Seidler wurde 1923 in Wien als Sohn eines Textilfabrikanten geboren. 1938 musste seine jüdische Familie unter dem nationalsozialistischen Regime flüchten und emigrierte nach Großbritannien.
Nach Beendigung seiner Studien arbeitete er in Rio de Janeiro bei Oscar Niemeyer. 1948 zog er zu seinen Eltern, die sich zwischenzeitlich in Sydney niedergelassen hatten. 1949 eröffnete er dort sein eigenes Architekturbüro. Seit 1976 war er Gastprofessor an Hochschulen in Australien, in den USA und Europa. 2000 wurde er Honorarprofessor an der University of Sydney.
Sein erstes Bauvorhaben, ein Haus für seine Eltern, das 1948 bis 1950 entstandene Rose Seidler House in den nördlichen Vororten von Sydney, erregte seinerzeit die Gemüter. Heute ist das Gebäude inklusive der Originalmöblierung ein Museum im Besitz der Stiftung für historische Häuser von New South Wales.
Seidlers Lebenswerk umfasst viele bedeutende Gebäude in Australien, vornehmlich in seiner Wahlheimatstadt Sydney. Auch in Mexiko und in späteren Jahren in seinem Geburtsland Österreich, wo er in Wien 1993 den Wohnpark Neue Donau und 2002 das Hochhaus Neue Donau realisierte, hat er seine architektonischen Spuren hinterlassen.
Seidler war als Architekt bis zu einem Schlaganfall im April 2005 tätig. Er starb 82-jährig in seinem Haus in Killara im Norden von Sydney. Er hinterließ seine Frau Penelope, die er 1959 geheiratet hatte, sowie den Sohn Timothy und die Tochter Polly.
1951, 1967, 1981, 1983, 1991: Sir John Sulman Medal
Internment: The Diaries of Harry Seidler May 1940-October 1941. Hg. Janis Wilton, Übers. aus dem Deutschen: Judith Winternitz. Unwin Hyman, Sydney 1987, ISBN 0868619159
The Grand Tour. Reise um die Welt mit dem Blick des Architekten. Taschen Verlag 2004, ISBN 3822838713
Peter Blake: Architecture for the New World: The Work of Harry Seidler, Sydney 1973, ISBN 3-7828-1459-2
Peter Blake: Harry Seidler – Australian Embassy Paris. Ambassade d'Australie, Paris, Sydney 1979, ISBN 3-7828-1443-6
Philip Drew: Two Towers. Harry Seidler, Australia Square, MLC-Center, 1980, ISBN 3-7828-1457-6
Kenneth Frampton, Philip Drew: Harry Seidler: Four Decades of Architecture, Thames & H. 1992, ISBN 0-500-97838-7
Stephen Dobney: Harry Seidler: Selected and Current Works, Images Publishing 1997, ISBN 1-875498-75-3
Dennis Sharp: Harry Seidler: The Master Architect Series III, Images Publishing 1997, ISBN 1-875498-75-3
Alice Spigelman: The Life of Harry Seidler, Brandl & Schlesinger 2001, ISBN 1-876040-15-7
Wolfgang Förster: Harry Seidler, Wohnpark Neue Donau Wien, Prestel 2002, ISBN 3-7913-2703-8
Seidler, Harry, in: Werner Röder; Herbert A. Strauss (Hrsg.): International Biographical Dictionary of Central European Emigrés 1933–1945. Band 2,2. München: Saur, 1983, S. 1070f.