Nach der Promotion 1944 unter dem Titel Österreich-Ungarns Werben um Serbien 1879–1881 in Graz lehrte er dort von 1969 bis 1986 als Universitätsprofessor. Von 1971 bis 1987 war er Mitglied der Historischen Landeskommission für Steiermark.
- Erzherzog Johann als Vermittler zwischen Kroatien und Ungarn im Jahre 1848. Graz 1972, OCLC 74634617.
- als Herausgeber: Gedanken über Staat und Revolution. Das Tagebuch des Grafen Ferdinand Egger aus dem Jahre 1848. Graz 1976, OCLC 5674742.
- Die österreichisch-ungarische Herrschaft in Bosnien und der Hercegovina 1878–1918. Wirtschaftspolitik und Wirtschaftsentwicklung. Graz 1983, OCLC 74634617.
- als Herausgeber: Die türkische Wiedereroberung von Belgrad 1739. Die Reichsgeschichte Mehmed Subhi's 1738–1740. Aus dem Steiermärkischen Landesarchiv, Graz. Graz 1987, OCLC 895075157.
- Hermann Wiesflecker: Nachruf Ferdinand Hauptmann. In: Almanach der Österreichischen Akademie der Wissenschaften 138 (1987/88), S. 477–482, ISSN 0378-8644.
- Othmar Pickl: Ferdinand Hauptmann †. In: Othmar Pickl (Hg.), Robert F. Hausmann (Red.), XXII. Bericht der Historischen Landeskommission für Steiermark über die 16. Geschäftsperiode 1982–1986 (Graz 1988), S. 23–25, ZDB-ID 565651-5.
- Fritz Fellner/Doris A. Corradini (Hgg.): Österreichische Geschichtswissenschaft im 20. Jahrhundert. Ein biographisch-bibliographisches Lexikon. Weimar 2006, S. 171, ISBN 3-205-77476-0.
- Walter Höflechner: Das Fach „Geschichte“ an der Philosophischen resp. Geisteswissenschaftlichen Fakultät der Universität Graz. Vertretung und Institution. Von den Anfängen bis zur Gegenwart. Mit Bemerkungen zu Wien und Prag. Graz 2015, S. 527–529, ISBN 978-3-201-02001-5.
- Alois Kernbauer: Das historiographische Werk Grazer Historiker. 150 Jahre Institut für Geschichte an der Universität Graz. Graz 2015, S. 153–156, ISBN 978-3-201-02001-5.
- Markus Leideck: Ferdinand Hauptmann – Retter von Archivgut in Istrien und Rijeka. In: Jahrbuch des Steiermärkischen Landesarchivs 2 (2019), S. 269–277, ZDB-ID 2953156-1.
Lehrstuhlinhaber für Geschichte an der Universität Graz