Harju alamvesikond on Lääne-Eesti vesikonna osa.
- Albu peakraav
- Andrekse peakraav
- Apametsa peakraav
- Aruküla peakraav
- Eeru peakraav
- Haiba peakraav
- Hardu peakraav
- Harjava peakraav
- Hatu peakraav
- Igavere peakraav
- Juuliku peakraav
- Jälgimäe peakraav
- Järsi peakraav
- Järveraba peakraav
- Kaalepi peakraav
- Kaiu peakraav
- Kasvandu peakraav
- Keibu peakraav
- Kiiu peakraav
- Kivisilla peakraav
- Kloostri peakraav
- Kodasema peakraav
- Koigi peakraav
- Koplimetsa peakraav
- Kostivere peakraav
- Kullavahe peakraav
- Kunila peakraav
- Kurna-Mõisküla peakraav
- Kõue peakraav
- Lehmja peakraav
- Lehtmetsa peakraav
- Lihalõpe peakraav
- Linnape peakraav
- Lähtse peakraav
- Mallavere peakraav
- Matsi peakraav
- Metsapere peakraav
- Metslõugu peakraav
- Männimäe peakraav
- Määra peakraav
- Nabala peakraav
- Ohtu peakraav
- Ojari peakraav
- Olevi peakraav
- Paasiku peakraav
- Patika peakraav
- Peraküla peakraav
- Perila peakraav
- Pikva peakraav
- Piskjõe peakraav
- Põlendmaa peakraav
- Raasiku-Anija peakraav
- Rae-Lagedi peakraav
- Raudemetsa peakraav
- Rebase peakraav
- Riisipere peakraav
- Risti-Hatu peakraav
- Rummu peakraav
- Saeveski peakraav
- Saha peakraav
- Sausti peakraav
- Soo-otsa peakraav
- Soodevahe peakraav
- Sootaguse peakraav
- Sõeru peakraav
- Tagavälja peakraav
- Tammiku peakraav
- Triigi peakraav
- Tuula peakraav
- Uuejõe peakraav
- Vaidla peakraav
- Valingu peakraav
- Vanamõisa peakraav
- Vatsla peakraav
- Verdla peakraav
- Vesisoo peakraav
- Vilamaa peakraav
- Viruküla peakraav
- Viti peakraav
- Välgu peakraav
- Üksnurme peakraav
- Alansi kraav
- Alttoa kraav
- Hiieveski kraav
- Huntaugu kraav
- Järlepa kraav
- Kadja kraav
- Kanarbiku kraav
- Keila kraav
- Kodasoo kraav
- Koseselja kraav
- Kunilepa kraav
- Kõrgimäe kraav
- Känkari kraav
- Lagevainu kraav
- Laukesoo kraav
- Limujärve kraav
- Mäesalu kraav
- Napi kraav
- Neitla kraav
- Nellise kraav
- Nipernaadi kraav
- Palderma kraav
- Pikakatku kraav
- Põima kraav
- Saire kraav
- Salu kraav
- Siimu kraav
- Suurupi kraav
- Tatsu kraav
- Tõõrakõrve kraav
- Vanaõue kraav
- Vankse kraav
- Vetepere kraav
- Voore kraav
- Väo kraav
- (Kakerdi raba laugas) (Kakerdaja raba laugas)
- (Keava raba laugas)
- (Koitjärve raba laugas)
- (Laukesoo laugas)
- (Masila soo laugas)
- (Pakasjärve raba laugas)
- (Suursoo laugas)
- (Suursoo laugas)
- (Suursoo laugas)
- (Tõugussaare raba laugas)
- Ahvenajärv (Nelijärve Ahvenajärv) (Aegviidu Ahvenjärv, Linaleo järv)
- Alesti järv (Alesti karjäärijärv)
- Allikajärv (Peraküla Allikajärv) (Allikjärv)
- Augjärv (Aukjärv)
- Bodän
- Eesjärv (Tartussaare Eesjärv) (Tartusaare järv, Ratassaare järv)
- Elsejärv (Nahe Mädajärv, Elsi järv)
- Flyvae (Pikane järv, Pikanina järv)
- Harakajärv
- Harku järv
- Haugjärv (Ämmassaare Haugjärv) (Emmasaare Haugjärv, Emmusaare järv)
- Hindaste järv (Indaste järv)
- Imastu allikas (Imastu järv)
- Järlepa järv (Suur Järlepa järv)
- Järveotsa järv (Turvaste Järveotsa järv) (Järvetsa järv)
- Kaanjärv (Matsimäe Kaanjärv) (Seli Pühajärv, Võõbu Kaanjärv)
- Kaasikjärv (Metstoa Kaasikjärv)
- Kaatsjärv (Kootsjärv, Tõnismäe järv)
- Kadja järv / Põlliku järv (Kuimetsa järv, Kodja järv, Põllikese järv)
- Kahala järv
- Kajakalaugas (Pillapalu järv)
- Kakerdi järv (Kakerdaja järv)
- Kalijärv (Jäneda Kalijärv) (Kallijärv)
- Kalle järv (Kalle veski pais)
- Kaselaug (Anutakse laugas, 3. Rabivere järv, Anutakse laugas)
- Kautla järv (Kautla Saarejärv, 1. Kantjala järv)
- Kernu järv (Kõrveküla Kernu järv) (Kõrveküla järv)
- Kiruvere järv
- Kivijärv (Koitjärve Kivijärv) (Pillapalu Kivijärv)
- Klooga järv
- Koitjärv
- Kolviku järv
- Kukejärv
- Kullijärv
- Kurkse järv
- Kutniku järv (Kõrvenurga Soojärv)
- Kõnnujärv (Kadaka järv, Kõrgeraba järv)
- Kõverjärv (Jussi Kõverjärv)
- Käpajärv (Kõrvenurga Käpajärv)
- Laanemaa järv
- Laijärv (Pühamäe Laijärv) (Pühameeste Laijärv, Pühameeste Suurjärv)
- Larvi järv
- Laudissalu järv
- Lemküla järv (Lemmküla järv)
- Lepaauk (Lepajõe auk)
- Leva järv (Kirivalla järv, Mahtra Mudajärv)
- Lihlträske (Lihl-träske)
- Lihlviki (Lihl-viki)
- Limu järv
- Linajärv
- Linajärv (Jussi Linajärv)
- Linajärv (Kivisilla Linajärv)
- Linajärv (Kreo Linajärv)
- Linajärv (Metstoa Linajärv) (Liivjärv, Paukjärv)
- Linajärv (Nelijärve Linajärv)
- Linajärv (Orgi Linajärv) (Änni Linajärv)
- Lindjärv (Tudre järv, Tudra järv)
- Lohja järv
- Lõilasmäe järv (Lõilaskme järv, Lõilasmaa järv, Lillasmäe järv)
- Maajärv (Rammusaare järv)
- Maalaht
- Maardu järv (Liivakandi järv)
- Mardihansu järv
- Mudajärv
- Mudajärv (Kautla Mudajärv) (Kungla järv, 2. Kantjala järv)
- Mustjärv (Jussi Mustjärv)
- Mustjärv (Leppsilla Mustjärv) (Leppsilla Ännijärv)
- Mustjärv (Paunküla Mustjärv) (Seapilli järv)
- Mustjärv (Peraküla Mustjärv) (Nõva Mustjärv)
- Mustjärv (Rohussaare Mustjärv) (Rohusaare Mustjärv)
- Mustjärv (Turvaste Mustjärv)
- Mustjärv (Vedama Mustjärv) (Järvetaga Mustjärv, Naku järv)
- Mustlaugas (Kajaka-Mustlaugas) (Pillapalu järv)
- Mädajärv (Patika Mädajärv)
- Mähuste järv (Mäuste järv)
- Mätasjärv
- Nikerjärv
- 11 nimetut järve
- Nõmme järv (Nõmmjärv, Järvesilla järv)
- Ohepalu järv (Ohepalu Suurjärv)
- Paatre järv (Laitse järv)
- Paista järv
- Pakasjärv (Pakase järv, Suur Pakase järv)
- Paukjärv
- Paunküla linajärv (Sipelga linajärv)
- Pedaslaugas (Pädaslaugas)
- Piisupi järv
- Pikane järv (Tuksi järv, Pikkana järv, Soonde järv, Peraküla järv)
- Pikkjärv (Jussi Pikkjärv)
- Pikkjärv (Järvi Pikkjärv) (Pühameeste Pikkjärv, Järvi Pikajärv)
- Pikklaug (Ida-Pikklaug) (Kaksiklaugas)
- Pikklaug (Lääne-Pikklaug) (Kaksiklaugas)
- Pikklaugas (Järvi Pikklaugas)
- Pikklaugas (Kajaka-Pikklaugas) (Koitjärve Pikklaugas)
- Pikklaugas (Koitjärve Pikklaugas) (Koitjärve raba laugas)
- Pilli järv (Soeotsa Mustjärv, Naku järv)
- Porkuni järv
- Pumbuta järv (Väike järv)
- Punamäe järv (Punajärv, Punane järv, Seapilli järv)
- Purgatsi järv
- Pärnjärv (Järvi järv, Suur Järvi järv)
- Pühajärv (Matsimäe Pühajärv) (Seli Kaanjärv, Võõbu Pühajärv)
- Rabajärv
- Rahkjärv (Mustjärv)
- Rammusaare laht (Rammusaare järv) (Rammusaare järv)
- Ratasjärv
- Roosna järv (Vanaveski järv, Vanaveski allikajärv)
- Ruila järv (Ruiljärv, Kernu Mädajärv)
- Rummu järv
- Rõõsa järv
- Rätsepa järv
- Saksi järv (2. Saksi mõisa järv)
- Savalduma järv (Savaladmuma karstijärv)
- Savalduma karstiala
- Seli järv
- Seli raba laugas (2. Kadaka järv)
- Sillaotsa järv (Leppsilla Sillaotsa järv)
- Sisaliku järv (Nelijärve Sisalikujärv) (Aegviidu Sisalikujärv)
- Soodajärv
- Sopi järv (Sopi järvik)
- Sopi järvik
- Storträske (Stor-träske)
- Suur Kaanjärv (Esimene Kaanjärv)
- Suur Kaksjärv (Kaksjärv)
- Suur Kalajärv (Kreo Kalajärv, Suurjärv)
- Suurjärv (Jussi Suurjärv)
- Suurjärv (Udriku Suurjärv) (Suur Udrikjärv)
- Särgjärv (Järvi Särgjärv) (Järvi järv, Väike Järvi järv)
- Süsijärv
- Tagajärv (Tartussaare Tagajärv) (Kihmjärv, Kihmajärv)
- Tallekesejärv (Tallekese järv)
- Tikkjärv
- Toatse järv (Tuatse järv, Tantsu järv)
- Tõlinõmme järv
- Tõugujärv (Paljassaare raba laugas, Tõugu järv)
- Tänavjärv
- Udriku laugas
- Ulglaht (Ulgulaht, Ulklaht)
- Umbjärv (Suursoo Umbjärv)
- Urbukse järv
- Vahe-Kaanjärv
- Vahejärv (Nelijärve Vahejärv) (Aegviidu Vahejärv)
- Vahelaugas (Kajaka-Vahelaugas) (Pillapalu järv)
- Vaheru järv (Väheru järv, Mäejärv, Vaharu järv)
- Vahessaare järv
- Valgejärv (Turvaste Valgejärv)
- Venejärv (Kullijärv)
- Veskijärv (Nõva Veskijärv)
- Vibujärv
- Viikjärv
- Võhmetu järv (Võhmetu suurjärv)
- Väike Kaanjärv (Väike Kaanjärv)
- Väike Kaksjärv (Kaksjärv)
- Väike Kalajärv (Kreo Väikejärv)
- Väike Pakasjärv (Väike Pakase järv)
- Väike Sillaotsa järv
- Väike-Toatse järv (Väikejärv) (Väike Toatse järv, Väikejärv)
- Väikejärv (Männiku Väikejärv)
- Väikejärv (Pühamäe Väikejärv) (Pühajärv, Pühameeste Väikejärv)
- Väikejärv (Udriku Väikejärv) (Väike Udrikjärv)
- Väinjärv (Jussi Väinjärv) (Veinjärv)
- Änni järv (Ännijärv)
- Ülemiste järv
- Ümarjärv (Metstoa Ümarjärv) (Ümerik järv, Ümmargune järv, Mädajärv, Umarikjärv)
- (Kurtna tiigid)
- (Kurtna tiigid)
- Aavoja veehoidla (Ülejõe veehoidla)
- Alavere tiigid
- Allikajärv (Jäneda Allikajärv) (Jäneda mõisa tiigid)
- Aruoja veehoidla
- Haiba veehoidla
- Hiieveski paisjärv (Hiieveski veehoidla)
- Karitsa järv (Karitsa paisjärv, Salutaguse jäv)
- Kaunissaare veehoidla
- Kemba paisjärv
- Kernu järv (Kernu paisjärv, Kirna järv)
- Kiviloo paisjärv
- Kohila paisjärv
- Kose veskijärv (Kose paisjärv)
- Kotka järv (Kotka paisjärv, Kotkaveski paisjärv)
- Kurtna paisjärv
- Käravete järv (Käravete paisjärv)
- Laitse veehoidla
- Linnamäe paisjärv (Linnamäe veehoidla)
- Lohu paisjärv
- Loo paistiik
- Loo paistiik
- Lundi paisjärv
- Maidla järv (Maidla paisjärv)
- Moe paisjärv
- nimetu
- Paekna järv (Paekna paisjärv)
- Pikaveski järv (Pikaveski paisjärv)
- Pirgu paisjärv
- Preediku järv (Mägise paisjärv)
- Purila paisjärv
- Raudoja veehoidla
- Rava järv (Rava paisjärv)
- Riisipere järv (Riisipere paisjärv)
- Roobuka paistiik
- Ruila paisjärv
- Saku tiik
- Soodla veehoidla
- Tammiku veehoidla
- Vahakulmu järv (Vahakulmu paisjärv)
- Vaskjala veehoidla (Vaskjala paisjärv)
- Veskijärv (Jäneda Veskijärv) (Jäneda paisjärv)
- Vetla paisjärv
- Väike Allikajärv
- Väike-Aavoja veehoidla (Vikipalu veehoidla; Aavoja veehoidla)