Babo war der Sohn des kurtrierischen Hauptmannes Johann Carl Babo und dessen Ehefrau Maria Anna Sittmann. Nach seinem Schulbesuch studierte Babo in Koblenz am Jesuitenkolleg Ästhetik.
Nach seinem erfolgreichen Abschluss 1774 bekam er mit 18 Jahren eine Anstellung als Geheimer Sekretär am Stadttheater in Mannheim. Von 1778 bis 1789 war er Intendant der kurfürstlichen Theatergesellschaft. 1781 ließ er sich in München nieder, wo er vom 13. März 1792 bis 11. September 1810 am Nationaltheater als Intendant tätig war.
1784 beschuldigte Babo in seiner Schrift Ueber Freymaurer den bayerischen Illuminatenorden um Adam Weishaupt, eine Verschwörung gegen den Staat begehen zu wollen, und gab damit einen der ersten Anlässe zum offiziellen Verbot und zur Selbstauflösung des Ordens sowie zur Verfolgung seiner Mitglieder.
1789 erhielt er eine Berufung zum Studiendirektor an die Münchener Militärakademie und hatte dieses Amt bis 1799 inne. 1792 berief man Babo zum Theaterkommissär und sieben Jahre später avancierte er zum kurfürstlichen Bücherzensurrat. 1807 wurde er zum ordentlichen Mitglied der Philologisch-philosophischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften gewählt.
Seine bildkräftigen und bühnenwirksamen Stücke erfuhren zahlreiche Aufführungen. Auch seine Lustspiele, die den Kontrast zwischen biederem Bürgersinn und charakterschwachem Adel thematisieren, erfreuten sich bei seinen Zeitgenossen großer Beliebtheit.
Josef Babo starb 1822 im Alter von 66 Jahren in München.
Die Grabstätte von Josef Babo befindet sich auf dem Alten Südlichen Friedhof in München (Gräberfeld 24 – Reihe 1 – Platz 4) Standort48.12706666666711.564755555556.[1][2]
Arno. Ein militärisches Drama in zween Aufzügen. Frankfurt und Leipzig 1776. (Digitalisat), Wien 1777 (Digitalisat)
Das Lustlager. Ein Schauspiel in einer Handlung. beym Logenmeister, Wien 1778 (mutmaßlicher Verfasser). (Digitalisat)
Das Winterquartier in Amerika. Ein Schauspiel in einem Aufzug. beym Logenmeister, Wien 1778. (Digitalisat)
Dagobert der Franken König. Ein Trauerspiel in fünf Aufzügen. München 1792. (Digitalisat.) Englische Ausgabe: Dagobert, King of the Franks, 1800
Armida und Rinaldo. Ein nach Tasso frey bearbeitetes Melo-Drama in vier Aufzügen mit Chören und Tänzen untermischt. Wallishauser, Wien 1793. (Digitalisat)
Die Römer in Teutschland. Ein dramatisches Heldengedicht in fünf Akten. Gegel, Frankenthal 1780. (Digitalisat)
Otto von Wittelsbach. Ein Trauerspiel in fünf Akten. Hoffmann, Stuttgart 1869. (Digitalisat)
Die Maler. Ein Lustspiel. Strobl, München 1783. (Digitalisat)
Die Fräulein Wohlerzogen. Ein Lustspiel in drei Aufzügen. Ein Sittengemälde aus München. Strobl, München 1783. (Digitalisat)
Ueber Freymaurer. Erste Warnung. Hartl, München 1784. (Digitalisat)
Nöthige Beylage zur Schrift: Über die Freymaurer „erste Warnung“, 1783.
Gemälde aus dem Leben der Menschen. Strobl, München 1784. (Digitalisat)
Vollständiges Tagebuch der merkwürdigsten Begebenheiten und Revolutionen in Paris. 1789. (Aus dem Französischen) (Digitalisat)
Die Strelitzen, 1790
Bürgerglück. Lustspiel in dei Aufzügen. Wallishauser, Wien 1792 (Digitalisat), (Digitalisat)
Anleitung zur Himmelskunde in leichtfaßlichen astronomischen Unterhaltungen, 1793 (Digitalisat)
Neue Schauspiele. Unger, Berlin 1804. (Digitalisat)
Der Puls. Ein Lustspiel in zwey Aufzügen. 1805. (Digitalisat)
Albrechts Rache für Agnes. Ein historisches Schauspiel in vier Aufzügen. Fortsetzung der Agnes Bernauer. Wallishausser, Wien 1808. (Digitalisat)
Julia Bohnengel, Alexander Košenina (Hrsg.): Joseph Marius von Babo (1756–1822). Dramatiker in Mannheim und München. Mit einem Lexikon der Theaterstücke. Wehrhahn Verlag, Hannover 2023, ISBN 978-3-86525-977-6
Jürgen Wurst: Joseph Marius Babo. In: Jürgen Wurst, Alexander Langheiter (Hrsg.): Monachia. Städtische Galerie im Lenbachhaus, München 2005, ISBN 3-88645-156-9, S. 163.
Peter Höyng: Die Sterne, die Zensur und das Vaterland. Geschichte und Theater im späten 18. Jahrhundert. Köln u.a. 2003.
Silvia Wimmer: Die bayerisch-patriotischen Geschichtsdramen. Ein Beitrag zur Geschichte der Literatur, der Zensur und des politischen Bewusstseins unter Kurfürst Karl Theodor. München 1999.
Wilhelm Trappl: Joseph Marius Babo (1756–1822). Sein literarisches Schaffen und seine Stellung in der Zeit. Phil. Diss. Univ. Wien 1970.