Bamfordvirae

Bamfordvirae es un reino de virus de ADN del dominio Varidnaviria que incluye los virus gigantes (filo Nucleocytoviricota) junto con el filo Preplasmoviricota que contiene los virófagos, los adenovirus y varias familias de virus procariotas como los tectivirus, entre otros.^[1][2]

Bamfordvirae
Viriones de un adenovirus y un virus gigante.
Taxonomía
Dominio:	Varidnaviria
Reino:	Bamfordvirae
Clasificación de Baltimore
Filos
Nucleocytoviricota Preplasmiviricota
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Los virus de este reino se caracterizan por codificar una proteína en doble rollo de gelatina vertical (DJR-MCP) en comparación con el otro reino Helvetiavirae que codifica una proteína en rollo de gelatina vertical simple (SJR-MCP). Los virus de Bamfordvirae parecen haber evolucionado de un evento en el que dos proteínas SJR-MCP de virus de Helvetiavirae se fusionaron dando origen a la proteína en doble rollo de gelatina vertical (DJR-MCP), propio de este linaje.^[3] Los virus de Bamfordvirae cruzaron a los eucariotas por medio de bacteriófagos emparentados con Tectiviridae, surgiendo de esta manera los polintovirus que fueron los primeros virus eucariotas de este reino y que posteriormente darían origen a los adenovirus, los virófagos, los virus gigantes, los plásmidos mitocondriales (plásmidos inactivos que se encuentran en las mitocondrias), los plásmidos de levaduras (citoplasmáticos) y los transpovirones (transposones de ADN que se encuentran en los genomas de los virus gigantes). Los polintovirus finalmente terminarían por endogenizarse en el genoma de los eucariotas convirtiendóse en los transposones polintones.^[4][5] Los virus gigantes parecen haber evolucionado de virus pequeños del filo Preplasmiviricota mediante la duplicación y deleción de genes, la inclusión de elementos genéticos móviles y la adquisición masiva de genes de huéspedes y bacterias, incluidos los genes para la traducción y los genes informáticos que se consideran los más resistentes a la transferencia horizontal.^{[6][7][8][9][10]} Los virus gigantes pudieron haber dado origen a los virus de la clase Naldaviricetes o descender de un ancestro compartido.^[11][12][13]

Taxonomía

La taxonomía establecida por el ICTV y por otros análisis filogenéticos es la siguiente:^[14]

• Reino Bamfordvirae
  • Filo Nucleocytoviricota
    • Clase Megaviricetes
      • Orden Algavirales
        • Familia Phycodnaviridae
        • Familia Yaraviridae
        • Familia Mamonaviridae
      • Orden Imitervirales
        • Familia Mimiviridae
        • Familia Allomimiviridae
        • Familia Mesomimiviridae
        • Familia Schizomimiviridae
      • Orden Pimascovirales
        • Familia Ascoviridae
        • Familia Iridoviridae
        • Familia Marseilleviridae
        • Familia Pithoviridae^[15]
    • Clase Pokkesviricetes
      • Familia Asfarviridae
      • Familia Poxviridae
  • Filo Preplasmiviricota
    • Familia Lavidaviridae
    • Familia Adintoviridae
    • Familia Finnlakeviridae^[16]
    • Clase Tectiliviricetes
      • Familia Adenoviridae
      • Familia Tectiviridae
      • Familia Turriviridae
      • Orden Vinavirales
        • Familia Corticoviridae
        • Familia Autolykiviridae
  • Clase Naldaviricetes^[11][12]
    • Familia Nimaviridae
    • Orden Lefavirales
      • Familia Baculoviridae
      • Familia Hytrosaviridae
      • Familia Nudiviridae
      • Familia Polydnaviriformidae

Referencias

1. Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 de octubre de 2019). «Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins» (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (en inglés). Consultado el 10 de junio de 2020.
2. Kauffman KM, Hussain FA, Yang J, Arevalo P, Brown JM, Chang WK, VanInsberghe D, Elsherbini J, Sharma RS, Cutler MB, Kelly L, Polz MF (1 de febrero de 2018). «A Major Lineage of Non-Tailed dsDNA Viruses as Unrecognized Killers of Marine Bacteria». Nature 554 (7690): 118-122. PMID 29364876. doi:10.1038/nature25474.
3. Krupovic, M; Dolja, VV; Koonin, EV (14 de julio de 2020). «The LUCA and its complex virome.». Nat Rev Microbiol. PMID 32665595. doi:10.1038/s41579-020-0408-x. Consultado el 16 de agosto de 2020.
4. Krupovic M, Bamford DH, Koonin EV (29 de abril de 2014). «Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses». Biol Direct 9: 6. PMC 4028283. PMID 24773695. doi:10.1186/1745-6150-9-6. Consultado el 10 de junio de 2020.
5. San Martin J, van Raaij MJ (23 de noviembre de 2018). «The So Far Farthest Reaches of the Double Jelly Roll Capsid Protein Fold». Virol J 15 (1): 181. PMC 6260650. PMID 30470230. doi:10.1186/s12985-018-1097-1. Consultado el 10 de junio de 2020.
6. Natalya Yutin, Eugene Koonin (2019). Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism. Science Direct.
7. Natalya Yutin, Yuri I.Wolf, Eugene V.Koonin (2014). Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life. Science Direct. https://doi.org/10.1016/j.virol.2014.06.032
8. Jonathan Filée (2013). Route of NCLDV evolution: the genomic accordion. Science Direct.
9. David Moreira, Céline Brochier-Armanet (2008). Giant viruses, giant chimeras: The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes. NCBI.
10. Tom Williams, T Martin Embley, Eva Heinz (2011). Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses. Researchgate.
11. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic (2015). Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. Sciences Direct.
12. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, F. Murilo Zerbini, Jens H. Kuhn (2020). Global Organization and Proposed Megataxonomy of the Virus World Archivado el 26 de julio de 2021 en Wayback Machine.. American Society for Microbiology.
13. Johannes Jehlea, Yongjie Wang (2012). Phylogeny and Evolution of Hytrosaviridae. Science Direct.
14. «Virus Taxonomy: 2020 Release» (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). October 2018. Consultado el 13 octobre 2019.
15. Claire Bertelli, Linda Mueller, Vincent Thomas, Trestan Pillonel, Nicolas Jacquier, Gilbert Greub (2017). Cedratvirus lausannensis – digging into Pithoviridae diversity Archivado el 28 de enero de 2022 en Wayback Machine.. Online Library.
16. Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature.

• Datos: Q92190974
• Especies: Bamfordvirae