Fichier:Coronavirus._SARS-CoV-2.png
De Wikipedia, l'encyclopédie encyclopedia
Fichier d’origine (2 048 × 2 048 pixels, taille du fichier : 4,54 Mio, type MIME : image/png)
Ce fichier et sa description proviennent de Wikimedia Commons.
Description
DescriptionCoronavirus. SARS-CoV-2.png |
Deutsch: Wissenschaftlich genaues Atommodell der äußeren Struktur des SARS Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), einem Stamm (genetische Variante) des Coronavirus, der die Coronavirus-Krankheit (COVID-19) verursachte und erstmals im Dezember 2019 in Wuhan, China, identifiziert wurde.
Jeder einzelne Ort (amorpher Fleck) ist ein Atom von: English: Scientifically accurate atomic model of the external structure of the Severe Acute Respiratory Syndrome CoronaVirus 2 (SARS-CoV-2), a strain (genetic variant) of the coronavirus that caused coronavirus disease (COVID-19), first identified in Wuhan, China, during December 2019
Each separate locus (amorphous blob) is a molecule of: Español: Modelo atómico de la estructura externa del SARS-CoV-2. Cada "bola" es un átomo.
Русский: Научно достоверная атомарная модель внешней структуры коронавируса (SARS-CoV-2). Каждый "шарик" — атом. Опубликовано на N+1.
Научный консультант:
Protein Data Bank: 2mls, 6y3y, 5x29, 6yyt Charmm-gui: 6vsb_1_1_1_S309
Проект был сделан в соответствии с научными источниками:
Первичные источники:
|
Date | |
Source |
Travail personnel. Scientific consultants:
|
Auteur | Alexey Solodovnikov (Idea, Producer, CG, Editor), Valeria Arkhipova (Scientific Сonsultant) |
Autorisation (Réutilisation de ce fichier) |
Published by N+1 a popular science online publication of Russia (https://nplus1.ru/), protein models are derivative works of the free license site (freely available for both non-commercial and commercial use) |
Autres versions |
|
Sources
Primary sources:
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7489918/
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7098027/
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7605623/
The following structures from open sources were used in the work, Protein Data Bank (https://www.rcsb.org):
- 2mls (membrane bilayer complex with matrix metalloproteinase-12 at its beta-face) Koppisetti, R.K., Fulcher, Y.G., Prior, S.H., Lenoir, M., Overduin, M., Van Doren, S.R. 2014
- 6y3y (human coronavirus HKU1 haemagglutinin-esterase) Hurdiss, D.L., Drulyte, I., Pronker, M.F. 2020
- 5x29 (NMR structure of the SARS Coronavirus E protein pentameric ion channel) Torres, J., Surya, W., Li, Y. 2017
- 6yyt (Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase) Hillen, H.S., Kokic, G., Farnung, L., Dienemann, C., Tegunov, D., Cramer, P. 2020
- Charmm-gui: 6vsb_1_1_1_S309
Additional sources:
- Surya, W., Li, Y., Torres, J. Structural model of the SARS coronavirus E channel in LMPG micelles // Biochim. Biophys. Acta - Biomembr. – 2018. – Vol. 1860. – N. 6. – P. 1309–1317.
- Koppisetti, R. K., Fulcher, Y. G., Jurkevich, A., Prior, S. H., Xu, J., Lenoir, M., Overduin, M., Van Doren, S. R. Ambidextrous binding of cell and membrane bilayers by soluble matrix metalloproteinase-12 // Nat. Commun. – 2014. – Vol. 5. – P. 1–14.
- Hillen, H. S., Kokic, G., Farnung, L., Dienemann, C., Tegunov, D., Cramer, P. Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase // Nature. – 2020. – Vol. 584. – N. 7819. – P. 154–156.
- Harris, L. J., Larson, S. B., Hasel, K. W., McPherson, A. Refined structure of an intact IgG2a monoclonal antibody // Biochemistry. – 1997. – Vol. 36. – N. 7. – P. 1581–1597.
- Noreng, S., Bharadwaj, A., Posert, R., Yoshioka, C., Baconguis, I. Structure of the human epithelial sodium channel by cryo-electron microscopy // Elife. – 2018. – Vol. 7. – P. 1–23.
- Almond, A., DeAngelis, P. L., Blundell, C. D. Hyaluronan: The Local Solution Conformation Determined by NMR and Computer Modeling is Close to a Contracted Left-handed 4-Fold Helix // J. Mol. Biol. – 2006. – Vol. 358. – N. 5. – P. 1256–1269.
- Hurdiss, D. L., Drulyte, I., Lang, Y., Shamorkina, T. M., Pronker, M. F., van Kuppeveld, F. J. M., Snijder, J., de Groot, R. J. Cryo-EM structure of coronavirus-HKU1 haemagglutinin esterase reveals architectural changes arising from prolonged circulation in humans // Nat. Commun. – 2020. – Vol. 11. – N. 1. – P. 1–10.
- Yan, Renhong, Yuanyuan Zhang, Yaning Li, Lu Xia, Yingying Guo, Q. Z. Structural basis for the recognition of SARS-CoV-2 by full-length human ACE2 // Science (80-. ). – 2020. – Vol. 3. – N. 3. – P. 1–8.
- Javitt, G., Khmelnitsky, L., Albert, L., Bigman, L. S., Elad, N., Morgenstern, D., Ilani, T., Levy, Y., Diskin, R., Fass, D. Assembly Mechanism of Mucin and von Willebrand Factor Polymers // Cell. – 2020. – Vol. 183. – N. 3. – P. 717-729.e16.
- Daniel Wrapp, Nianshuang Wang, Kizzmekia S. Corbett, Jory A. Goldsmith, Ching-Lin Hsieh, Olubukola Abiona, B. S. G., McLellan, and J. S. Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation // Science (80-. ). – 2020. – Vol. 21. – N. 1. – P. 1–9.
- Wang, M. Y., Zhao, R., Gao, L. J., Gao, X. F., Wang, D. P., Cao, J. M. SARS-CoV-2: Structure, Biology, and Structure-Based Therapeutics Development // Front. Cell. Infect. Microbiol. – 2020. – Vol. 10. – N. November. – P. 1–17. (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33324574/)
- Yao, H., Song, Y., Chen, Y., Wu, N., Xu, J., Sun, C., Zhang, J., Weng, T., Zhang, Z., Wu, Z., Cheng, L., Shi, D., Lu, X., Lei, J., Crispin, M., Shi, Y., Li, L., Li, S. Molecular Architecture of the SARS-CoV-2 Virus // Cell. – 2020. – Vol. 183. – N. 3. – P. 730-738.e13.
- Oostra, M., de Haan, C. A. M., de Groot, R. J., Rottier, P. J. M. Glycosylation of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Triple-Spanning Membrane Proteins 3a and M // J. Virol. – 2006. – Vol. 80. – N. 5. – P. 2326–2336. (https://europepmc.org/article/MED/16474139)
- B.W. Neuman, M. J. B. Supramolecular Architecture of the Coronavirus Particle // Adv. Virus Res. – 2020. – Vol. 96. – P. 1–27 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7112365/, https://europepmc.org/article/PMC/1563832)
- Neuman, B. W., Kiss, G., Kunding, A. H., Bhella, D., Baksh, M. F., Connelly, S., Droese, B., Klaus, J. P., Makino, S., Sawicki, S. G., Siddell, S. G., Stamou, D. G., Wilson, I. A., Kuhn, P., Buchmeier, M. J. A structural analysis of M protein in coronavirus assembly and morphology // J. Struct. Biol. – 2011. – Vol. 174. – N. 1. – P. 11–22. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4486061/)
- Yu, A., Pak, A. J., He, P., Monje-Galvan, V., Casalino, L., Gaieb, Z., Dommer, A. C., Amaro, R. E., Voth, G. A. A multiscale coarse-grained model of the SARS-CoV-2 virion // Biophys. J. – 2021. – Vol. 120. – N. 6. – P. 1097–1104 (https://europepmc.org/article/PMC/PMC7695975, https://search.bvsalud.org/global-literature-on-novel-coronavirus-2019-ncov/resource/en/covidwho-947143)
- Yao, H., Song, Y., Chen, Y., Wu, N., Xu, J., Sun, C., Zhang, J., Weng, T., Zhang, Z., Wu, Z., Cheng, L., Shi, D., Lu, X., Lei, J., Crispin, M., Shi, Y., Li, L., Li, S. Molecular architecture of the SARS-CoV-2 virus // Cell. – 2020. – Vol. 183. – N. 3. – P. 730–738 (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420311594)
- Choi, Y. K., Cao, Y., Frank, M., Woo, H., Park, S. J., Yeom, M. S., Croll, T. I., Seok, C., Im, W. Structure, Dynamics, Receptor Binding, and Antibody Binding of the Fully Glycosylated Full-Length SARS-CoV-2 Spike Protein in a Viral Membrane // J. Chem. Theory Comput. – 2021. – Vol. 17. – N. 4. – P. 2479–2487 (https://www.researchgate.net/publication/349986293_Structure_Dynamics_Receptor_Binding_and_Antibody_Binding_of_the_Fully_Glycosylated_Full-Length_SARS-CoV-2_Spike_Protein_in_a_Viral_Membrane)
Conditions d’utilisation
- Vous êtes libre :
- de partager – de copier, distribuer et transmettre cette œuvre
- d’adapter – de modifier cette œuvre
- Sous les conditions suivantes :
- paternité – Vous devez donner les informations appropriées concernant l'auteur, fournir un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été faites. Vous pouvez faire cela par tout moyen raisonnable, mais en aucune façon suggérant que l’auteur vous soutient ou approuve l’utilisation que vous en faites.
- partage à l’identique – Si vous modifiez, transformez, ou vous basez sur cette œuvre, vous devez distribuer votre contribution sous la même licence ou une licence compatible avec celle de l’original.
Distinctions
|
Éléments décrits dans ce fichier
dépeint
Valeur sans élément de Wikidata
4 mai 2021
image/png
eb4db5448ad22fc4c229437fae4692de527c749d
4 765 767 octet
2 048 pixel
2 048 pixel
Historique du fichier
Cliquer sur une date et heure pour voir le fichier tel qu'il était à ce moment-là.
Date et heure | Vignette | Dimensions | Utilisateur | Commentaire | |
---|---|---|---|---|---|
actuel | 10 janvier 2022 à 00:17 | 2 048 × 2 048 (4,54 Mio) | Jul059 | Lossless file size reduction | |
24 septembre 2021 à 05:58 | 2 048 × 2 048 (4,6 Mio) | Iketsi | lossless compression | ||
15 juin 2021 à 18:06 | 2 048 × 2 048 (5,34 Mio) | AlexeySolodovnikov | fix color bug | ||
13 juin 2021 à 16:28 | 2 048 × 2 048 (5,34 Mio) | AlexeySolodovnikov | Мы обновили модель. В роли нашего научного консультанта выступил доктор биологических наук, специалист в области вирусологии, Никитин Н. А. и к.х.н специалист по молекулярному моделированию поверхностных вирусных белков Борисевич С.С. Под их руководством в модель были внесены следующие правки: Изменено количество S-белков с 90 до 38, количество M-белков было увеличено до 1000, а E-белков, как минорных компонентов мембраны, снижено до 15, HE-белок удалён. Также была принята во внимание шарни... | ||
17 mai 2021 à 13:06 | 2 048 × 2 048 (16,04 Mio) | AlexeySolodovnikov | add alpha | ||
4 mai 2021 à 20:41 | 2 048 × 2 048 (16,04 Mio) | AlexeySolodovnikov | Uploaded own work with UploadWizard |
Utilisation du fichier
Les 12 pages suivantes utilisent ce fichier :
- Conséquences de la pandémie de Covid-19 sur les droits de l'homme
- Protéine enveloppe du Coronavirus
- Péplomère
- SARS-CoV-2
- Virologie médicale
- Virus
- Wikipédia:Image du jour/26 juin 2021
- Wikipédia:Image du jour/juin 2021
- Wikipédia:RAW/2022-12-01
- Wikipédia:RAW/2023-01-01
- Wikipédia:Wikimag/2021/26
- Projet:Aide et accueil/Twitter/Tweets/archives/juin 2021
Usage global du fichier
Les autres wikis suivants utilisent ce fichier :
- Utilisation sur alt.wikipedia.org
- Utilisation sur ar.wikipedia.org
- مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها
- فيروس كورونا
- مستخدم:Amira Hashem1996/ملعب
- مناطق انتشار جائحة فيروس كورونا حسب الدولة والمنطقة
- عزل ووهان 2020
- قائمة حوادث كراهية الأجانب والعنصرية المرتبطة بجائحة فيروس كورونا
- مستشفى هوو شين شان
- مستشفى لي شين شان
- جائحة فيروس كورونا في العراق
- معهد ووهان لأبحاث الفيروسات
- جائحة فيروس كورونا في إيطاليا
- جائحة فيروس كورونا في الجزائر
- جائحة فيروس كورونا في اليونان
- اللجنة الوطنية للصحة (الصين)
- جائحة فيروس كورونا في الكويت
- جائحة فيروس كورونا في الكاميرون
- المركز الصيني لمكافحة الأمراض والوقاية منها
- جائحة فيروس كورونا في البوسنة والهرسك
- أثر جائحة فيروس كورونا على الحياة الاجتماعية
- مستشفى ووهان المركزي
- جائحة فيروس كورونا في الأردن
- أثر جائحة فيروس كورونا على الرياضة
- جائحة فيروس كورونا في السودان
- جائحة فيروس كورونا في فرنسا
- جائحة فيروس كورونا في إفريقيا
- جائحة فيروس كورونا في جمهورية الكونغو الديمقراطية
- جائحة فيروس كورونا في الغابون
- انهيار فندق شينجيا إكسبريس
- جائحة فيروس كورونا في توغو
- جائحة فيروس كورونا في غينيا
- جائحة فيروس كورونا في رواندا
- جائحة فيروس كورونا في ساحل العاج
- جائحة فيروس كورونا في ناميبيا
- جائحة فيروس كورونا في كينيا
- جائحة فيروس كورونا في مايوت
- جائحة فيروس كورونا في لا ريونيون
- قيود السفر بسبب جائحة فيروس كورونا
- جائحة فيروس كورونا في غينيا الاستوائية
- جائحة فيروس كورونا في جمهورية إفريقيا الوسطى
- جائحة فيروس كورونا في جمهورية الكونغو
- جائحة فيروس كورونا في سيشل
- جائحة فيروس كورونا في ليبيريا
- جائحة فيروس كورونا في الصومال
- جائحة فيروس كورونا في تنزانيا
- جائحة فيروس كورونا في كازاخستان
- جائحة فيروس كورونا في أوروبا
- لقاح كوفيد-19
- جائحة فيروس كورونا في أوقيانوسيا
- جائحة فيروس كورونا في كولومبيا
Voir davantage sur l’utilisation globale de ce fichier.