En 2006, il lance deux séries aux éditions Casterman: La Guilde avec le dessinateur Oscar Martín dans la collection «Grande Ligne» (2 tomes de 2006 à 2008) et Helldorado avec le dessinateur Ignacio Noé dans la collection «Ligne d'horizon» la série s'échelonne sur 3 tomes de 2006 à 2009 et une intégrale en 2011[3] ainsi que La Chute du dragon noir, le tome 1 de Nadir, dessiné et mis en couleur par Goran Josik dans la collection «Terres de Légendes» aux éditions Delcourt en . Cet album n'aura pas de suite et la série sera abandonnée malgré la bonne critique de Serge Perraud sur SF-Mag[5]. En 2007, chez le même éditeur, il scénarise deux nouvelles séries: Les Trois Mousquetaires en collaboration avec Morvan pour le dessinateur Ruben et Souvenirs de la Grande armée dessinée par Alexis Alexander[3].
Parallèlement à ses activités de scénariste, Michel Dufranne est également chroniqueur de bande dessinée pour Le Journal du Mardi et traite de polar et science-fiction sur la RTBF, d'abord dans l’émission littéraire Mille-Feuilles[7], puis dans l'émission Livrés à domicile[3] ainsi que chroniqueur littéraire de l'émission le 6/8 tous les lundis sur La Une[8],[2], dans Entrez sans frapper sur La Première[2] et dans Sous Couverture[9] de la RTBF en janvier 2023. On peut voir de nombreuses chroniques en podcast sur Auvio.
1. Premier combat - Grendel[21], Delcourt, coll.«Ex-libris», Paris, 4 juin 2008 Scénario: Michel Dufranne - Dessin: N.B. Javier - Couleurs: Peng Wang, Studio 9 - (ISBN9782756009117)
La bible - L'Ancien Testament
Série terminée
1. La Genèse 1re partie[22], Delcourt, coll.«Ex-libris», Paris, 5 novembre 2008 Scénario: Jean-Christophe Camus, Michel Dufranne - Dessin: Damir Zitko - Couleurs: Mario - (ISBN978-2-7560-1104-2)
2. La Genèse 2e partie[23], Delcourt, coll.«Ex-libris», Paris, 6 mai 2009 Scénario: Jean-Christophe Camus, Michel Dufranne - Dessin: Damir Zitko - Couleurs: Mario - (ISBN978-2-7560-1105-9)
3. L'Exode 1re partie, Delcourt coll.«Ex-libris», Paris, novembre 2010 Scénario: Jean-Christophe Camus, Michel Dufranne - Dessin: Damir Zitko - Couleurs: Vladimir Davidenko - (ISBN978-2-7560-2013-6)
4. L'Exode 2e partie[24], Delcourt, coll.«Ex-libris», Paris, 28 novembre 2012 Scénario: Jean-Christophe Camus, Michel Dufranne - Dessin: Damir Zitko - Couleurs: Vladimir Davidenko - (ISBN978-2-7560-2677-0)
Michel Dufranne (interviewé par Sonia Romero), «Michel Dufranne: "J'ai l'impression que tout est fait pour nuire aux indépendants"», L'Écho, (lire en ligne, consulté le ).
Laurent Boileau, «Souvenirs de la Grande Armée T1: 1807 - Il faut venger Austerlitz! – par Dufranne, Alexander & Fernandez - Delcourt», ActuaBD, (lire en ligne, consulté le ).
Michel Dufranne (interviewé par Xad), «Michel Dufranne, le chroniqueur qui aime les mauvais genres», RTBF, (lire en ligne, consulté le )
Michel Dufranne (interviewé par Nicolas Anspach), «Michel Dufranne: "L’adaptation d’un roman en BD est une question de choix, d’évidence et d’équilibre"», ActuaBD, (lire en ligne, consulté le )
Michel Dufranne (interviewé par Charles-Louis Detournay), «Michel Dufranne (1/2): «Beaucoup croient connaître la Bible, mais souvent de manière confuse»», ActuaBD, (lire en ligne, consulté le ).