Familia de motivos tripartitos

La familia de motivos tripartitos es una familia de proteínas que se caracterizan por contener motivos tripartitos en su estructura. Todas las proteínas de esta familia se denominan TRIM seguido de un número.^[1]

Familia de motivos tripartitos

Función

Muchas proteínas TRIM son inducidas por interferón, ya que son un componente importante en la resistencia contra patógenos, y muchas proteínas TRIM son conocidas por ser necesarias para la restricción de infecciones causadas por lentivirus. Estas proteínas está implicadas en el reconocimiento del patógeno y, por regulación de rutas transcripcionales, en la defensa del hospedador.^[2]

Estructura

Los motivos tripartitos siempre se encuentran presentes en el dominio N-terminal de las proteínas TRIM. Los motivos tripartitos incluyen los siguientes tres dominios:^[1]

• (1) Un dominio de dedos de zinc RING.
• (2) Uno o dos dominios de dedos de zinc B-box.
  • Si sólo hay una B-box presente, siempre será de tipo 2.
  • Si hay dos B-box presentes, la de tipo 1 siempre precede a la de tipo 2.
• (3) Una región de hélice superenrollada.

Por su parte, el dominio C-terminal de las proteínas TRIM puede contener:

• Proteínas del grupo 1: un extremo C-terminal que incluye alguno de los siguientes dominios:
  • Dominio NHL y dominio IGFLMN, asociados o solos.
  • Dominio PHD asociado con un bromodominio.
  • Dominio MATH (por ejemplo, TRIM37).
  • Dominio ARF (por ejemplo, TRIM23).
  • Dominio EXOIII (por ejemplo, TRIM19).
• Proteínas del grupo 2: dominio SPRY.

Miembros de la familia

La familia TRIM se divide en dos grupos que difieren en la estructura de los dominios y en la organización genómica:^[3]

• Los miembros del grupo 1 poseen diversos dominios posibles en el extremo C-terminal y se encuentran tanto en vertebrados como en invertebrados.
• Los miembros del grupo 2 se encuentran ausentes en invertebrados y poseen siempre en el extremo C-terminal un dominio SPRY.^[4]

A continuación se muestran los miembros de cada grupo descritos hasta ahora:

• Grupo 1:
  • Con dominios PHD-BROMO: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) (actúan como correpresores)
  • 1-10: TRIM1, TRIM2, TRIM3, TRIM8, TRIM9
  • 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14, TRIM16, TRIM18, TRIM19
  • 21-30: TRIM23, TRIM25, TRIM29, TRIM30
  • 31-40: TRIM32, TRIM36, TRIM37
  • 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45, TRIM46, TRIM47
  • 51-60: TRIM51, TRIM53, TRIM54, TRIM55, TRIM56, TRIM57, TRIM59
  • 61-70: TRIM62, TRIM63, TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69, TRIM70
  • 71-75: TRIM71

• Grupo 2:
  • 1-10: TRIM4, TRIM5, TRIM6, TRIM7, TRIM10
  • 11-20: TRIM11, TRIM12, TRIM15, TRIM17, TRIM20
  • 21-30: TRIM21, TRIM22, TRIM26, TRIM27, TRIM30
  • 31-40: TRIM31, TRIM34, TRIM35, TRIM38, TRIM39, TRIM40
  • 41-50: TRIM41, TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
  • 51-60: TRIM51, TRIM52, TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
  • 61-70: TRIM61, TRIM64, TRIM68, TRIM69, TRIM70
  • 71-75: TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIM75

Referencias

1. Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (mayo de 2001). «The tripartite motif family identifies cell compartments». Embo J. 20 (9): 2140-51. PMC 125245. PMID 11331580. doi:10.1093/emboj/20.9.2140. Consultado el 22 de febrero de 2009.
2. Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (noviembre de 2008). «TRIM family proteins and their emerging roles in innate immunity». Nat. Rev. Immunol. 8 (11): 849-60. PMID 18836477. doi:10.1038/nri2413.
3. Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). «Genomic analysis of the TRIM family reveals two groups of genes with distinct evolutionary properties». BMC Evol. Biol. 8: 225. PMC 2533329. PMID 18673550. doi:10.1186/1471-2148-8-225.
4. Ponting C, Schultz J, Bork P (junio de 1997). «SPRY domains in ryanodine receptors (Ca(2+)-release channels)». Trends Biochem. Sci. 22 (6): 193-4. PMID 9204703. doi:10.1016/S0968-0004(97)01049-9.

• Datos: Q7843246