Le procureur suspecte Ryan d'être celui qui a tiré sur Trey. Trey finit par sortir du coma. Une nuit Julie se rend dans la chambre de Trey et lui propose 20 000 $ pour qu'il dise que Ryan a essayé de le tuer. Sandy annonce à Ryan qu'il va être arrêté. Seth, Summer, Ryan et Marissa décident alors de partir tous les quatre en mer avec le bateau de Jimmy mais Ryan est arrêté. Marissa rend visite à Trey et il revient sur sa déclaration. Ryan est libéré, et Trey quitte Newport pour Las Vegas.
Les parents d'élèves du lycée Harbor ont signé une pétition pour que Marissa et Ryan n'y soient plus scolarisés. Jimmy doit de l’argent à un usurier. Il demande Julie en mariage. Seule Marissa sera renvoyée du lycée. Kirsten sort du centre et part quelque temps vivre chez une amie rencontrée au centre de désintoxication, Charlotte Morgan, afin de ne pas replonger dans l'alcool. Taylor Townsend souhaite remplacer Marissa à la tête du comité des fêtes mais Summer ne supporte pas Taylor et contre-attaque en organisant la fête foraine. Marissa et Ryan s'y rendent mais Taylor prévient M. Hess, nouveau responsable de la discipline du lycée, de sa présence. Il prend Marissa par le bras et Ryan le frappe. Ryan est alors lui aussi exclu du lycée.
Sandy conseille à Ryan de s'éloigner de Marissa, Julie interdit à Marissa de voir Ryan ou elle la mettra en pension. Julie annonce à Marissa qu'après le mariage, la famille Cooper s'installera à Hawaï. À Harbor, M. Hess et Taylor sont sur le dos de Seth et Summer. La lecture du testament de Caleb a lieu, il souhaitait léguer sa fortune à parts égales à ses filles et sa femme, mais il était ruiné. Il laisse une lettre d'excuses à Kirsten. Jimmy n'ayant pas l'argent qu'il devait à son usurier, ses hommes de mains le frappent et Jimmy fuit Newport, seul. Kirsten retourne vivre à la maison.
Marissa va à Newport Union, le lycée public de Newport. Là-bas, elle s'y fait des amis: Casey, Johnny et Chili. Ryan, lui, aura des cours particuliers. Julie et Marissa ont 48 heures pour quitter leur maison à la suite des dettes de Caleb. Marissa s'installe donc chez Summer et Julie dans un motel. Charlotte s'est rapprochée de Kirsten uniquement dans l'intention de lui soutirer de l’argent. Kirsten décide de liquider le groupe Newport mais Charlotte tente de l'en dissuader. Summer découvre que Taylor et M. Hess ont une liaison.
M. Hess ayant compromis les chances de Ryan d'aller à l'université, il souhaite arrêter les études et trouve un emploi sur un bateau. Charlotte dit à Julie qu'elle lui a acheté un appartement à son nom. Avec l’aide de Seth et Summer, Sandy contraint M. Hess de réintégrer Ryan au lycée et de quitter Newport, ou bien sa relation avec Taylor sera dévoilée à tout le monde.
Summer remarque que Marissa sa rapproche de plus en plus de Johnny et elle s'inquiète pour sa relation avec Ryan. Matt Ramsey convainc Sandy de garder le groupe Newport. Julie découvre que Charlotte est une usurpatrice. Johnny retrouve sa copine Casey en train de coucher avec un autre surfeur, Volchok. Casey avait remarqué que Johnny était en train de tomber amoureux de Marissa.
Kirsten organise une soirée caritative à la demande de Julie et Charlotte. Ces dernières ont pour intention de garder pour elles l'argent donné. Mais Julie change d'avis, elle tient trop à son amitié avec Kirsten. Ryan ayant frappé Volchok pour prendre la défense de Johnny, Volchok souhaite prendre sa revanche contre Ryan. Ryan évite la bagarre et se montre plus malin.
Ryan, Seth et Summer pensent à leur choix d'université. Sandy aimerait que Seth aille à Berkeley mais Seth voudrait s'éloigner de Newport et aller sur la côte Est. Summer voudrait rester sur la côte Ouest. Seth souhaite aller à Brown et Taylor convainc Summer d'aller à Providence, université située à 20 minutes de Brown. Marissa, toujours traumatisée après avoir tiré sur Trey, abandonne l'idée d'aller un jour à l'université mais finit par changer d'avis. Paul Glass, un ami de Sandy travaillant à Berkeley, dit à Ryan et Marissa qu'ils pourraient s'inscrire à Berkeley.
Julie et Kirsten s'associent dans un projet de restauration puis changent d'avis pour une agence de rencontre de luxe. Ryan fait un stage au groupe Newport. Summer envisage d'aller à Brown ce qui déplait à Seth dans un premier temps, Brown ne recrutant en moyenne qu'un élève d'Harbor par an. Johnny annonce à Marissa qu'il est amoureux d'elle.
Lors d'une soirée «Noellukah Bar-Mitzvahkkah» célébrant à la fois Noëllukah et une Bar-Mitzah honorifique pour Ryan, une collecte de dons est organisée pour payer l'opération du genou de Johnny, ce dernier s'étant fait renverser par une voiture.
Summer, Seth et Ryan se démènent pour la réintégration de Marissa à Harbor pour le dernier semestre. Mme Kim n'est pas contre cette idée mais il faudra convaincre le conseil d'administration. Avec l’aide de Sandy, M. Roberts et de Taylor, Marissa est réintégrée.
Kaitlin, la sœur de Marissa, est de retour à Newport. Veronica Townsend, la mère de Taylor, contraint Sandy et Kirsten de lui arranger un dîner avec Neil Roberts, le père de Summer, ce qui déplait fortement à Summer et Julie. Neil Roberts lui donne un second rendez-vous lors d'une soirée organisée par Kirsten et Julie. Afin qu'ils ne se revoient plus, Seth dit à Taylor que le docteur Roberts a des verrues génitales et elle le dit à son tour à sa mère. Veronica quitte alors la soirée avec sa fille, laissant le champ libre à Julie Cooper.
Neil Roberts propose à Julie d'organiser l'anniversaire de Kaitlin chez lui. Avant son entretien pour Brown, Seth fume un joint et ne va pas au rendez-vous. Kaitlin et Johnny se rapprochent, ce qui énerve Marissa.
Ryan fait une pause dans sa relation avec Marissa, il veut savoir où elle en est dans ses sentiments pour Johnny. Marissa souhaite rester avec Ryan et laisse une lettre à Johnny. Summer apprend que Seth n'est pas allé à son entretien avec le recruteur de Brown et découvre également qu'il se drogue. Neil Roberts dit à Julie qu'il est amoureux d'elle. Un soir, Johnny propose à Kaitlin d'aller avec lui sur la plage. Il se saoule et brûle la lettre de Marissa. Il escalade ensuite une falaise. Kaitlin, inquiète, appelle Marissa et Ryan. Ryan n'arrive cependant pas à le rattraper lorsque Johnny tombe de la falaise.
Johnny n'a pas survécu à sa chute. À l'enterrement, Ryan et Marissa font la connaissance de Sadie, la cousine de Johnny. Les conflits entre Marissa et Ryan reprennent. Kaitlin quitte Newport et retourne au collège, à Santa Barbara.
Musiques
For The Widow in Paradise, For The Fatherless in Ypsilanti - Sufjan Stevens
Alors que Ryan se trouve avec Sadie dans la maison des Harper, la police débarque et pense que la mort de Johnny n'est peut-être pas accidentelle. Ryan aide Sadie à retrouver le père de Johnny. Summer apprend par Taylor que son père sort avec Julie. Sur la falaise de laquelle Johnny est tombé, Marissa rencontre Volchok. Ryan et Marissa finissent par rompre.
Ryan invite Sadie à son anniversaire mais ne sait pas s'il doit inviter Marissa. Sandy retrouve la mère de Ryan à Albuquerque en prison et la fait libérer. Neil Roberts emmène Julie en croisière à Cabo.
Seth passe son entretien pour Brown. Taylor veut aider Summer dans sa vie sexuelle avec Seth. Jess, la petite amie de Trey, est de retour à Newport. Sandy doit faire un choix entre la construction d'un hôpital et virer Matt. Ryan se confie à Sadie. Marissa et Volchok font l'amour dans le mobil home de Julie.
Marissa sort avec Volchok et Ryan avec Sadie. Sandy décide de licencier Matt. Neil Roberts et Julie se sont fiancés lors de leur croisière. Volchok a une mauvaise influence sur Marissa et cette dernière se dispute avec Summer. Kirsten passe du temps avec Seth et l'emmène dans une de ses réunions des alcooliques anonymes. La maison des Harper étant vendue, Sadie doit repartir dans l'Oregon mais Marissa la convainc de rester.
Marissa est acceptée à Berkeley mais elle jette sa lettre. Ryan est également accepté à Berkeley. Summer est acceptée à Brown mais ce n'est pas le cas pour Seth. Seth leur fait croire qu'il est accepté à Brown. Sadie souhaite suivre Ryan jusqu'à Berkeley. Lors d'une soirée sur la plage avec tous les élèves d'Harbor, Seth dit à Summer qu'il ne veut pas aller à Brown avec elle et elle rompt. Sadie, elle, réalise qu'elle n'appartient pas au même monde que Ryan et rompt également avec lui.
Musiques
Good Day - Tally Hall
That's All I Need - The Scotland Year Gospel Choir
Ryan se rend à Albuquerque pour proposer à sa mère de venir à sa remise de diplôme. Seth dit à Summer qu'il ne l’aime plus pour que Summer parte à Brown. Marissa empêche les amis de Volchok de violer une fille.
Seth et Summer passent le week-end à Brown et Ryan et Marissa passent le week-end à Berkeley. Kirsten découvre que Theresa est maman d'un enfant de deux ans. Theresa annonce plus tard à Ryan que c'est Eddie le père. À Brown, Seth retrouve Anna. Lorsque Summer les voit ensemble, elle pense qu'Anna est la cause de leur rupture. Seth rencontre le responsable des admissions mais refuse de l’accepter à Brown. Anna l'emmène alors à la Rhode Island School of Design afin qu'il puisse y être intégré.
Anna se rend à Newport pour arranger les choses entre Seth et Summer. Pour le bal de promo, Marissa s'y rend avec Volchok, Ryan avec Theresa, Seth avec Anna, et Summer avec une star de la K-pop grâce à Taylor. Summer est complètement saoule lorsqu'elle est élue reine du bal. Marissa, quant à elle, découvre Volchok en train d'embrasser une autre fille. Seth dit enfin toute la vérité à Summer. Volchok a volé 5 000 $ à Taylor, Ryan se rend chez lui pour récupérer l'argent puis Volchok le provoque et ils se battent.
Musiques
Getting Hit On At The Bank - The Briefs
Earthquakes & Sharks - Brandston
Oregon Girl - Someone Still Loves You Boris Yeltzin
Ryan emmène Volchok à l'hôpital. Volchok menace de le dénoncer à la police s'il ne lui rend pas un service. Sandy est nommé homme de l'année, comme l'était autrefois Caleb, mais le procureur mène une enquête sur lui. Kirsten s'est remise à boire. Seth doit chercher un tableau représentant l'hôpital au siège du groupe Newport. Là-bas il fume un joint et reçoit un appel de Kirsten. Il repart en oubliant son joint, mettant ainsi le feu au bâtiment. À la soirée donnée par Kirsten faisant honneur à l'homme de l’année, Sandy annonce qu'il abandonne le projet de construction de l'hôpital et annonce qu'il collaborera avec le procureur contre Henry Griffin. Seth est ensuite arrêté à la suite de l'incendie.
Volchok demande de l’argent à Ryan pour fuir Newport, la police ayant eu le temps de l'identifier. La cérémonie de remise des diplômes a lieu. Dawn offre à Ryan une voiture. Marissa souhaite aider Ryan à se débarrasser de Volchok, avant qu'elle ne parte vivre avec son père. Ryan vend le collier que Julie avait donné à Marissa lors de sa remise de diplôme et donne l’argent à Volchok. Seth, Ryan, Summer et Marissa passent leur dernière soirée ensemble dans l'ancienne maison témoin où Ryan avait mis le feu. Seth est accepté à l'école de design pour le semestre de printemps. Ryan raccompagne Marissa mais Volchok les suit en voiture et leur fait quitter la route. Ryan et Marissa ont alors un accident. Marissa meurt dans les bras de Ryan.