Parallèlement, il écrit divers ouvrages d’histoire.
En 1861, le révérend père Theiner, préfet des Archives secrètes du Vatican, le charge de rendre accessible au public, par l’intermédiaire d’un livre[3], une partie de la documentation réunie pour son Codex diplomaticus dominii temporalis S. sedis. Le comte de L’Épinois rédige alors Le Gouvernement des papes et les révolutions dans les États de l’Église, qui paraîtra en 1865.
En 1872, il réunit en recueil[4] plusieurs articles précédemment parus dans la Revue des questions historiques[5], pour témoigner de son profond désaccord avec la méthode historique d’Henri Martin, dont plusieurs volumes des troisième et quatrième éditions[6] de l’Histoire de France, depuis les temps les plus reculés jusqu’en 1789, avaient obtenu des prix décernés par l’Académie française, par l’Académie des inscriptions et belles-lettres et même par les cinq classes de l’Institut, estimant surfaite la réputation de «monument national» qui s’attachait, à l’époque, à cet ouvrage et mettant en avant les erreurs et inexactitudes qu’aurait comportées cette œuvre, ainsi que le «léger bagage d’érudition» avec lequel, selon ses vues, Henri Martin aurait «entrepris un travail colossal, que toute une vie d’homme suffirait à peine pour conduire à bonne fin[4]».
Le titre héréditaire de comte romain (non reconnu en France) lui a été attribué par le pape Léon XIII par un bref en date de 1881[7].
Article de «revue critique», non signé, en pages 505-515 du mensuel catholique Le Correspondant, novembre 1865. La mention de la genèse du livre se trouve en page 506.
Les éditions successives de l’Histoire de France d’Henri Martin se décomposent comme suit:
une première édition, titrée Histoire de France depuis les temps les plus reculés jusqu’en 1830, qui devait comporter 48 tomes, débute en 1833 mais ne comporte que le tome I;
une deuxième édition, initialement titrée sous le même titre puis, à partir du tome XI, sous le titre Histoire de France d’après les historiens originaux, est publiée en 16 volumes parus de 1834 à 1836;
la troisième édition, cette fois titrée Histoire de France depuis les temps les plus reculés jusqu’en 1789, avait comporté 19 volumes, parus de 1838 à 1854;
la quatrième édition, parue de 1855 à 1860, et ayant conservé le titre de la troisième série, avait comporté 16 volumes plus un volume de Table analytique;
Henri Martin devait aussi, postérieurement, publier une Histoire de France depuis 1789 jusqu’à nos jours, en 8 volumes.
Louis de Magny, Armorial des princes, ducs, marquis, barons et comtes romains en France, créés de 1815 à 1890, et des titres pontificaux conférés en France par les papes, souverains du Comtat-Venaissin, Aux Archives de la noblesse, Paris, 1890, p.13Lien Gallica
Vie du dauphin, père des rois Louis XVI, Louis XVIII et Charles X, d'après l'abbé Proyart et le P. Griffet; enrichie de pièces inédites et précédée d'une lettre à M. l'abbé Vervost, J. Vermot, Paris, 1848, in-18, xxxvi-371 p., (BNF36421662).
Études critiques sur l'“Histoire de France”, de M. H. Martin, A. Vermot, Paris, 1859, 71p., (BNF30795132).
Le R. P. Lacordaire et les conférences de Notre-Dame, Imprimerie Pillet fils aîné, Paris, 1860, 36p., (BNF30795146).
Le Gouvernement des papes et les révolutions dans les États de l'Église, d'après les documents authentiques, extraits des Archives secrètes du Vatican et autres sources italiennes, Didier éditeur, Paris, 1865, x-505p., (BNF30795134). Consultable en ligne et téléchargeable sur Internet Archive.
Note sur les études historiques en France au XIXesiècle, C. Douniol, Paris, 1866, viii-64p., (BNF30795141).
Galilée, son procès, sa condamnation, d'après des documents inédits, V. Palmé, Paris, 1867, 108p., (BNF30795133). – Précédemment paru dans la Revue des questions historiques.
Hier, aujourd'hui, demain, Imprimerie L. Hébrail, Durand et Cie, Toulouse, 1871, 83p., (BNF30795135).
Critiques et réfutations. M. Henri Martin et son «Histoire de France», Librairie de la Société bibliographique, Paris, 1872, xii-480p., (BNF30795130). Consultable en ligne et téléchargeable sur Internet Archive.
Les Catacombes de Rome, notes pour servir de complément aux cours d'archéologie chrétienne, Librairie de la Société bibliographique, Paris, 1875, 234p., (BNF30795129).
Enseignements païens aux 11e et 12e siècles. Apologétique catholique. De l'Enseignement de la philosophie et de la littérature païennes aux 11e et 12e siècles et de l'opposition que leur firent les docteurs catholiques., [éditeur, lieu et date non connus], 91p., (BNF30795131).
M. Guizot, son rôle comme historien, V. Palmé, Paris, 1875, 71p., (BNF30795139). – Précédemment paru dans la Revue des questions historiques.
Les Pièces du procès de Galilée, précédées d'un avant-propos, V. Palmé, Paris, 1877, xxiv-142p., (BNF30795143).
La Question de Galilée: les faits et leurs conséquences, Société générale de librairie catholique, Paris et Bruxelles, 1878, 332p., (BNF30795144). Consultable en ligne et téléchargeable sur Internet Archive.
Le Pape Alexandre VI, V. Palmé, Paris, 1881, 71p., (BNF32374658). – Précédemment paru dans la Revue des questions historiques, en .
Le Pèlerinage de pénitence à Jérusalem, V. Palmé, Paris, 1882, 32p., (BNF30795142).
La Ligue et les papes, V. Palmé, Paris, 1886, viii-672p., (BNF30795137).
Les Réformes et la Révolution en 1789, Librairie de la Société bibliographique, Paris, 1889, 51p., (BNF30795145).
