Familie im Reich Viren (Virus) Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Die Marseilleviridae sind eine Familie von Viren, die 2012 erstmals beschrieben wurde.[4]
Das Genom dieser Viren ist eine doppelsträngige DNA.
Die Wirte sind oft Amöben, aber es gibt Hinweise darauf, dass sie auch beim Menschen gefunden werden.[5][6][7][8]
Die Typusart wurde ursprünglich zum Mimivirus gruppiert (Familie Mimiviridae), spätere Studien zeigten jedoch, dass nur eine entfernte Verwandtschaft besteht. Mit Stand 2016 erkannte das Internationale Komitee für Taxonomie von Viren (International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV) vier Spezies in dieser Familie an, die auf zwei Gattungen aufgeteilt sind.[9][10] Die Marseilleviridae gehören zum im März 2020 vom ICTV neu geschaffenen Phylum der Nucleocytoviricota (frühere inoffizielle Bezeichnung Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV; andere frühere Vorschläge hatten auf „Nucleocytoplasmaviricota“ bzw. – im Rang einer Ordnung – „Megavirales“ gelautet).[2] Aufgrund der entfernten Verwandtschaft hat das ICTV in diesem Zug die Familien der Mimiviridae (mit ihrer Ordnung Imitervirales) und der Marseilleviridae (mit ihrer Ordnung Pimascovirales) in eine gemeinsame neu geschaffene Klasse Megaviricetes gestellt[11] (auch für diese Gruppe war früher gelegentlich der Rang einer Ordnung „Megavirales“ – in einem engeren Sinn als oben – vorgeschlagen worden).
Das erste bekannte Mitglied dieser Familie wurde als Acanthamoeba polyphaga marseillevirus bezeichnet und wurde vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell als Spezies Marseillevirus marseillevirus (heute Marseillevirus massiliense) der Gattung Marseillevirus bestätigt. Ein zweites Mitglied ist Acanthamoeba castellanii lausannevirus (ICTV: Spezies Lausannevirus, Gattung nicht zugewiesen). In der Gattung Marseillevirus hat das ICTV als zweite Spezies das Senegalvirus marseillevirus (heute Marseillevirus senegalense) aufgenommen. Ein anderes Mitglied dieser Familie wurde bei Blutspendern isoliert: „Giant Blood Marseillevirus“ („GBM-Virus“, wäre aufgrund phylogenetischer Analysen ebenfalls in die Gattung Marseillevirus zu stellen).[7] Auch über ein Isolat von Insekten – das „Insectomime Virus“ – wurde berichtet.[15][16][14] Als weiteres Mitglied der Familie wurde „Kurlavirus“ (KUV) BKC-1[17][18][19] vorgeschlagen.
Die Systematik der vom ICTV mit Stand 30. April 2024 anerkannten Taxa ist folgende:[20][21]
Insgesamt wird die Familie Marseilleviridae heute per Vorschlag in die Kladen (bzw. Linien) A bis E unterteilt.[30]
Hier und beim CNRS (2018)[31] sowie bei Andreani etal. (2018),[29] / (2019)[32] finden sich Vorschläge für eine innere Systematik dieser Familie, zusammengefasst etwa:
Die Neuzugänge nach Aoki etal. (2019) gegenüber CNRS (2018) sind dabei die mit „Kyotovirus“ (Fundort Uji (Kyōto), Japan), „Hokutovirus“ (Fundort Hokuto, Japan) und „Kashiwazakivirus“ (Fundort Kashiwazaki, Japan) bezeichneten Kandidaten, sowie „Marseillevirus Shanghai“. Das obige Kladogramm wird auch durch die Arbeit von Rolland etal. (2019) unterstützt.[27]
Aus Metagenomanalysen vom Schwarzen RaucherLokis Schloss stammen zwei weitere Kladen, nämlich LCMAC101, LCMAC102, LCMAC103 einerseits und LCMAC202, LCMAC202 andrerseits. Die zweite dieser Kladen scheint aber basaler zu stehen als die erste, die genaue Stellung im Kladogramm im Verhältnis zur obigen Klade E ist jedoch nicht geklärt.[40]
Üner halophile Vertreter der Marseilleviridae berichteten zur Jahreswende 2012/2013 Mondher Boughalmi, Didier Raoult, Bernard La Scola und Kollegen. Die Viren mit den Bezeichnungen Seb1sol, Seb2 (alias Seb2sol) und Seb6 (alias Seb6sol) aus dem Boden und Seb1eau aus dem Wasser der Sebkha Séjoumi (Tunesien) konnten im Labor mit dem Wirt Acanthamoeba polyphagakultiviert werden, und sind damit rare Beispiele für eujaryotischeHaloviren.[41][25]
„Tunisvirus Fountaine2“ ist ein weiterer vorgeschlagener Vertreter der Marseilleviridae, über den in dieser Arbeit berichtet wurde. Sein Habitat ist jedoch keine hypersaline, sondern eine Süßwasser-Umgebung. Fountaine2 wurde aus einem Zierbrunnen (englischdecorative fountain) in Tunis (möglicherweise an der Cité des Sciences/Science City, arabischمدينة العلوم بتونس).[41][25][26]
Eine Promotorsequenz – AAATATTT – wurde in Verbindung mit 55% der in Marseillevirus identifizierten Gene gefunden. Die meisten dieser Sequenzen kommen in mehreren Kopien vor.[42]
Das Genom von Marseillevirus marseillevirusStrain T19 hat eine Länge von 368.454bp und kodiert vorhergesagt 428 Proteine bei einem GC-Gehalt von 45%.[43]
Das Genom von Tunisvirus fontaine2 hat eine Länge von 380.011bp und kodiert vorhergesagt 484 Proteine bei einem GC-Gehalt von 43%.[43]
Das Genom von Melbournevirus hat eine Länge von 369.360bp und kodiert vorhergesagt 403 Proteine bei einem GC-Gehalt von 45%.[43]
Das Genom von Lausannevirus hat eine Länge von 346.754bp und kodiert vorhergesagt 444 Proteine bei einem GC-Gehalt von 43%.[43]
Ana Cláudia dos S.P. Andrade, Thalita S. Arantes, Rodrigo A.L. Rodrigues, Talita B. Machado, Fábio P. Dornas, Melissa F. Landell, Cinthia Furst, Luiz G..A. Borges, Lara A..L. Dutra, Gabriel Almeida, Giliane de S. Trindade, Ivan Bergier, Walter Abrahão, Iara A. Borges, Juliana R. Cortines, Danilo B. de Oliveira, Erna G. Kroon, Jônatas S. Abrahão: Ubiquitous giants: a plethora of giant viruses found in Brazil and Antarctica. In: Virology Journal, Band 15, Nr.22, 24. Januar 2018; doi:10.1186/s12985-018-0930-x.
PhilippeColson,IsabellePagnier,NiyazYoosuf,GhislainFournous,BernardLa Scola,DidierRaoult:'Marseilleviridae', a new family of giant viruses infecting amoebae. In: Archives of Virology. 158. Jahrgang, Nr.4, 2012, S.915–20, doi:10.1007/s00705-012-1537-y, PMID 23188494 (englisch).
SarahAherfi,PhilippeColson,GillesAudoly,ClaudeNappez,LucXerri,AudreyValensi,MatthieuMillion,HubertLepidi,RegisCostello,DidierRaoult:Marseillevirus in lymphoma: A giant in the lymph node. In: The Lancet Infectious Diseases. 16. Jahrgang, Nr.10, 2016, S.e225–e234, doi:10.1016/S1473-3099(16)30051-2, PMID 27502174 (englisch).
Albert
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FumitoMaruyama,ShokoUeki:Evolution and Phylogeny of Large DNA Viruses, Mimiviridae and Phycodnaviridae Including Newly Characterized Heterosigma akashiwo Virus. In: Frontiers in Microbiology. 7. Jahrgang, 2016, S.1942, doi:10.3389/fmicb.2016.01942, PMID 27965659, PMC5127864 (freier Volltext) – (englisch, researchgate.net).
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Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Cherif Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Santos Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fábio Dornas, Jacques Yaacoub Bou Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jônatas Abrahão, Bernard La Scola: Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere. In: Viruses, Band 11, Nr.&nbdp;4, März/April 2019, pii: E312, doi:10.3390/v11040312, PMC6520786 (freier Volltext), PMID 30935049 (englisch). Siehe u.a. Fig.2a
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Keita Aoki, Reika Hagiwara, Motohiro Akashi, Kenta Sasaki, Kazuyoshi Murata, Hiroyuki Ogata, Masaharu Takemura: Fifteen Marseilleviruses Newly Isolated From Three Water Samples in Japan Reveal Local Diversity of Marseilleviridae. In: Front. Microbiol., 24. Mai 2019, doi:10.3389/fmicb.2019.01152
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