes françaises (XV, 1844; XVII, 1846; XVIII, 1847) in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1845 - Notice sur la vie et les travaux du botaniste Aubert du Petit-Thouars in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1846 - Compte rendu des travaux de la section de botanique de la sixième réunion des savants italiens en 1844 in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1847 ‒ Sur le Catalogue des plantes de l'arrondissement de Lisieux in Revue botanique 2:??
1848 - Rapport sur la nouvelle édition des recherches historiques sur l'Anjou de J.-F. Bodin in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1849 ‒ Flore du Centre de la France et du bassin de la Loire, 2eéd.. 2 volumes. Paris.
1850 - Notice sur l'Agave americana, suivie de la description de quelques plantes nouvelles in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1850 - Notice sur la vie et les travaux de P. Fleurot in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1851 - Notice sur la fontaine d'Avorin Mem. Soc. Agri., Sc. et Arts d'Angers
1851 - Notice historique sur le jardin des plantes d'Angers et sur les progrès de la botanique en Anjou in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1851 - Sur la culture de l'Apios tuberosa comparée à celle de la pomme de terre, traduction d'un mémoire italien de Moretti in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1852 - Additions à la notice historique sur le jardin des plantes de la ville d'Angers in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1853 - Notice sur la position de la villa romaine Combaristum in Mem. Soc. Agri., Sc. et Arts d'Angers
1853 - Résumé d'un rapport de la Commission spéciale de Milan, pour étudier la maladie des raisins in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1853 - Notes et observations sur quelques plantes de France in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1854 - Une excursion botanique aux environs de Chinon in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1854 ‒ Précis des principales observations sur la botanique recueillies en Maine-et-Loire dans le cours de l'année 1853. Angers.
1855 - Sur la synonymie de deux espèces d'Amaranthes in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1855 ‒ Caltha Guerangerii Bor. in Billot, Annotations à la Flore de France??: 11.
1856 - Discours d'ouverture du cours de botanique à l'École supérieure d'Angers in Bull. Soc. indus. de Maine-et-Loire
1856 ‒ Notice sur quelques espèces d'Iris in Billot, Annotations à la Flore de France??: 60.
1857 - Notice sur un ouvrage inédit de botanique de Merlet-la-Boulaie in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1857 - Notice sur les plantes recueillies en Corse par M. Revelière, avec des observations sur les espèces nouvelles in Mem. Soc. acad. de Maine-et-Loire
1858 - Deuxième notice sur les plantes recueillies en Corse in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1858 ‒ Lettre à M. Le président de la SBF (sur les floraisons tardives des arbres) in Bull. Soc. Bot. Fr. 5: 704–706. Version numérique sur Botanicus.
1859 ‒ Catalogue raisonné des plantes phanérogames qui croissent naturellement dans le département de Maine et Loire. in Mém. Soc. Acad. Maine-et-Loire 6: 5-216. Version numérique sur Gallica.
1859 - Résumé des principales herborisations faites en Maine-et-Loire en 1859 in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1859 - Notice sur la position de la station romaine Robrica in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1860 - Troisième notice sur les plantes recueillies en corse in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1861 - Histoire de l'Académie des sciences et belles-lettres d'Angers in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1861 - Précis des principales herborisations faites en Maine-et-Loire en 1860 in Mem. Soc. Acad. de Maine-et-Loire
1862 ‒ Observations sur le projet d'agrandissement du Jardin des Plantes. Angers. Partiellement publié la même année avec une introduction dans la Revue de l'Anjou, 3esérie 2:??
Patrick Matagne, «Les botanistes de l'Ouest et les «faiseurs d’espèces» (1850-1870)», Bulletin d'histoire et d'épistémologie des sciences de la vie, vol.18, no2, , p.157-168 (lire en ligne, consulté en ).
Georges Bouvet, «A. Boreau. Son autobiographie», Bulletin de la Société d'études scientifiques d'Angers, vol.25, , p.31-68 (lire en ligne, consulté en ).
Thomas Rouillard, Alexandre Boreau un naturaliste né, Camosine, les annales des pays nivernais n°177: Mémoires végétales: herbier de la Nièvre.
Philippe Candegabe et Christophe Bodin, «Matériaux pour une histoire de la botanique en Berry: les botanistes, leurs publications et leurs herbiers» (1repartie — Des origines à 1905), Symbioses, no5, , p.41–72 (ISSN0395-8957).