Polimerasa

La polimerasa es una enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos, que resultan cruciales en la división celular (ADN polimerasa) y en la transcripción del ADN (ARN polimerasa).^[1] La ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN, respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.

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Polimerasa
Estructuras disponibles
PDB	Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Identificadores externos	Bases de datos de enzimas IntEnz: entrada en IntEnz BRENDA: entrada en BRENDA ExPASy: NiceZime view KEGG: entrada en KEEG PRIAM: perfil PRIAM ExplorEnz: entrada en ExplorEnz MetaCyc: vía metabólica
Número EC	2.7.7
Estructura/Función proteica
Tipo de proteína	Transferasa
Funciones	Enzima
Ortólogos
Especies	Humano Ratón
Ubicación (UCSC)	n/a n/a
PubMed (Búsqueda)
PMC (Búsqueda)
v t e
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Polimerasa
Estructura tridimensional de la ADN polimerasa
Identificadores
v t e
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La ADN polimerasa es la enzima que lleva a cabo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), una técnica que ha desempeñado un papel esencial en el desarrollo de la genética.

Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La poli(A)-ARN-Polimerasa (PAP) es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.

Diferenciación

Tipo	Abreviatura	Plantilla → Producto	Función
ADN-dependiente ADN polimerasa	DDDP	ADN → ADN	Replicación
ARN-dependiente ADN polimerasa	RDDP	ARN → ADN	Transcripción inversa
ADN-dependiente ARN polimerasa	DDRP	ADN → ARN	Transcripción
ARN-dependiente ARN polimerasa	RDRP	ARN → ARN	Replicación de los Virus ARN
independiente ARN polimerasa		→ ARN
independiente ADN polimerasa		→ ADN

Clasificación

• ADN-dependiente ADN polimerasa (DDDP)
  • Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas γ, θ, ν y la procariota I.
  • Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ζ, α, δ, ε y la procariota II. También se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
  • Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
  • Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas β, σ, λ, μ, TDT y la procariota III.
  • Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ι, κ, η y las procariotas IV y V.
• ADN-dependiente ARN polimerasa (DDRP)
  • Multi-subunidad (msDdRP): Incluye las ARN polimerasas eucariota I, II, II, IV, V, la ARNP bacteriana y la ARNP arqueana.
  • Subunidad única (ssDdRP): incluye la ARN polimerasa T7 y la POLRMT.
  • Primasa, PrimPol.
• ARN-dependiente ADN polimerasa (RDDP)
  • Transcriptasa inversa (RT)
  • Telomerasa
• ARN-dependiente ARN polimerasa (RDRP)
  • RdRP viral
  • cRdRP eucariota (en algunos eucariotas infectados por virus de ARN)
• Elongación de ARN sin plantilla
  • PAP, PNPase

Demostración

Un ejemplo de la ARN polimerasa, que funciona sin plantilla, es la poli(A)-ARN-Polimerasa (PAP), que se une a la cola poli(A) de la molécula del ARNm. La terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) es una ADN polimerasa independiente de la plantilla.

Por estructura

Ejemplo de algunas polimerasas.

Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, con pliegue de "mano derecha" y pliegue de "barril beta doble psi" (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se ve en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en la cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente.

Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Por ejemplo las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y la helicasa centelleo mitocondrial. Las primasas eucariotas y arqueanas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la polimerasa palma. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas.