Fabian wuchs im US-Bundesstaat Pennsylvania auf. Er absolvierte die Cedar Cliff High School in Camp Hill, besuchte die Penn State University und erhielt seinen Bachelor in Schauspiel.[1] Daraufhin zog er in den 1980er Jahren nach Kalifornien, wo er den Master-Abschluss an der California State University, Long Beach erlangte.
Fabians Theaterarbeiten in New York umfassen The Food Chain von Nicky Silver und Humpty Dumpty von Eric Bogosian, auf nationaler Tour spielte er in Six Degrees of Separation und in Los Angeles spielte er Diva von Howard Gould und Dinner With Friends von Donald Margulies.
Fabian gab sein Fernsehdebüt 1992 in einer Folge der Serie Mord ohne Spuren. Es folgten Gastrollen in verschiedenen Fernsehserien. Darunter waren auch einige wiederkehrende Rollen, unter anderem in Veronica Mars, Big Love, Die himmlische Joan und California High School. Im Jahr 2011 hatte Fabian bei dem Film Der letzte Exorzismus die Hauptrolle des Reverend Cotton Marcus inne. Für diese Darstellung erhielt er mehrere Auszeichnungen. Von 2015 bis 2022 war er als Howard Hamlin in der AMC-Fernsehserie Better Call Saul zu sehen.
Patrick Fabian ist verheiratet mit der Drehbuchautorin und Schauspielerin Mandy Steckelberg. Die beiden haben zwei Töchter und leben in Los Angeles.