El caràcter amfipàtic dels fosfolípids els permet el seu autoassociació a través d'interaccions hidròfobes entre les porcions d'àcid gras de cadena llarga de molècules adjacents de tal forma que els caps polars es projecten fora, cap a l'aigua on poden interaccionar amb les molècules proteiques i la cua apolar es projecta cap a l'interior de la bicapa lipídica.
Els fosfolípids participen com a segons missatgers en la transmissió d'expulsions de gas a l'interior de la cèl·lula com el diacilglicerol o la fosfatidilcolina que activa a la betahidroxibutirat deshidrogenasa que és un enzim mitocondrial.
Components del surfactant pulmonar
El funcionament normal del pulmó requerix de l'aport constant d'un fosfolípid poc comú denominat dipalmitoílfosfatidilcolina. Este fosfolípid tensioactiu és produït per les cèl·lules epitelials del tipus II i impedix l'atelèctasi al final de la fase d'espiració de la respiració.
Els fosfolípids, i sobretot la fosfatidilcolina de la bilis, solubilitzen el colesterol. Una disminució en la producció de fosfolípid i de la seua secreció a la bilis provoca la formació de càlculs biliars de colesterol i pigments biliars.
Síntesi de substàncies de senyalització cel·lular
El fosfatidinol i la fosfatidilcolina actuen com a donadors d'àcid araquidònic per a la síntesi de prostaglandines, tromboxans, leucotriens i compostos relacionats..