GTF3A

GTF3A (pour facteur général de transcription 3A) ou Facteur de transcription IIIA, souvent abrégé TFIIIA est une protéine à doigts de zinc dont le gène GTF3A chez les humains est présent sur le chromosome 13. Cette protéine est impliquée dans la transcription du gène de l'ARN ribosomique 5S.

GTF3A
Identifiants
Aliases	GTF3A
IDs externes	OMIM: 600860 MGI: 1913846 HomoloGene: 55630 GeneCards: GTF3A
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 13 humain[1] Locus 13q12.2 Début 27,424,619 bp[1] Fin 27,435,823 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 5 (souris)[2] Locus 5|5 G3 Début 146,885,467 bp[2] Fin 146,892,424 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans parotide muscle glutéal ventricule droit gyrus temporal moyen apex of heart muscle biceps brachial diaphragme palpebral conjunctiva body of tongue Skeletal muscle tissue of biceps brachii Fortement exprimé dans otic placode saccule otic vesicle paroi abdominale embryon tail of embryo Épiblaste ligne primitive tube neural corpuscule rénal Plus de données d'expression de référence BioGPS n/a
Gene Ontology Fonction moléculaire Fixation d'acide nucléique liaison ADN liaison ion métal liaison ARN 5S rRNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Composant cellulaire noyau nucléoplasme Processus biologique rRNA transcription regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated transcription by RNA polymerase III ribosomal large subunit biogenesis ribosome biogenesis regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 2971 66596 Ensembl ENSG00000122034 ENSMUSG00000016503 UniProt Q92664 Q8VHT7 RefSeq (mRNA) NM_002097 NM_025652 RefSeq (protéine) NP_002088 NP_079928 Localisation (UCSC) Chr 13: 27.42 – 27.44 Mb Chr 5: 146.89 – 146.89 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Historique

Le facteur de transcription IIIA est le premier facteur de transcription eucaryote à avoir été purifié de manière homogène et il a aussi été, en 1980 par Robert Roeder, le premier activateur spécifique de gène de mammifère identifié^[5],[6]. Caractérisé ensuite par Wolffe et Brown en 1988, le gène du TFIIIA est aussi le premier facteur de transcription eucaryote dont le gène a été cloné^[6],[7].

Le Facteur de transcription IIIA est aussi, chez le Xénope le premier facteur de transcription à doigt de zinc découvert^[8].

Localisation

Comme déterminé initialement par la technique de FISH, le gène GTF3A est localisé chez l'humain, sur le bras q12 du chromosome 13^[9],[10].

Structure

La protéine TFIIIA humaine contient neuf domaine en doigt de zinc avec motif Cys2His2^[9].

Fonction

Le TFIIIA joue un rôle majeur dans la transcription du gène de l'ARNr 5S en se fixant sur la région de contrôle interne^[7]. Non seulement, il se lie sur la région promotrice mais il est aussi capable de se fixer sur le transcrit de ce gène, l'ARNr 5S lui-même^[7]. Cette protéine TFIIIA a donc la particularité inhabituelle d'être capable de se fixer à l'ADN mais aussi à l'ARN^[7].

Références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000122034 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000016503 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. DR Engelke, SY Ng, BS Shastry et RG Roeder, « Specific interaction of a purified transcription factor with an internal control region of 5S RNA genes », Cell, vol. 19, n^o 3,‎ mars 1980, p. 717–28 (PMID 6153931, DOI 10.1016/S0092-8674(80)80048-1, S2CID 23955175)
6. White 2013, p. 102.
7. Shastry 1996, p. 535.
8. (en) M. Bruno, M Mahgoub et TS Macfarlan, « The Arms Race Between KRAB-Zinc Finger Proteins and Endogenous Retroelements and Its Impact on Mammals », Annual Review of Genetics, Annual Reviews, vol. 53, n^o 1,‎ décembre 2019, p. 393–416 (PMID 31518518, DOI 10.1146/annurev-genet-112618-043717, S2CID 202572327)
9. (en) H Arakawa, H Nagase, N Hayashi, M Ogawa, M Nagata, T Fujiwara, E Takahashi, S Shin et Y Nakamura, « Molecular cloning, characterization, and chromosomal mapping of a novel human gene (GTF3A) that is highly homologous to Xenopus transcription factor IIIA », Cytogenetics and Cell Genetics, vol. 70, n^os 3–4,‎ juillet 1995, p. 235–8 (PMID 7789179, DOI 10.1159/000134041)
10. (en) « Entrez Gene: GTF3A general transcription factor IIIA », sur Entrez Gene, 7 septembre 2023 (consulté le 30 septembre 2023)

Bibliographie

• (en) Barkur S. Shastry, « Transcription factor IIIA (TFIIIA) in the second decade », Journal of Cell Science, vol. 109, n^o 3,‎ 1^er mars 1996, p. 535-539 (DOI 10.1242/jcs.109.3.535)
• (en) Robert J. White, « TFIIIA », dans RNA Polymerase III Transcription, Springer Berlin Heidelberg, 2013, 270 p. (ISBN 9783662035184), p. 102-109

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