La liste des cours d'eau de la Vendée présente les principaux cours d'eau traversant pour tout ou partie le territoire du département de la Vendée, en région Pays de la Loire. La liste présente les cours d'eau, généralement de plus de 10 km de longueur sauf exceptions, par ordre alphabétique, par fleuves et bassin versant, par station hydrologique, puis par organisme gestionnaire ou organisme de bassin.
Les fleuves de la Vendée sont le Lay[S 15], la Sèvre Niortaise[S 38], la Vie[S 43], l'Auzance[S 2], le Falleron[S 7] et le Gai Chatenay[S 8], le Goulet[S 34], le Ligneron[S 17] auxquels il faut ajouter le bassin versant de la Loire[S 47],[1] :
- le Lay, 120 km[S 15].
- le Loing (Lay), 27 km[S 19]
- le Petit Lay, 58,1 km[S 29]
- la Louisière ou ruisseau de la Louisière ou ruisseau du Moulin du Bois, 11,7 km[S 20]
- la Guimenière ou ruisseau de la Guimenière, 10,9 km[S 12]
- le Parc ou ruisseau du Parc ou ruisseau de Riamberge, 10,4 km[S 28]
- la Vouraie, ou ruisseau de la Fauconnière, 14,1 km[S 45]
- la Smagne, 50,3 km[S 39]
- le Marillet, 28,6 km[S 22]
- l'Yon, 55,7 km[S 46]
- le Graon, 17,8 km[S 9]
- la Sèvre Niortaise, 158,4 km[S 38]
- la Vie, 62,3 km[S 43]
- l'Auzance, 38,1 km[S 2]
- le Falleron, 52 km[S 7]
- le Gai Chatenay, 23 km[S 8]
- le Goulet, 16,8 km[S 34]
- la Loire, 1 006 kilomètres[S 47]
La Banque Hydro a référencé les cours d'eau suivants :
Bassins côtiers
- L'Autise à :
- l'Auzance à Vairé (Petit Besson)[BH 11],
- la Ciboule à la Chapelle-Achard (La Renelière)[BH 12],
- la Doulaye à Moutiers-sur-le-Lay[BH 13],
- le Falleron à Falleron[BH 14],
- le Grand Lay à
- le Graon au Champ-Saint-Père[BH 17],
- le Jaunay à :
- le Lay à :
- le Louing à Chantonnay (Saint-Philbert du Pont Charrault)[BH 24],
- le Marillet à :
- la Mère à Antigny (Moulin-Texier)[BH 28],
- le Petit Lay à Saint-Hilaire-le-Vouhis[BH 29],
- le Pont-Habert à Challans[BH 30],
- la Petite Boulogne à la Chapelle-Palluau (La Birochère)[BH 31],
- la Smagne à Sainte-Pexine (Les Mottes)[BH 32],
- la Vie à la Chapelle-Palluau[BH 33],
- la Vendée à :
- l'Yon à :
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