Er war das älteste von fünf Kindern eines Perlenstickers und Bürgers von Lüneburg. Sein um 1634 verstorbener Bruder Anton wurde 1604 Kantor der St.-Michaelis-Kirche in Lüneburg, in der Nachfolge von Christian Praetorius.
1601 veröffentlicht er in Rostock seine Geistlicher Psalmen D.M.L. und anderer Gottseliger Menner etc., eine Sammlung mit vierstimmigen Psalmen (Digitalisat)
1601 Musica αυτοσχεδικη; Digitalisat – sowie daraus für den praktischen Musikunterricht abgekoppelt Musicae practicae sive artis caneni ratio (Digitalisat)
1605 zu Rostock Χριστὸς πεφασμένος, der geoffenbarte Christus, Comödia (Digitalisat).
1606 veröffentlicht er seine Musica poetica, in der er seine musikalisch-rhetorische Figurenlehre ausführte (Digitalisat).
1609 ist er Herausgeber der Musica Mathematica von Heinrich Brucaeus (1530–1593) unter dem Titel Musica theorica (Digitalisat). Er sucht sich an Brucaeus Werk anlehnend nach neuen rhetorischen Figuren in der Musik.
Joachim Burmeister: Musica poetica (1606). Augmentée des plus excellentes remarques tirées de Hypomnematum musicae poeticae (1599) et de Musica autoschédiastikè (1601). Einleitung, lateinischer text und französische Übersetzung, Lexicon von Agathe Sueur und Pascal Dubreuil. Mardaga, Wavre 2007, ISBN 978-2-87009-965-0, Übersicht. books.google.fr
Joachim Burmeister: Poétique musicale. Suivi d’un traité inédit De la musique de David Chytraeus. Französische Übersetzung, Einleitung, Lexicon von Agathe Sueur und Pascal Dubreuil. Rhuthmos, Paris 2017, ISBN 979-10-95155-17-1.
Martin Ruhnke: Joachim Burmeister. Ein Beitrag zur Musiklehre um 1600 (= Schriften des Landesinstituts für Musikforschung in Kiel. Band 5, ZDB-ID504074-7). Bärenreiter, Kassel u. a. 1955, (Kiel, Universität, Dissertation, 1954, als: Das musiktheoretische Werk des Magisters Joachim Burmeister.).
Agathe Sueur: La grande éloquence musicale: lamprophonie et chalcophonie chez Joachim Burmeister (1564–1629). In: Rhetorica. A Journal of the History of Rhetoric. Band 36, Nummer 2, Spring 2018, S. 132–159, doi:10.1525/rh.2018.36.2.132.